Обнаружение лекарственно-устойчивого ВИЧ-1 на Тайване

Лекарственно-устойчивые штаммы ВИЧ могут развиваться во время антиретровирусной терапии, и документально подтверждена возможность передачи лекарственно-устойчивого вируса. Возникновение резистентности ВИЧ к лекарственным препаратам связано с субоптимальным вирусологическим ответом на антиретровирусную терапию [1]. Вероятность того, что пациент приобретет лекарственно-устойчивый вирус, связана с распространенностью лекарственной устойчивости среди населения с определенным поведением высокого риска. Исследования, проведенные в западных странах, показывают, что распространенность резистентности вируса по крайней мере к одному антиретровирусному препарату колеблется от 6% до 16% у пациентов, ранее не получавших лечения, и среди них от 3% до 5% со сниженной восприимчивостью более чем к одному классу. [2-4]. Однако в настоящее время нет данных о распространенности лекарственной устойчивости среди различных групп населения Тайваня.

Лекарственная устойчивость может быть измерена с использованием либо генотипических, либо фенотипических анализов устойчивости. Генотипические анализы выявляют мутации, вызывающие устойчивость к рыгу; фенотипические анализы - это анализы на чувствительность к лекарственным средствам, которые измеряют способность вируса расти in vitro в присутствии серийных разведений ингибиторов (то есть антиретровирусных препаратов). Из-за более быстрого времени выполнения и меньшей стоимости генотипический анализ обычно предпочтительнее фенотипического анализа [5]. Анализ генотипической резистентности доступен в трех центрах СПИДа на Тайване. Однако методы, используемые для генотипического анализа, различаются в трех центрах, и эти данные не были собраны и проанализированы для изучения эпидемиологии устойчивости к ВИЧ на Тайване, поэтому интерпретация и применение результатов генотипического анализа устойчивости для выбора антиретровирусных препаратов весьма сомнительны в Тайване.

Кроме того, хотя генотипический анализ менее прост, существует несколько условий, вызывающих несоответствие между генотипом и фенотипом, и это несоответствие может привести к трудностям в предсказании фенотипа по генотипу [6]. Таким образом, фенотипический анализ может помочь в интерпретации результатов тестирования на резистентность и предоставить руководство для выбора оптимального режима. С появлением новых классов антиретровирусных препаратов в ближайшем будущем коммерчески доступных в настоящее время фенотипических тестов с использованием рекомбинантных вирусов со вставкой последовательностей генов обратной транскриптазы и протеазы может быть недостаточно. Потребуется новый фенотипический анализ, который может измерять способность вируса расти в различных концентрациях НИОТ, ННИОТ, ИП, ингибиторов проникновения, ингибиторов CCR5 и ингибиторов интегразы.

Известно, что количество ВИЧ-1 в плазме сильно коррелирует с прогрессированием заболевания, реакцией на противовирусное лечение и передачей от матери к ребенку. Вирусная РНК плазмы более репрезентативна для реплицирующегося вирусного пула в любой момент времени, чем ассоциированная с клеткой провирусная ДНК. Чтобы изучить взаимосвязь полного генома ВИЧ-1 с фенотипической устойчивостью, мы решили сосредоточиться на вирионах плазмы. Однако для тех пациентов, чья вирусная нагрузка в плазме недостаточно высока для проведения этого анализа, вместо использования провирусной ДНК пациентов из инфицированных РВМС мы будем использовать для анализа фенотипической резистентности. Для амплификации вирусного генома будут использоваться две стратегии. Первым будет амплификация почти полного вирусного генома. Если эта стратегия не сработает, второй стратегией будет амплификация двух фрагментов вирусного генома и сборка этих двух фрагментов уникальными ферментами рестрикции.