Анализ биомаркеров рака желудочно-кишечного тракта

Недавно был совершен большой скачок в обнаружении соматических мутаций в геномах рака человека. С появлением молекулярно-таргетной терапии соматические мутации привлекли больше внимания исследователей рака. Драйверные мутации дают преимущество в росте клетке, в которой они происходят, причинно вовлечены в развитие рака и, следовательно, были положительно отобраны. Напротив, мутации-пассажиры биологически нейтральны и не дают преимущества в росте. Следовательно, драйверные соматические мутации традиционно являются оптимальной мишенью для раковых клеток. Учитывая растущее количество свидетельств этнических различий в распространении соматических мутаций, мы стремимся исследовать действенные соматические мутации при раке, распространенном в Азии.

Возможность оценки нескольких биомаркеров с использованием образцов FNA может стать прорывом в клинических исследованиях рака желудочно-кишечного тракта. FNA являются минимально инвазивными и, следовательно, более приемлемыми для серийного отбора образцов опухоли. Кроме того, клетки, удаленные этим методом, часто представляют собой относительно чистую популяцию опухолевых клеток и могут быть обработаны в течение нескольких минут после удаления из опухоли; следовательно, протеомные профили образцов FNA, вероятно, очень близко напоминают профили in vivo. Кроме того, опухолевые клетки из мест метастазирования, полученные с помощью FNA, могут обеспечить профиль метастатической опухоли в конкретном месте. Приобретенная резистентность к терапии хорошо известна при различных типах рака.1, 2 Серийное взятие проб опухолевой ткани с помощью FNA предоставит важные ресурсы для мониторинга изменений опухоли в зависимости от времени и терапии.

Имеются многочисленные исследования, сообщающие об обнаружении клеток карциномы в крови пациентов с солидными опухолями. Обнаружение ЦОК (циркулирующих опухолевых клеток) до начала терапии первой линии у пациенток с метастатическим раком молочной железы позволяет прогнозировать выживаемость без прогрессирования и общую выживаемость.3-5 Эти исследования привели к одобрению FDA технологии Vertex CellSearch. Прогностическое значение обнаружения ЦОК до начала терапии поднимает важные вопросы о биологических свойствах этих клеток. ЦОК обнаруживаются при большинстве метастатических заболеваний, и это может отражать статус рецидивирующей опухоли, ищущей альтернативное место для колонизации. Однако не все ЦКО могут успешно образовывать метастатические колонии. Возможность профилировать опухоли в разных метастатических участках вместе с ЦОК может предоставить информацию о подмножестве наиболее надежных ЦОК с самым высоким метастатическим потенциалом. Кроме того, ЦОК могут стать альтернативным источником опухолевых клеток, которые можно использовать для обнаружения опухолевых изменений по мере прогрессирования рака и продолжения или изменения терапии.

Профилирование экспрессии/активации киназ и других молекул пути передачи сигнала вместе с маркерами, критически важными для запуска ангиогенеза, в серийных образцах опухоли и связанных с опухолью тканей предоставит ценную информацию об изменениях, происходящих в опухолевых клетках, в зависимости от времени и методов лечения. Это временное и пространственное профилирование прогрессии опухоли позволит клиницистам отслеживать быстро «развивающиеся» сигнатуры рака у каждого пациента. Временное и местно-специфическое профилирование ЦОК и FNA должно затем использовать высокочувствительный и специфический метод для опроса ограниченного количества раковых клеток в таких образцах. Основываясь на этих результатах, мы планируем разработать геномные клинические испытания для этих типов опухолей.