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Analyse moléculaire des tumeurs solides (MAST)

7 novembre 2025 mis à jour par: St. Jude Children's Research Hospital

Cette étude caractérisera de manière prospective les propriétés moléculaires, cellulaires et génétiques du neuroblastome primaire et métastatique, de l'ostéosarcome, du rétinoblastome, de la famille des tumeurs du sarcome d'Ewing, des sarcomes des tissus mous, des tumeurs corticosurrénales et des tumeurs malignes du foie. Ces isolats cellulaires seront utilisés pour l'analyse de matrice d'expression génique, l'analyse génomique par puce de polymorphisme de nucléotide unique [SNP], l'hybridation génomique comparative de matrice [CGH] et le séquençage de nouvelle génération, et l'analyse par microscopie électronique à transmission [TEM]. De plus, des lignées cellulaires et des xénogreffes orthotopiques seront créées à partir des échantillons de tumeur obtenus.

La spécificité des TCR sera examinée en comparant les TCR appariés provenant du sang périphérique et des lymphocytes T CD4+ et CD8+ infiltrant la tumeur. Des études épigénétiques seront réalisées en examinant le profil de méthylation de ces cellules et en étudiant la réponse anti-tumorale des lymphocytes T à la fois avant et après l'inhibition de PD1.

Aperçu de l'étude

Statut

Recrutement

Description détaillée

Chaque année, environ 2 200 enfants aux États-Unis reçoivent un diagnostic de neuroblastome, d'ostéosarcome, de tumeurs de la famille des sarcomes d'Ewing (ESFT), de rétinoblastome, de sarcomes des tissus mous, de tumeurs corticosurrénaliennes et de tumeurs malignes du foie. Ces tumeurs solides pédiatriques agressives sont des tumeurs développementales qui s'initient pendant les périodes de croissance tissulaire et de morphogenèse dans la crête neurale, les os et les tissus mous. Le taux de survie global de ces tumeurs au stade avancé est inférieur à 30 %. Malgré des efforts intensifs au cours des trois dernières décennies utilisant de multiples modalités thérapeutiques, y compris la chimiothérapie, la chirurgie, la radiothérapie, la greffe de moelle osseuse autologue et les agents biologiques, il y a eu une amélioration modeste de la survie à long terme de ces tumeurs solides pédiatriques de stade avancé. Une meilleure compréhension des changements moléculaires, cellulaires et génétiques qui se produisent dans les tissus en développement à mesure que les tumeurs se forment pourrait améliorer le traitement de ces cancers dévastateurs. En particulier, les agents chimiothérapeutiques peuvent être plus efficacement ciblés sur les principales enzymes ou protéines régulatrices si l'étude avait une meilleure compréhension des voies qui sont perturbées à mesure que les cellules progressent des lésions prénéoplasiques à la maladie métastatique. L'objectif spécifique de cette proposition est d'identifier les changements dans l'expression génique qui se produisent dans le neuroblastome, le rétinoblastome, l'ostéosarcome, la famille des tumeurs du sarcome d'Ewing [ESFT] et les cellules du sarcome des tissus mous et de corréler ces changements avec les changements génétiques et cellulaires dans les cellules tumorales. . L'acide ribonucléique [ARN] et l'acide désoxyribonucléique [ADN] génomique seront isolés du neuroblastome, du rétinoblastome, de l'ostéosarcome, de l'ESFT [famille de tumeurs du sarcome d'Ewing] et des sarcomes des tissus mous (lésions primaires et métastatiques) à la suite d'une intervention chirurgicale ou d'une aspiration de moelle osseuse chez des patients non traités auparavant. les patients. Des tests supplémentaires seront effectués sur des échantillons de tumeurs à tout moment pendant ou après le traitement au cours duquel un spécimen chirurgical est obtenu. Lorsqu'il reste suffisamment d'échantillon de tumeur après l'analyse pathologique et la mise en banque, des cellules tumorales primaires fraîches seront utilisées pour préparer des xénogreffes orthotopiques et pour établir des modèles de chaque maladie qui récapitulent les formes avancées de neuroblastome, d'ostéosarcome, de la famille des tumeurs du sarcome d'Ewing [ESFT], rétinoblastome et sarcomes des tissus mous. Pour un petit groupe de ces échantillons en excès, cette étude effectuera une fixation pour la microscopie électronique et traitera les échantillons pour une analyse par microscopie électronique à transmission [TEM]. Ces études viendront compléter notre programme de recherche actif caractérisant les caractéristiques moléculaires, cellulaires et génétiques de modèles murins génétiquement modifiés de chacune de ces maladies. Les échantillons biologiques de la cohorte de patients traités à l'hôpital de recherche pour enfants St. Jude seront complétés par des échantillons collectés et traités par des institutions collaboratrices du monde entier. Les échantillons prélevés auprès de collaborateurs internationaux seront utilisés pour l'analyse de l'acide désoxyribonucléique [ADN] et de l'acide ribonucléique [ARN] afin de compléter la cohorte du St. Jude Children's Research Hospital. Grâce à cette collaboration, l'étude prévoit qu'ils seront en mesure d'obtenir suffisamment d'échantillons de tumeurs fraîches pour améliorer leur compréhension de la tumorigenèse en plusieurs étapes dans les tumeurs malignes solides pédiatriques.

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Estimé)

1000

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Coordonnées de l'étude

Lieux d'étude

    • Tennessee
      • Memphis, Tennessee, États-Unis, 38105
        • Recrutement
        • St. Jude Children's Research Hospital
        • Contact:
        • Chercheur principal:
          • Sara M. Federico, MD

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

Pas plus vieux que 25 ans (Enfant, Adulte)

Accepte les volontaires sains

Non

Méthode d'échantillonnage

Échantillon de probabilité

Population étudiée

Patients identifiés à l'hôpital de recherche pour enfants St. Jude et dans les institutions collaboratrices avec un diagnostic suspecté ou connu de neuroblastome, d'ostéosarcome, de rétinoblastome, de sarcome d'Ewing ou de sarcome des tissus mous basé sur le bilan diagnostique initial et la preuve d'une maladie grave se prêtant à l'excision.

