Effekt av tarm och intratumoral mikrobiom på neoadjuvant kemoterapi-inducerad immunövervakning vid trippelnegativ bröstcancer

Detta är en prospektiv studie av nyligen diagnostiserade trippelnegativa bröstcancerpatienter (TNBC) som genomgår standardbehandling neoadjuvant kemoterapi och korrelerar tarm- och intratumoral mikrobiomsammansättning och antitumörimmunsvar med pCR.

Biopsien vid diagnos kommer att användas som en förbehandlingskontroll för bedömning av TILs, PD-L1-uttryck, immunsignaturprofiler. Både tumör och "normal" intilliggande icke-tumörvävnad kommer att utvärderas. Prover av avföring och perifert blod (PB) kommer att samlas in vid tidpunkten för samtycke för behandling. TNBC-patienter kommer att behandlas med standardbehandling neoadjuvant kemoterapi. Vid mitten av behandlingen (MT) kommer en elektiv tumörbiopsi att utföras och avförings- och PB-prover tas. Vid tidpunkten för operationen, efter avslutad neoadjuvant kemoterapi (efter bedömning av den medicinska onkologen), kommer resekerade tumörer och "normal" intilliggande icke-tumörvävnad, avföring och PB-prover att samlas in.

Pre-, mid- och post-terapi immunfenotypning/profilering kommer att bestämmas i PB-prover och patientbiopsier. Den övergripande sammansättningen av tarmmikrobiomet kommer också att bestämmas i patientavföringsprover.

Översikten av studien presenteras nedan:

1. Regimen och varaktigheten av neoadjuvant kemoterapi bestäms av den medicinska onkologen.
2. Cykel 1 avser den första dosen av varje behandling.
3. Tumörmorfologi, IHC och FISH kommer att utföras vid diagnos av TNBC. Kriterier för nydiagnostiserad TNBC: <1 % av ER- och PR-immunreaktivitet och HER2- av FISH eller IHC-färgning 0 eller 1+ och T1 (T1: <1,5 cm) massalesion eller mer.
4. För korrelativa studier kommer insamling av PB att ske vid dag 1 av cykel 1, dag 1 av cykel 1 av T och slutet av behandlingen, före operation. Åtta 8x-rör, sju (7) gula topprör (BD Vacutainer ACD Solution A-blodtagningsrör - 8,5 ml) och ett (1) Streck-rör. Immunfenotisering, genuttrycksprofilering och bedömning av produktion av cytokin/kemokin och andra mediatorer kommer att utföras.
5. För korrelativa studier kommer avföring att samlas in upp till 48 timmar före läkemedelsadministrering på dag 1 av cykel 1 och operationsdagen. Sekvensering av tarmen och intratumorala mikrobiomet och genassocierade vägar kommer att utföras med 16S rRNA och shotgun metagenomics-sekvensering.
6. För korrelativa studier kommer immunfärgning av fixerad vävnad för PD-L1 eller annan immunmarköruttryck på tumörceller och för in situ närvaro av olika T-cellsundergruppsmarkörer med PD1-uttryck att utföras. Isolering av DNA och RNA kommer att utföras från formalinfixerade vävnader.
7. Tumörbiopsi för mitten av behandlingen (MT). Denna biopsi kommer att erbjudas och utföras efter patientens samtycke.
8. Denna vävnad kommer att tillhandahållas av patologiavdelningen vid bearbetning av kirurgiskt prov.