Влияние кислотной блокады на микробиоту и воспаление при кистозном фиброзе (МВ)

Пациенты с кистозным фиброзом (МВ) имеют значительную заболеваемость и смертность из-за инфекций дыхательных путей. Эти инфекции связаны с дефицитом мукоцилиарного клиренса из-за густого обезвоженного секрета. Таким образом, значительные усилия тратятся на борьбу с инфекциями дыхательных путей. Это включает в себя терапию для улучшения очистки от слизи и лечение антибиотиками, нацеленными на важные патогены. Понимание источника микробиоты дыхательных путей, повышенного риска инфекции и обострения имеет решающее значение для улучшения лечения инфекции дыхательных путей. Большую часть пациентов с муковисцидозом также лечат антикислотными препаратами. Эти препараты уменьшают симптомы, связанные с гастроэзофагеальной рефлюксной болезнью (ГЭРБ), и повышают эффективность заместительной ферментной терапии. Важным для этого предложения является тот факт, что аспирация может представлять собой потенциальный путь заражения дыхательных путей микроорганизмами верхних отделов желудочно-кишечного тракта (ЖКТ), а антикислотная терапия изменяет микробиоту ЖКТ. В предварительных исследованиях мы выявили сильное изменение микробиоты пищевода у субъектов, принимающих препараты, блокирующие кислоту. Таким образом, эти методы лечения могут оказывать значительное влияние на бактериальные сообщества, присутствующие в верхних отделах желудочно-кишечного тракта, и могут играть роль в инфекции и обострении муковисцидоза. Традиционно для доступа к верхним отделам ЖКТ требовалась эндоскопия для получения биопсии ткани, что является инвазивной процедурой и обычно не выполняется при муковисцидозе. Чтобы обойти инвазивное взятие проб, необходимое для исследования пищевода, мы недавно показали, что минимально инвазивный тест, тест струны пищевода (EST), способен брать пробы из верхних отделов желудочно-кишечного тракта и имеет эффективность, сравнимую с биопсией, для ряда измерений, включая оценка микробиоты пищевода.

Основная гипотеза этого предложения заключается в том, что препараты, блокирующие кислоту, изменяют микробиоту пищевода при муковисцидозе, увеличивая присутствие патогенных бактерий и воспаление. Для проверки этой гипотезы мы предлагаем три конкретные цели:

Конкретная цель 1: определить, изменяется ли микробный состав пищевода у детей с муковисцидозом после отмены кислотной блокады.

1. Сравнение бактериальной нагрузки пищевода с помощью 16S qPCR у субъектов, находящихся на кислотной блокаде и после отмены
2. Изучите стабильность бактериальных сообществ пищевода на основе продольного сбора теста на струну пищевода (EST) до прекращения лечения кислотной блокадой.
3. Определите, есть ли изменения после отмены кислотной блокады как в составе микробиоты мокроты, так и в микробиоте пищевода (включая наличие патогенных бактерий), и коррелируют ли эти изменения между двумя типами образцов.

Конкретная цель 2: определить, изменяется ли микробиота пищевода у детей с муковисцидозом после начала кислотной блокады у пациентов, начатых по клиническим показаниям.

1. Сравнение бактериальной нагрузки пищевода с помощью 16S qPCR бактерий пищевода у субъектов до и после лечения кислотной блокадой.
2. Изучите стабильность бактериальных сообществ пищевода, основываясь на продольном сборе теста на струны пищевода (EST) до начала лечения кислотной блокадой.
3. Определите, есть ли изменения после начала кислотной блокады как в составе микробиоты мокроты, так и в микробиоте пищевода (включая присутствие патогенных бактерий), и коррелируют ли эти изменения между двумя типами образцов.

Конкретная цель 3: изучить взаимосвязь между кислотными блокаторами и воспалением в связи с бактериальными сообществами у субъектов из целей 1 и 2.

1. Сравните IL-8 в пищеводе у субъектов с кислотной блокадой и без нее.
2. Сравните ИЛ-8 в мокроте у субъектов с кислотной блокадой и без нее и определите связь между воспалением и ассоциацией со сдвигами в бактериальных сообществах.

Вместе эти цели предоставят новую информацию о влиянии лечения кислотной блокадой на микробиоту пищевода и легких, что может повлиять на лечение респираторных заболеваний при МВ. Мы ожидаем аналогичное воздействие кислотной блокады на бактериальные сообщества пищевода, которое мы наблюдали у детей и взрослых без МВ, но признаем, что бремя лечения при МВ, особенно антибиотиков, может повлиять на ожидаемый результат. Эти данные предоставят важную информацию для оценки влияния кислотной блокады на риск инфицирования, что может повлиять на выбор терапии для пациентов с муковисцидозом. Долгосрочной целью этих исследований является улучшение ухода за пациентами путем оценки влияния терапии блокаторами кислоты на микробиоту и воспаление.