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实体瘤的分子分析 (MAST)

2025年11月7日更新者：St. Jude Children's Research Hospital

本研究将前瞻性地描述原发性和转移性神经母细胞瘤、骨肉瘤、视网膜母细胞瘤、尤文肉瘤家族肿瘤、软组织肉瘤、肾上腺皮质肿瘤和肝脏恶性肿瘤的分子、细胞和遗传特性。这些细胞分离物将用于基因表达阵列分析、[SNP] 单核苷酸多态性芯片基因组分析、阵列 [CGH] 比较基因组杂交和下一代测序，以及 [TEM] 透射电子显微镜分析。此外，将从获得的肿瘤样本中创建细胞系和原位异种移植物。

将通过比较来自外周血和肿瘤浸润性 CD4+ 和 CD8+ T 细胞的成对 TCR 来检查 TCR 的特异性。将进行表观遗传学研究，观察这些细胞的甲基化概况，并研究 PD1 抑制前后的抗肿瘤 T 细胞反应。

研究概览

地位

招聘中

条件

小儿实体瘤

详细说明

美国每年约有 2,200 名儿童被诊断患有神经母细胞瘤、骨肉瘤、尤文肉瘤家族肿瘤 (ESFT)、视网膜母细胞瘤、软组织肉瘤、肾上腺皮质肿瘤和肝脏恶性肿瘤。这些侵袭性小儿实体瘤是发育性肿瘤，在神经嵴、骨骼和软组织的组织生长和形态发生期间开始。这些肿瘤在晚期的总生存率不到 30%。尽管在过去三十年中使用多种治疗方式（包括化疗、手术、放疗、自体骨髓移植和生物制剂）进行了大量努力，但这些晚期儿童实体瘤的长期存活率略有改善。更好地了解随着肿瘤形成而在发育中的组织中发生的分子、细胞和遗传变化可以改善这些破坏性癌症的治疗。特别是，如果该研究更好地了解随着细胞从癌前病变发展为转移性疾病而被破坏的通路，化疗药物可能更有效地靶向关键调节酶或蛋白质。该提案的具体目的是确定发生在神经母细胞瘤、视网膜母细胞瘤、骨肉瘤、尤文肉瘤家族肿瘤 [ESFT] 和软组织肉瘤细胞中的基因表达变化，并将这些变化与肿瘤细胞中的遗传和细胞变化相关联. [RNA] 核糖核酸和基因组 [DNA] 脱氧核糖核酸将从神经母细胞瘤、视网膜母细胞瘤、骨肉瘤、ESFT [尤文肉瘤肿瘤家族] 和软组织肉瘤（原发性和转移性病变）中分离出来患者。在获得手术标本的治疗期间或之后的任何时间点，将对肿瘤样本进行额外的测试。当病理分析和储存后剩余足够的肿瘤样本时，新鲜的原发性肿瘤细胞将用于制备原位异种移植物并建立每种疾病的模型，以概括神经母细胞瘤、骨肉瘤、尤文肉瘤家族肿瘤 [ESFT] 的晚期形式，视网膜母细胞瘤和软组织肉瘤。对于这些多余样品中的一小部分，本研究将对电子显微镜进行固定，并处理样品以进行 [TEM] 透射电子显微镜分析。这些研究将补充我们积极的研究计划，该计划描述了每种疾病的基因工程小鼠模型的分子、细胞和遗传特征。来自圣裘德儿童研究医院接受治疗的患者队列的生物样本将与世界各地合作机构收集和处理的样本相补充。从国际合作者处收集的样本将用于分析 [DNA] 脱氧核糖核酸和 [RNA] 核糖核酸，以补充圣裘德儿童研究医院的队列。通过这项合作，该研究预计他们将能够获得足够的新鲜肿瘤样本，以提高他们对小儿实体恶性肿瘤多阶段肿瘤发生的理解。

研究类型

观察性的

注册 (估计的)

1000

联系人和位置

本节提供了进行研究的人员的详细联系信息，以及有关进行该研究的地点的信息。

学习联系方式

姓名：Sara M. Federico, MD
电话号码：1-866-278-5833
邮箱：referralinfo@stjude.org

学习地点

美国
- Tennessee
  - Memphis、Tennessee、美国、38105
    - 招聘中
    - St. Jude Children's Research Hospital
    - 接触：
      
      Sara M. Federico, MD
      
      电话号码：866-278-5833
      
      邮箱：referralinfo@stjude.org
    - 首席研究员：
      
      Sara M. Federico, MD

参与标准

研究人员寻找符合特定描述的人，称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。

资格标准

适合学习的年龄

不超过 25年 (孩子、成人)

接受健康志愿者

不

取样方法

概率样本

研究人群

在 St. Jude 儿童研究医院和合作机构确定的疑似或已知诊断为神经母细胞瘤、骨肉瘤、视网膜母细胞瘤、尤文肉瘤或软组织肉瘤的患者基于初步诊断检查和适合切除的严重疾病证据。

