Påvisning av medikamentresistent HIV-1 i Taiwan

Legemiddelresistente HIV-stammer kan utvikles under antiretroviral behandling, og overføring av legemiddelresistent virus er dokumentert å være mulig. Fremveksten av medikamentresistens i HIV har vært assosiert med suboptimal virologisk respons på antiretroviral terapi [1]. Sannsynligheten for at en pasient får medikamentresistent virus er relatert til utbredelsen av medikamentresistens i befolkningen med spesifikk høyrisikoatferd. I de vestlige landene tyder studier på at prevalensen av viral resistens mot minst ett antiretroviralt legemiddel varierer fra 6 % til 16 % hos behandlingsnaive pasienter, og blant dem ca. 3 % til 5 % med redusert mottakelighet for mer enn én klasse [2-4]. Imidlertid er det ingen data som tar for seg utbredelsen av medikamentresistens i ulike populasjoner i Taiwan for tiden.

Legemiddelresistens kan måles ved å bruke enten genotypiske eller fenotypiske resistensanalyser. Genotypiske analyser oppdager mutasjoner som forårsaker gravemotstand; fenotypiske analyser er medikamentfølsomhetsanalyser som måler in vitro-evnen til viruset til å vokse i nærvær av seriefortynninger av inhibitorene (det vil si antiretrovirale legemidler). På grunn av sin raskere behandlingstid og mindre kostbar, er en genotypisk analyse generelt foretrukket fremfor fenotypisk analyse [5]. Genotypisk resistensanalyse har vært tilgjengelig i tre AIDS-sentre i Taiwan. Metodene som brukes for genotypisk analyse er imidlertid forskjellige i de tre sentrene, og disse dataene har ikke blitt samlet inn og analysert for å kjenne epidemiologien til HIV-resistens i Taiwan, og dermed tolkningen og anvendelsen av resultatene fra genotypisk resistensanalyse for seleksjon av antiretrovirale midler er ganske tvilsomme i Taiwan.

Videre, selv om den genotypiske analysen er mindre enkel, eksisterer det flere forhold for å forårsake uoverensstemmelsen mellom genotype og fenotype, og uoverensstemmelsen kan resultere i vanskeligheten med fenotypeprediksjon fra genotype [6]. Dermed kan fenotypisk analyse hjelpe til med tolkning av resistenstestresultater og gi en veiledning for å bestemme det optimale regimet. Med tilgjengeligheten av nyere klasser av antiretrovirale midler i nær fremtid, kan det hende at kommersielt tilgjengelige fenotypiske tester ved bruk av rekombinante virus med innsetting av revers transkriptase og proteasegensekvenser ikke er nok. En ny fenotypisk analyse som kan måle virusets evne til å vokse i de ulike konsentrasjonene av NRTI, NNRTI, PI, entry-hemmere, CCR5-hemmere og integrase-hemmere vil være nødvendig.

Det har vært kjent at HIV-1-belastning i plasma er sterkt korrelert med sykdomsprogresjon, respons på antiviral behandling og overføring fra mor til barn. Det virale plasma-RNA er mer representativt for den replikerende viruspoolen på et hvilket som helst tidspunkt enn det celleassosierte provirale DNA. For å studere forholdet mellom det komplette HIV-1-genomet og fenotypisk resistens, velger vi å fokusere på plasmavirioner. Men for de pasientene hvis plasmavirusmengde ikke er høy nok til å utføre denne analysen, vil vi i stedet for å bruke pasientenes provirale DNA fra infiserte PBMC for fenotypisk resistensanalyse. To strategier vil bli brukt for å forsterke viralt genom. Den første vil være amplifisering av et viralt genom i nesten full lengde. Hvis denne strategien ikke fungerer, vil den andre strategien være å forsterke to fragmenter av viralt genom og å sette sammen disse to fragmentene ved hjelp av unike restriksjonsenzymer.