La détection du VIH-1 résistant aux médicaments à Taïwan

Des souches de VIH résistantes aux médicaments peuvent se développer pendant le traitement antirétroviral, et la transmission de virus résistants aux médicaments a été documentée comme étant possible. L'émergence de la résistance aux médicaments dans le VIH a été associée à une réponse virologique sous-optimale au traitement antirétroviral [1]. La probabilité qu'un patient contracte un virus résistant aux médicaments est liée à la prévalence de la résistance aux médicaments dans la population ayant des comportements à haut risque spécifiques. Dans les pays occidentaux, des études suggèrent que la prévalence de la résistance virale à au moins un médicament antirétroviral varie de 6 % à 16 % chez les patients naïfs de traitement, et parmi eux, environ 3 % à 5 % avec une sensibilité réduite à plus d'une classe [2-4]. Cependant, il n'existe actuellement aucune donnée sur la prévalence de la résistance aux médicaments dans diverses populations à Taiwan.

La résistance aux médicaments peut être mesurée à l'aide de tests de résistance génotypique ou phénotypique. Les tests génotypiques détectent les mutations qui provoquent une résistance creusée ; les tests phénotypiques sont des tests de sensibilité aux médicaments qui mesurent la capacité in vitro du virus à se développer en présence de dilutions en série des inhibiteurs (c'est-à-dire des médicaments antirétroviraux). En raison de son délai d'exécution plus rapide et de son coût moindre, un test génotypique est généralement préféré au test phénotypique [5]. Le test de résistance génotypique est disponible dans trois centres de lutte contre le SIDA à Taiwan. Cependant, les méthodes utilisées pour le test génotypique sont différentes dans les trois centres, et ces données n'ont pas été recueillies et analysées pour connaître l'épidémiologie de la résistance du VIH à Taïwan, donc l'interprétation et l'application des résultats du test de résistance génotypique pour la sélection des antirétroviraux. sont assez discutables à Taïwan.

De plus, bien que le test génotypique soit moins simple, plusieurs conditions existent pour provoquer la discordance entre le génotype et le phénotype, et la discordance peut entraîner la difficulté de prédiction du phénotype à partir du génotype [6]. Ainsi, le test phénotypique peut aider à interpréter les résultats des tests de résistance et fournir un guide pour décider du régime optimal. Avec la disponibilité de nouvelles classes d'antirétroviraux dans un proche avenir, les tests phénotypiques actuellement disponibles dans le commerce utilisant les virus recombinants avec insertion de séquences génétiques de la transcriptase inverse et de la protéase pourraient ne pas suffire. Un nouveau test phénotypique capable de mesurer la capacité du virus à se développer dans les différentes concentrations d'INTI, d'INNTI, d'IP, d'inhibiteurs d'entrée, d'inhibiteurs de CCR5 et d'inhibiteurs d'intégrase sera nécessaire.

On sait que la charge de VIH-1 dans le plasma est fortement corrélée à la progression de la maladie, à la réponse au traitement antiviral et à la transmission de la mère à l'enfant. L'ARN viral plasmatique est plus représentatif du pool de virus se répliquant à tout moment que l'ADN proviral associé aux cellules. Afin d'étudier la relation entre le génome complet du VIH-1 et la résistance phénotypique, nous avons choisi de nous concentrer sur les virions plasmatiques. Cependant, pour les patients dont la charge virale plasmatique n'est pas suffisamment élevée pour effectuer cette analyse, nous utiliserons plutôt l'ADN proviral des patients provenant de PBMC infectés pour l'analyse de la résistance phénotypique. Deux stratégies seront utilisées pour amplifier le génome viral. Le premier sera l'amplification d'un génome viral presque complet. Si cette stratégie ne fonctionne pas, la deuxième stratégie sera d'amplifier deux fragments de génome viral et d'assembler ces deux fragments par des enzymes de restriction uniques.