描述

纳入标准：

根据初步诊断检查和适合切除的大体疾病证据，必须疑似或已知诊断为神经母细胞瘤、骨肉瘤、尤文肉瘤家族肿瘤或软组织肉瘤。可在以下部分或所有时间点收集标本：初始活检、骨髓抽吸程序、肿瘤切除和可能复发的时间。
如果没有针对视网膜母细胞瘤的有效治疗或生物学方案，则可以招募根据初步诊断检查诊断为视网膜母细胞瘤且需要去核的患者。
患者或其法定监护人（视情况而定）必须在为本方案移除第一次组织/骨髓/血样采集后 30 天内提供书面知情同意书。
该患者正在圣裘德儿童研究医院或合作机构就诊。
患者在入组时必须小于或等于 25 岁。

排除标准：

已知患者患有乙型肝炎、丙型肝炎和/或 HIV 阳性。

学习计划

本节提供研究计划的详细信息，包括研究的设计方式和研究的衡量标准。

研究是如何设计的？

设计细节

研究衡量的是什么？

主要结果指标

结果测量	大体时间
执行基因表达谱分析。 [RNA] 核糖核酸将从新鲜冷冻肿瘤标本中分离出来，并与 Affymetrix 基因表达阵列杂交。大体时间：5年	5年

次要结果测量

结果测量	大体时间
对大型染色体改变（例如扩增和缺失）进行分析。从肿瘤和血液样本中分离出的[DNA]脱氧核糖核酸将与阵列[CGH]比较基因组杂交芯片杂交。大体时间：5年	5年
对基因组中的焦点改变进行分析，包括扩增、缺失和杂合性丢失 (LOH)。从肿瘤和血液样本中分离出的 DNA 将与 [SNP] 单核苷酸多态性芯片杂交。大体时间：5年	5年
执行点突变分析。从肿瘤和血液样本中分离出的 DNA 将使用下一代测序技术进行测序，以确定整个基因组的序列。大体时间：5年	5年
对细胞形态进行分析。组织样本将固定在适合透射电子显微镜的缓冲液中，并进行处理以进行 [TEM] 透射电子显微镜分析。大体时间：5年	5年
比较肿瘤中的微小 RNA。微小 RNA 将从上述基因表达分析遗留下来的总 [RNA] 核糖核酸中分离出来。这些样本将用于微型 [RNA] 芯片分析或深度测序。大体时间：5年	5年
比较 [DNA] 脱氧核糖核酸的表观遗传修饰。将分离基因组 DNA，并分析整个基因组的 DNA 甲基化，以确定该表观遗传过程是否在肿瘤样本中发生了改变。大体时间：5年	5年
比较染色质的表观遗传修饰。细胞将被快速固定并制备染色质，以便通过 [ChIP-seq] 染色质免疫沉淀或 [ChIP-芯片分析] 染色质免疫沉淀直接探测蛋白质-DNA 复合物大体时间：5年	5年
进行蛋白质分析。肿瘤细胞将被快速冷冻，用于随后分离总蛋白或细胞蛋白的特定部分（即核蛋白、细胞质蛋白、膜蛋白）。大体时间：5年	5年
对神经母细胞瘤、骨肉瘤、视网膜母细胞瘤、ESFT 和软组织肉瘤进行免疫组织化学和 FISH 分析。将从本研究中收集的样本制备组织微阵列。大体时间：5年	5年
从原发性和转移性肿瘤标本中分离的细胞将用于在免疫功能低下的小鼠中建立细胞系和原位异种移植物。大体时间：5年	5年
对细胞生长、转移和对化疗的敏感性进行分析。大体时间：5年	5年
利用新鲜肿瘤样本的流式细胞术分析评估免疫细胞浸润的程度及其在儿科实体瘤中的功能状态。大体时间：5年	5年
评估治疗后的肿瘤相关巨噬细胞 (TAMS)，以定位治疗后微环境中巨噬细胞组织修复特性的基因表达模式、标记和功能相关性。大体时间：5年	5年

合作者和调查者

在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。

赞助

St. Jude Children's Research Hospital

合作者

Alex's Lemonade Stand Foundation

调查人员

首席研究员：Sara M. Federico, MD、St. Jude Children's Research Hospital

出版物和有用的链接

负责输入研究信息的人员自愿提供这些出版物。这些可能与研究有关。

有用的网址

研究记录日期

这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查，以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。

研究主要日期

学习开始 (实际的)

2010年2月10日

初级完成 (估计的)

2026年9月30日

研究完成 (估计的)

2026年9月30日

研究注册日期

首次提交

2010年1月14日

首先提交符合 QC 标准的

2010年1月14日

首次发布 (估计的)

2010年1月15日

研究记录更新

最后更新发布 (估计的)

2025年11月12日

上次提交的符合 QC 标准的更新

2025年11月7日

最后验证

2025年11月1日