Wpływ mikrobiomu jelitowego i wewnątrzguzowego na indukowany chemioterapią neoadiuwantową nadzór immunologiczny w potrójnie ujemnym raku piersi

Jest to prospektywne badanie nowo zdiagnozowanych pacjentek z potrójnie negatywnym rakiem piersi (TNBC) poddawanych standardowej chemioterapii neoadiuwantowej i koreluje skład mikrobiomu jelitowego i wewnątrz guza oraz przeciwnowotworowe odpowiedzi immunologiczne z pCR.

Biopsja w momencie rozpoznania zostanie wykorzystana jako kontrola przed leczeniem do oceny TIL, ekspresji PD-L1, profili sygnatur immunologicznych. Oceniany będzie zarówno guz, jak i „normalna” sąsiadująca tkanka nienowotworowa. Próbki kału i krwi obwodowej (PB) będą pobierane w momencie wyrażenia zgody na terapię. Pacjenci z TNBC będą leczeni standardową chemioterapią neoadiuwantową. W połowie leczenia (MT) zostanie przeprowadzona planowa biopsja guza i pobrane zostaną próbki kału i PB. W czasie operacji, po zakończeniu chemioterapii neoadjuwantowej (według uznania lekarza onkologa), zostanie pobrany wycięty guz i „prawidłowa” sąsiadująca tkanka nienowotworowa, kał i PB.

Fenotypowanie/profilowanie immunologiczne przed, w trakcie i po terapii zostanie określone w próbkach PB i biopsjach pacjentów. Ogólny skład mikrobiomu jelitowego zostanie również określony w próbkach kału pacjenta.

Przegląd badania przedstawiono poniżej:

1. Schemat i czas trwania chemioterapii neoadiuwantowej leży w gestii lekarza onkologa.
2. Cykl 1 odnosi się do pierwszej dawki każdego leczenia.
3. Morfologia guza, IHC i FISH zostaną wykonane przy rozpoznaniu TNBC. Kryteria nowo rozpoznanego TNBC: <1% immunoreaktywności ER i PR oraz HER2- w barwieniu FISH lub IHC 0 lub 1+ i zmiana masowa T1 (T1: <1,5 cm) lub większa.
4. W przypadku badań korelacyjnych pobieranie PB będzie miało miejsce w dniu 1 cyklu 1, dniu 1 cyklu 1 T i na końcu leczenia, przed operacją. Osiem probówek 8x, siedem (7) żółtych probówek (probówki BD Vacutainer ACD Solution A do pobierania krwi — 8,5 ml) i jedna (1) probówka Streck. Przeprowadzone zostanie immunofenowiązanie, profilowanie ekspresji genów oraz ocena produkcji cytokin/chemokin i innych mediatorów.
5. W przypadku badań korelacyjnych kał zostanie pobrany do 48 godzin przed podaniem leku w 1. dniu cyklu 1. oraz w dniu operacji. Sekwencjonowanie mikrobiomu jelitowego i wewnątrznowotworowego oraz szlaków związanych z genami zostanie przeprowadzone za pomocą sekwencjonowania 16S rRNA i metagenomiki shotgun.
6. W badaniach korelacyjnych zostanie przeprowadzone barwienie immunologiczne utrwalonej tkanki pod kątem ekspresji PD-L1 lub innego markera odpornościowego na komórkach nowotworowych oraz pod kątem obecności in situ różnych markerów podzbioru komórek T z ekspresją PD1. Z tkanek utrwalonych w formalinie zostanie przeprowadzona izolacja DNA i RNA.
7. Biopsja guza w trakcie leczenia (MT). Ta biopsja zostanie zaoferowana i wykonana za zgodą pacjenta.
8. Tkanka ta zostanie dostarczona przez Oddział Patologii po przetworzeniu próbki chirurgicznej.