Analiza molekularna guzów litych (MAST)

Każdego roku u około 2200 dzieci w Stanach Zjednoczonych diagnozuje się nerwiaka niedojrzałego, kostniakomięsaka, nowotwory z rodziny mięsaków Ewinga (ESFT), siatkówczaka, mięsaki tkanek miękkich, guzy kory nadnerczy i nowotwory złośliwe wątroby. Te agresywne guzy lite u dzieci są nowotworami rozwojowymi, które inicjują się w okresach wzrostu tkanki i morfogenezy w grzebieniu nerwowym, kości i tkankach miękkich. Ogólny wskaźnik przeżycia tych nowotworów w zaawansowanym stadium wynosi mniej niż 30%. Pomimo intensywnych wysiłków w ciągu ostatnich trzech dekad z zastosowaniem wielu metod terapeutycznych, w tym chemioterapii, chirurgii, radioterapii, autologicznego przeszczepu szpiku kostnego i środków biologicznych, nastąpiła niewielka poprawa długoterminowego przeżycia tych zaawansowanych pediatrycznych guzów litych. Lepsze zrozumienie zmian molekularnych, komórkowych i genetycznych zachodzących w rozwijających się tkankach w miarę powstawania guzów może poprawić leczenie tych wyniszczających nowotworów. W szczególności środki chemioterapeutyczne mogą być skuteczniej ukierunkowane na kluczowe enzymy regulacyjne lub białka, jeśli badanie pozwoli lepiej zrozumieć szlaki, które są zakłócane, gdy komórki przechodzą od zmian przednowotworowych do choroby przerzutowej. Konkretnym celem tej propozycji jest identyfikacja zmian w ekspresji genów zachodzących w nerwiaku niedojrzałym, siatkówczaku, kostniakomięsaku, rodzinie nowotworów Ewinga [ESFT] i komórkach mięsaków tkanek miękkich oraz skorelowanie tych zmian ze zmianami genetycznymi i komórkowymi w komórkach nowotworowych . [RNA] kwas rybonukleinowy i genomowy [DNA] kwas dezoksyrybonukleinowy zostaną wyizolowane z nerwiaka niedojrzałego, siatkówczaka, kostniakomięsaka, ESFT [rodzina nowotworów mięsaków Ewinga] i mięsaków tkanek miękkich (zarówno pierwotnych, jak i przerzutowych) po operacji lub aspiracji szpiku kostnego z wcześniej nieleczonych pacjenci. Dodatkowe badania zostaną przeprowadzone na próbkach guza w dowolnym momencie w trakcie lub po zakończeniu leczenia, w którym uzyskano próbkę chirurgiczną. Gdy po analizie patologicznej i bankowaniu pozostanie wystarczająca próbka guza, świeże pierwotne komórki nowotworowe zostaną użyte do przygotowania ortotopowych ksenoprzeszczepów i ustanowienia modeli każdej choroby, które podsumowują zaawansowane formy nerwiaka niedojrzałego, kostniakomięsaka, rodziny nowotworów Ewinga [ESFT], siatkówczaka i mięsaków tkanek miękkich. W przypadku niewielkiej grupy tych nadmiarowych próbek badanie to przeprowadzi utrwalenie do mikroskopii elektronowej i przetworzy próbki do analizy transmisyjnej mikroskopii elektronowej [TEM]. Badania te uzupełnią nasz aktywny program badawczy charakteryzujący cechy molekularne, komórkowe i genetyczne genetycznie modyfikowanych mysich modeli każdej z tych chorób. Próbki biologiczne z kohorty pacjentów leczonych w Dziecięcym Szpitalu Badawczym St. Jude zostaną uzupełnione o próbki pobrane i przetworzone przez współpracujące instytucje na całym świecie. Próbki pobrane od międzynarodowych współpracowników zostaną wykorzystane do analizy kwasu dezoksyrybonukleinowego [DNA] i kwasu rybonukleinowego [RNA] w celu uzupełnienia kohorty dziecięcego szpitala badawczego St. Jude. Oczekuje się, że dzięki tej współpracy badacze będą w stanie uzyskać wystarczającą liczbę świeżych próbek guzów, aby lepiej zrozumieć wieloetapową nowotworzenie w litych nowotworach pediatrycznych.