Эта страница была переведена автоматически, точность перевода не гарантируется. Пожалуйста, обратитесь к английской версии для исходного текста.

Микробное профилирование в карманах, связанных с пациентами с хроническим пародонтитом, с использованием метагеномного секвенирования 16s РНК

9 июня 2020 г. обновлено: sudhir rama varma, Ajman University

Микробное профилирование в карманах, связанных с пациентами с хроническим пародонтитом в популяции ОАЭ, с использованием метагеномного секвенирования 16s РНК

Исследование было разработано в соответствии с Хельсинкской декларацией о медицинских исследованиях с участием Комитета по этике Аджманского университета (2017-A-DN-04). Перед включением в исследование было получено информированное согласие от всех участников. Участники были системно здоровы и не принимали антибиотики в течение последних трех месяцев. Пациенты, набранные для исследования, были диагностированы как генерализованный пародонтит II стадии в соответствии с классификацией Всемирного семинара 2017 года по «классификации пародонтальных и периимплантатных заболеваний и состояний». Был включен пародонтальный статус, указывающий на тяжесть клинической потери межзубного прикрепления на 3–4 мм, рентгенографическую потерю кости на 15–33% и без потери зубов. В исследование были включены сложные пародонтиты с максимальной глубиной зондирования ≤ 5 мм с горизонтальной потерей кости и имеющие степень и распределение с вовлечением > 30% зубов. В общей сложности было собрано 80 образцов бляшек с клиническими характеристиками пациента в возрасте от 25 до 39 лет, 36 женщин и 44 мужчины. Поддесневой налет собирали с помощью стерильной кюретки со щечной стороны моляров верхней челюсти и с язычной стороны резцов нижней челюсти во флакон, содержащий 200 мкл буфера CL.

Обзор исследования

Статус

Завершенный

Подробное описание

Собранные образцы зубного налета были затем подготовлены для выделения ДНК с использованием ABIOpure TM Total DNA (версия 2.0) (кат. №: M501DP100) в соответствии с инструкциями производителя. Все образцы были оценены на предмет количественного определения ДНК с использованием спектрофотометрии, а затем количественно с использованием флуорометрического метода. Это было выполнено с помощью DeNovix DS-11 FX (DeNovix). В дополнение к количественному определению ДНК оценка целостности ДНК была разрешена на 0,8% агарозном геле с бромистым этидием. Для подготовки библиотеки NGS все образцы подвергали ПЦР-амплификации гена 16S рРНК в выделенной бактериальной ДНК. Используемые праймеры были нацелены на область V3-V4 гена 16S рРНК. Полноразмерные последовательности праймеров с использованием стандартной номенклатуры нуклеотидов IUPAC в соответствии с протоколом, нацеленным на эту область:

16SAmpliconPCRForwardPrimer=5' TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGCCTACGGGNGGCWGCAG 16SAmpliconPCRReversePrimer=5' GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGGACTACHVGGGTATCTAATCC Метод гель-электрофореза использовался для выбора размера, а конвейер биоинформатики, используемый для обработки данных последовательности микробиома 16S, был QII

Тип исследования

Интервенционный

Регистрация (Действительный)

80

Фаза

  • Непригодный

Контакты и местонахождение

В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.

Места учебы

Критерии участия

Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.

Критерии приемлемости

Возраст, подходящий для обучения

От 14 лет до 56 лет (Взрослый)

Принимает здоровых добровольцев

Нет

Полы, имеющие право на обучение

Все

Описание

Критерии включения:

  • У пациентов, включенных в исследование, был диагностирован генерализованный пародонтит II стадии.
  • По состоянию здоровья

Критерий исключения:

  • Пациенты с гингивитом или пародонтитом III стадии
  • Медицински непригодный

Учебный план

В этом разделе представлена ​​подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.

Как устроено исследование?

Детали дизайна

  • Основная цель: Исследования в области здравоохранения
  • Распределение: Рандомизированный
  • Интервенционная модель: Одногрупповое задание
  • Маскировка: Одинокий

Оружие и интервенции

Группа участников / Армия
Вмешательство/лечение
Экспериментальный: Пародонтит, Взрослый
Образцы зубного налета были взяты из поддесневого кармана и отправлены в лабораторию для метагеномного анализа.
Поддесневой налет собирали с помощью стерильной кюретки со щечной стороны моляров верхней челюсти и с язычной стороны резцов нижней челюсти во флакон, содержащий 200 мкл буфера CL.
Другие имена:
  • Выделение ДНК
Экспериментальный: Метгеномный анализ
Анализ общего количества бактерий
Поддесневой налет собирали с помощью стерильной кюретки со щечной стороны моляров верхней челюсти и с язычной стороны резцов нижней челюсти во флакон, содержащий 200 мкл буфера CL.
Другие имена:
  • Выделение ДНК

Что измеряет исследование?

Первичные показатели результатов

Мера результата
Мера Описание
Временное ограничение
Микробный таксономический состав
Временное ограничение: От исходного уровня до 3 месяцев
Состав был определен с использованием образцов поддесневого зубного налета и проведения метагеномного секвенирования 16s.
От исходного уровня до 3 месяцев

Соавторы и исследователи

Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.

Спонсор

Следователи

  • Главный следователь: Sudhir Varma, MDS, Assistant Professor

Даты записи исследования

Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.

Изучение основных дат

Начало исследования (Действительный)

10 ноября 2017 г.

Первичное завершение (Действительный)

15 сентября 2018 г.

Завершение исследования (Действительный)

7 октября 2019 г.

Даты регистрации исследования

Первый отправленный

7 июня 2020 г.

Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества

9 июня 2020 г.

Первый опубликованный (Действительный)

11 июня 2020 г.

Обновления учебных записей

Последнее опубликованное обновление (Действительный)

11 июня 2020 г.

Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества

9 июня 2020 г.

Последняя проверка

1 июня 2020 г.

Дополнительная информация

Термины, связанные с этим исследованием

Другие идентификационные номера исследования

  • F-H-17-11-03

Планирование данных отдельных участников (IPD)

Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?

Нет

Описание плана IPD

Микробный таксономический состав

Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы

Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.

Нет

Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.

Нет

Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .

Подписаться