Biomarköranalys av gastrointestinal cancer

Nyligen har ett stort steg gjorts när det gäller att upptäcka somatiska mutationer i mänskliga cancergenom. Med tillkomsten av molekylärt riktad terapi har somatiska mutationer tilldragit sig mer uppmärksamhet från cancerforskare. Drivermutationer ger tillväxtfördelar för cellen där de förekommer, är kausalt inblandade i cancerutveckling och har därför blivit positivt utvalda. Däremot är passagerarmutationer biologiskt neutrala och ger inte tillväxtfördelar. Därför är somatiska mutationer för drivrutiner konventionellt det optimala målet för cancerceller. Med tanke på de växande bevisen på etnisk skillnad i distribution av somatiska mutationer, strävar vi efter att kartlägga handlingsbara somatiska mutationer i asiatisk utbredd cancer.

Förmågan att bedöma flera biomarkörer med hjälp av FNA-prover skulle kunna ge ett genombrott i kliniska studier av mag-tarmcancer. FNAs är minimalt invasiva och därför mer acceptabla för seriell tumörprovtagning. Vidare representerar cellerna som avlägsnats med denna metod ofta relativt ren tumörcellpopulation och kan bearbetas inom några minuter efter avlägsnande från tumören; därför liknar proteomprofilerna för FNA-prover troligen in vivo-profilerna mycket nära. Dessutom kan tumörceller från metastatiska ställen erhållna med FNA tillhandahålla platsspecifik metastatisk tumörprofil. Förvärvad resistens mot terapier är välkänd i olika cancertyper.1, 2 Seriell provtagning av tumörvävnad med FNA kommer att ge viktiga resurser för att övervaka tumörförändringar som en funktion av tid och terapi.

Det har gjorts många studier som rapporterar upptäckten av karcinomceller i blodet hos patienter med solida tumörer. Detektering av CTC (cirkulerande tumörceller) före start av förstahandsbehandling hos patienter med metastaserad bröstcancer är mycket förutsägande för progressionsfri överlevnad och total överlevnad.3-5 Dessa studier ledde till att FDA godkände vertex CellSearch-teknologin. Den prognostiska implikationen av att upptäcka CTC innan behandlingen påbörjas väcker viktiga frågor om de biologiska egenskaperna hos dessa celler. CTCs finns i de flesta metastaserande sjukdomar och det kan reflektera statusen för den återkommande tumören som letar efter ett alternativt ställe att kolonisera. Men inte alla CTC skulle framgångsrikt etablera metastaserande kolonier. Att ha förmågan att profilera tumörer på olika metastatiska platser tillsammans med CTC kan ge information om undergruppen av de mest robusta CTC med högsta metastaserande potential. Dessutom skulle CTC:er kunna tillhandahålla alternativa källor till tumörceller som kan användas för att upptäcka tumörförändringar när cancern fortskrider och behandlingen fortsätter eller modifieras.

Expressions-/aktiveringsprofileringen av kinaser och andra signaltransduktionsvägmolekyler tillsammans med markörer som är kritiska för att utlösa angiogenes på en seriell provtagning av tumör- och tumörassocierade vävnader kommer att ge värdefull information om förändringar som sker i tumörceller som en funktion av tid och terapier. Denna tidsmässiga och rumsliga profilering av tumörprogression kommer att göra det möjligt för läkare att övervaka snabbt "utvecklande" cancersignaturer hos varje patient. Den tidsmässiga och platsspecifika profileringen av CTC och FNA måste sedan använda mycket känslig och specifik metod för att förhöra begränsad mängd cancerceller i sådana prover. Baserat på dessa resultat planerar vi att utforma genomriktade kliniska prövningar i dessa tumörtyper.