Ruoansulatuskanavan syövän biomarkkerianalyysi

Viime aikoina on saavutettu suuri harppaus somaattisten mutaatioiden löytämisessä ihmisen syöpägenomeista. Molekyylisesti kohdistetun hoidon myötä somaattiset mutaatiot ovat herättäneet enemmän huomiota syöpätutkijoilta. Kuljettajamutaatiot antavat kasvuetua solulle, jossa ne esiintyvät, ovat syy-seuraussuhteessa syövän kehittymiseen ja siksi ne on valittu positiivisesti. Sitä vastoin matkustajamutaatiot ovat biologisesti neutraaleja eivätkä anna kasvuetua. Näin ollen kuljettajan somaattiset mutaatiot ovat perinteisesti optimaalinen kohde syöpäsoluille. Koska yhä enemmän todisteita etnisistä eroista somaattisten mutaatioiden jakautumisessa, pyrimme kartoittamaan toimivia somaattisia mutaatioita Aasiassa vallitsevassa syövässä.

Kyky arvioida useita biomarkkereita käyttämällä FNA-näytteitä voisi tarjota läpimurron maha-suolikanavan syövän kliinisissä tutkimuksissa. FNA:t ovat minimaalisesti invasiivisia ja siksi hyväksyttäviä sarjatuumorinäytteiden ottamiseen. Lisäksi tällä menetelmällä poistetut solut edustavat usein suhteellisen puhdasta kasvainsolupopulaatiota, ja ne voidaan käsitellä minuuteissa kasvaimesta poistamisen jälkeen; siksi FNA-näytteiden proteomiset profiilit muistuttavat todennäköisesti hyvin läheisesti in vivo -profiileja. Lisäksi kasvainsolut metastaattisista kohdista, jotka on saatu käyttämällä FNA:ta, voivat tarjota paikkaspesifisen metastaattisen kasvainprofiilin. Hankitut resistenssit hoitoja kohtaan tunnetaan hyvin eri syöpätyypeissä.1, 2 FNA:n suorittama sarjanäytteenotto kasvainkudoksesta tarjoaa tärkeitä resursseja kasvaimen muutosten seuraamiseen ajan ja hoidon funktiona.

On tehty lukuisia tutkimuksia, joissa on raportoitu karsinoomasolujen havaitsemisesta potilaiden, joilla on kiinteitä kasvaimia, verestä. CTC-solujen (Circulating Tumor Cells) havaitseminen ennen ensilinjan hoidon aloittamista potilailla, joilla on metastaattinen rintasyöpä, ennustaa erittäin hyvin etenemisvapaata eloonjäämistä ja kokonaiseloonjäämistä.3-5 Nämä tutkimukset johtivat FDA:n hyväksyntään vertex CellSearch -teknologialle. CTC:iden havaitsemisen ennuste ennen hoidon aloittamista herättää tärkeitä kysymyksiä näiden solujen biologisista ominaisuuksista. CTC:itä löytyy useimmista metastaattisista sairauksista, ja se voi heijastaa toistuvan kasvaimen tilaa, joka etsii vaihtoehtoista paikkaa kolonisoitumiselle. Kaikki CTC:t eivät kuitenkaan pystyisi muodostamaan metastaattisia pesäkkeitä. Kyky profiloida kasvaimia eri metastaattisissa paikoissa yhdessä CTC:iden kanssa voisi tarjota tietoa vahvimpien CTC:iden osajoukosta, joilla on korkeimmat metastaattiset mahdollisuudet. Lisäksi CTC:t voisivat tarjota vaihtoehtoisen lähteen kasvainsoluille, joita voidaan käyttää havaitsemaan kasvainmuutoksia syövän edetessä ja hoitoa jatkettaessa tai muutettuna.

Kinaasien ja muiden signaalinvälitysreittimolekyylien ilmentymis-/aktivaatioprofilointi yhdessä angiogeneesin laukaisemiseen kriittisten markkerien kanssa sarjanäytteenotossa kasvaimesta ja kasvaimeen liittyvistä kudoksista antaa arvokasta tietoa kasvainsoluissa tapahtuvista muutoksista ajan ja hoitojen funktiona. Tämä kasvaimen etenemisen ajallinen ja spatiaalinen profilointi antaa kliinikoille mahdollisuuden seurata nopeasti "kehittyviä" syövän tunnusmerkkejä jokaisessa potilaassa. CTC:iden ja FNA:iden ajallisessa ja paikkaspesifisessä profiloinnissa on sitten käytettävä erittäin herkkää ja spesifistä menetelmää rajoitetun määrän syöpäsolujen tutkimiseksi tällaisissa näytteissä. Näiden tulosten perusteella aiomme suunnitella genomiin suunnattuja kliinisiä tutkimuksia näille kasvaintyypeille.