Микробное профилирование в карманах, связанных с пациентами с хроническим пародонтитом, с использованием метагеномного секвенирования 16s РНК
Микробное профилирование в карманах, связанных с пациентами с хроническим пародонтитом в популяции ОАЭ, с использованием метагеномного секвенирования 16s РНК
Обзор исследования
Статус
Статус
Условия
Условия
Вмешательство/лечение
Вмешательство/лечение
Подробное описание
Собранные образцы зубного налета были затем подготовлены для выделения ДНК с использованием ABIOpure TM Total DNA (версия 2.0) (кат. №: M501DP100) в соответствии с инструкциями производителя. Все образцы были оценены на предмет количественного определения ДНК с использованием спектрофотометрии, а затем количественно с использованием флуорометрического метода. Это было выполнено с помощью DeNovix DS-11 FX (DeNovix). В дополнение к количественному определению ДНК оценка целостности ДНК была разрешена на 0,8% агарозном геле с бромистым этидием. Для подготовки библиотеки NGS все образцы подвергали ПЦР-амплификации гена 16S рРНК в выделенной бактериальной ДНК. Используемые праймеры были нацелены на область V3-V4 гена 16S рРНК. Полноразмерные последовательности праймеров с использованием стандартной номенклатуры нуклеотидов IUPAC в соответствии с протоколом, нацеленным на эту область:
16SAmpliconPCRForwardPrimer=5' TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGCCTACGGGNGGCWGCAG 16SAmpliconPCRReversePrimer=5' GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGGACTACHVGGGTATCTAATCC Метод гель-электрофореза использовался для выбора размера, а конвейер биоинформатики, используемый для обработки данных последовательности микробиома 16S, был QII
Тип исследования
Тип исследования
Регистрация (Действительный)
Регистрация
Фаза
Фаза
- Непригодный
Контакты и местонахождение
Места учебы
-
-
-
Ajman, Объединенные Арабские Эмираты, 009716
- Ajman University of Science and Technology
-
-
Критерии участия
Критерии приемлемости
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
Принимает здоровых добровольцев
Полы, имеющие право на обучение
Описание
Критерии включения:
- У пациентов, включенных в исследование, был диагностирован генерализованный пародонтит II стадии.
- По состоянию здоровья
Критерий исключения:
- Пациенты с гингивитом или пародонтитом III стадии
- Медицински непригодный
Учебный план
Как устроено исследование?
Детали дизайна
- Основная цель: Исследования в области здравоохранения
- Распределение: Рандомизированный
- Интервенционная модель: Одногрупповое задание
- Маскировка: Одинокий
Количество рук
Оружие и интервенции
Группа участников / АрмияГруппа участников / Армия |
Вмешательство/лечениеВмешательство/лечение |
|---|---|
|
Экспериментальный: Пародонтит, Взрослый
Образцы зубного налета были взяты из поддесневого кармана и отправлены в лабораторию для метагеномного анализа.
|
Поддесневой налет собирали с помощью стерильной кюретки со щечной стороны моляров верхней челюсти и с язычной стороны резцов нижней челюсти во флакон, содержащий 200 мкл буфера CL.
Другие имена:
|
|
Экспериментальный: Метгеномный анализ
Анализ общего количества бактерий
|
Поддесневой налет собирали с помощью стерильной кюретки со щечной стороны моляров верхней челюсти и с язычной стороны резцов нижней челюсти во флакон, содержащий 200 мкл буфера CL.
Другие имена:
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Микробный таксономический состав
Временное ограничение: От исходного уровня до 3 месяцев
|
Состав был определен с использованием образцов поддесневого зубного налета и проведения метагеномного секвенирования 16s.
|
От исходного уровня до 3 месяцев
|
Соавторы и исследователи
Спонсор
Спонсор
Следователи
Следователи
- Главный следователь: Sudhir Varma, MDS, Assistant Professor
Даты записи исследования
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
Начало исследования
Первичное завершение (Действительный)
Первичное завершение
Завершение исследования (Действительный)
Завершение исследования
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
Первый отправленный
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Первый опубликованный (Действительный)
Первый опубликованный
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
Последнее опубликованное обновление
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последняя проверка
Последняя проверка
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
Другие идентификационные номера исследования
- F-H-17-11-03
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
Описание плана IPD
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .