De detectie van medicijnresistente HIV-1 in Taiwan

Geneesmiddelresistente HIV-stammen kunnen zich ontwikkelen tijdens antiretrovirale therapie en het is gedocumenteerd dat overdracht van geneesmiddelresistent virus mogelijk is. De opkomst van geneesmiddelresistentie bij hiv is in verband gebracht met een suboptimale virologische respons op antiretrovirale therapie [1]. De waarschijnlijkheid dat een patiënt een geneesmiddelresistent virus krijgt, hangt samen met de prevalentie van geneesmiddelresistentie in de populatie met specifiek risicovol gedrag. In de westerse landen suggereren studies dat de prevalentie van virale resistentie tegen ten minste één antiretroviraal geneesmiddel varieert van 6% tot 16% bij niet eerder behandelde patiënten, en onder hen ongeveer 3% tot 5% met verminderde gevoeligheid voor meer dan één klasse [2-4]. Er zijn momenteel echter geen gegevens over de prevalentie van resistentie tegen geneesmiddelen in verschillende populaties in Taiwan.

Geneesmiddelresistentie kan worden gemeten met behulp van genotypische of fenotypische resistentietesten. Genotypische assays detecteren mutaties die dug-resistentie veroorzaken; fenotypische assays zijn gevoeligheidstesten voor geneesmiddelen die het in vitro vermogen meten van het virus om te groeien in de aanwezigheid van seriële verdunningen van de remmers (dat wil zeggen antiretrovirale geneesmiddelen). Vanwege de snellere doorlooptijd en lagere kosten heeft een genotypische assay over het algemeen de voorkeur boven een fenotypische assay [5]. Genotypische resistentietest is beschikbaar in drie aids-centra in Taiwan. De methoden die worden gebruikt voor de genotypische test zijn echter verschillend in de drie centra, en deze gegevens zijn niet verzameld en geanalyseerd om de epidemiologie van hiv-resistentie in Taiwan te kennen, dus de interpretatie en toepassing van de resultaten van de genotypische resistentietest voor selectie van antiretrovirale middelen zijn nogal twijfelachtig in Taiwan.

Bovendien, hoewel de genotypische assay minder eenvoudig is, zijn er verschillende omstandigheden die de discordantie tussen genotype en fenotype kunnen veroorzaken, en de discordantie kan ertoe leiden dat fenotypevoorspelling op basis van genotype moeilijk is [6]. Een fenotypische assay kan dus helpen bij de interpretatie van de resultaten van resistentietesten en kan een leidraad zijn voor het bepalen van het optimale regime. Met de beschikbaarheid van nieuwere klassen antiretrovirale middelen in de nabije toekomst, is het mogelijk dat momenteel commercieel verkrijgbare fenotypische testen met behulp van de recombinante virussen met insertie van reverse transcriptase- en protease-gensequenties niet voldoende zijn. Er is een nieuwe fenotypische test nodig die het vermogen van het virus om te groeien in de verschillende concentraties van NRTI's, NNRTI's, PI's, entry-remmers, CCR5-remmers en integraseremmers kan meten.

Het is bekend dat de hoeveelheid HIV-1 in plasma sterk gecorreleerd is met ziekteprogressie, respons op antivirale behandeling en overdracht van moeder op kind. Het plasma-virale RNA is meer representatief voor de replicerende viruspool op elk tijdstip dan het cel-geassocieerde provirale DNA. Om de relatie van het volledige HIV-1-genoom met fenotypische resistentie te bestuderen, kiezen we ervoor om ons te concentreren op plasmavirionen. Echter, voor die patiënten van wie de virale belasting in het plasma niet hoog genoeg is om deze analyse uit te voeren, zullen we in plaats van het provirale DNA van de patiënt uit geïnfecteerde PBMC te gebruiken voor fenotypische resistentieanalyse. Er zullen twee strategieën worden gebruikt om het virale genoom te versterken. De eerste is de amplificatie van een bijna volledig viraal genoom. Als deze strategie niet werkt, zal de tweede strategie zijn om twee fragmenten van het virale genoom te amplificeren en deze twee fragmenten samen te voegen door unieke restrictie-enzymen.