Dissecção genômica de um QTL que afeta o perfil lipídico

FUNDO:

A síndrome metabólica é um distúrbio comum que representa um risco significativo de doença cardíaca coronária e mortalidade precoce no hemisfério ocidental. Central para suas complicações cardiovasculares é a associação da síndrome com anormalidades específicas nos perfis plasmáticos de lipídios e lipoproteínas, incluindo triglicerídeos plasmáticos aumentados, colesterol HDL reduzido e predominância de partículas densas de lipoproteínas. Em busca da etiologia genética desse distúrbio lipídico, os pesquisadores identificaram um locus de traço quantitativo (QTL) no cromossomo humano 7q36 fortemente ligado à variação nos níveis de lipídios plasmáticos. Eles hipotetizam que este QTL contém variantes genéticas que contribuem para alterações nas vias biológicas subjacentes à gênese do distúrbio lipídico.

NARRATIVA DO DESENHO:

O estudo buscará a causa genética da síndrome metabólica, um distúrbio lipídico que representa um grande risco de doença cardíaca coronária. Os investigadores identificaram um locus de traço quantitativo (QTL) no cromossomo humano 7q36 fortemente ligado à variação nos níveis de lipídios plasmáticos. Os investigadores levantam a hipótese de que este QTL contém variantes genéticas que contribuem para alterações nas vias biológicas subjacentes à gênese do distúrbio lipídico. Para testar essa hipótese, eles propõem uma abordagem abrangente utilizando recursos e experiência estabelecidos para identificar as variantes de sequência funcional dentro desse QTL. Especificamente, eles irão 1.) identificar polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) e seu haplótipo e estrutura de desequilíbrio de ligação em toda a região QTL; 2.) Analisar a associação de SNPs informativos com níveis plasmáticos de triglicerídeos, níveis de LDL e frações de densidade de lipoproteínas usando análises de ligação/desequilíbrio de componente de variância; e 3.) Identificar variantes de sequência potencialmente funcionais em genes associados ou regiões genômicas usando análise Bayesiana de nucleotídeos de traços quantitativos. Esta aplicação abrangente de tecnologias genômicas recém-disponíveis, novas abordagens estatísticas, DNA e informações fenotípicas disponíveis e o consórcio de especialistas reunidos por trás deste projeto garantirão a elucidação bem-sucedida da etiologia genética desse distúrbio lipídico e, consequentemente, o desenvolvimento de meios eficazes para prevenção e/ou tratamento de complicações cardiovasculares da síndrome metabólica.