La description

Critère d'intégration:

  • Doit avoir un diagnostic suspecté ou connu de neuroblastome, d'ostéosarcome, de tumeur de la famille des sarcomes d'Ewing ou de sarcome des tissus mous sur la base du bilan diagnostique initial et des preuves d'une maladie grave pouvant être excisée. Les échantillons peuvent être prélevés à certains ou à tous les moments suivants : biopsie initiale, procédures d'aspiration de moelle osseuse, résection tumorale et au moment d'une éventuelle rechute.
  • Les patients avec un diagnostic de rétinoblastome basé sur le bilan diagnostique initial et qui nécessitent une énucléation peuvent être inscrits s'il n'y a pas de protocole thérapeutique ou biologique actif pour le rétinoblastome.
  • Le patient ou son tuteur légal, selon le cas, doit fournir un consentement éclairé écrit dans les 30 jours suivant le prélèvement du premier prélèvement de tissu/moelle osseuse/échantillon de sang pour ce protocole.
  • Le patient est vu au St. Jude Children's Research Hospital ou dans un établissement partenaire.
  • Les patients doivent être âgés d'au moins 25 ans au moment de l'inscription.

Critère d'exclusion:

  • Le patient est connu pour être séropositif pour l'hépatite B, l'hépatite C et/ou le VIH.

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Délai
Effectuer une analyse des profils d'expression génique. [ARN] L'acide ribonucléique sera isolé à partir d'échantillons de tumeurs fraîchement congelés et hybridé avec des matrices d'expression génique Affymetrix.
Délai: 5 années
5 années

Mesures de résultats secondaires

Mesure des résultats
Délai
Effectuez une analyse des altérations chromosomiques importantes telles que les amplifications et les délétions. L'acide désoxyribonucléique [ADN] isolé de la tumeur et des échantillons de sang sera hybridé sur des puces d'hybridation génomique comparative [CGH].
Délai: 5 années
5 années
Effectuez une analyse des altérations focales du génome, y compris l'amplification, la suppression et la perte d'hétérozygotie (LOH). L'ADN isolé de la tumeur et des échantillons de sang sera hybridé sur des puces de polymorphisme mononucléotidique [SNP].
Délai: 5 années
5 années
Effectuer une analyse des mutations ponctuelles. L'ADN isolé de la tumeur et des échantillons de sang sera séquencé à l'aide de la technologie de séquençage de nouvelle génération pour déterminer la séquence du génome entier.
Délai: 5 années
5 années
Effectuer une analyse de la morphologie cellulaire. Les échantillons de tissus seront fixés dans un tampon adapté à la microscopie électronique à transmission et traités pour une analyse par microscopie électronique à transmission [TEM].
Délai: 5 années
5 années
Comparez les micro-ARN dans les tumeurs. Les micro-ARN seront isolés de l'acide ribonucléique [ARN] total restant de l'analyse de l'expression génique décrite ci-dessus. Ces échantillons seront utilisés pour l'analyse de micropuces [ARN] ou le séquençage en profondeur.
Délai: 5 années
5 années
Comparez les modifications épigénétiques de l'acide désoxyribonucléique [ADN]. L'ADN génomique sera isolé et la méthylation de l'ADN sera analysée à travers le génome pour déterminer si ce processus épigénétique est altéré dans les échantillons de tumeurs.
Délai: 5 années
5 années
Comparer les modifications épigénétiques de la chromatine. Les cellules seront rapidement fixées et la chromatine sera préparée afin de sonder directement les complexes protéine-ADN par [ChIP-seq]immunoprécipitation de la chromatine ou [ChIP-chip analysis] immunoprécipitation de la chromatine
Délai: 5 années
5 années
Effectuer une analyse des protéines. Les cellules tumorales seront rapidement congelées pour un isolement ultérieur de la protéine totale ou d'une fraction spécifique de protéines cellulaires (c'est-à-dire des protéines nucléaires, cytoplasmiques, membranaires).
Délai: 5 années
5 années
Effectuez des analyses immunohistochimiques et FISH des neuroblastomes, des ostéosarcomes, des rétinoblastomes, des ESFT et des sarcomes des tissus mous. Des puces à ADN tissulaires seront préparées à partir d'échantillons collectés dans cette étude.
Délai: 5 années
5 années
Des isolats cellulaires obtenus à partir d'échantillons de tumeurs primaires et métastatiques seront utilisés pour établir des lignées cellulaires et des xénogreffes orthotopiques chez des souris immunodéprimées.
Délai: 5 années
5 années
Effectuer une analyse de la croissance cellulaire, des métastases et de la sensibilité à la chimiothérapie.
Délai: 5 années
5 années
Évaluer l'étendue de l'infiltration des cellules immunitaires et leur statut fonctionnel dans les tumeurs solides pédiatriques en utilisant l'analyse cytométrique en flux d'échantillons de tumeurs fraîches.
Délai: 5 années
5 années
Évaluez les macrophages associés aux tumeurs (TAMS) après la thérapie pour localiser les modèles d'expression génique, les marqueurs et les corrélats fonctionnels des propriétés de réparation tissulaire des macrophages dans le microenvironnement post-thérapie.
Délai: 5 années
5 années

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Les enquêteurs

  • Chercheur principal: Sara M. Federico, MD, St. Jude Children's Research Hospital

Publications et liens utiles

La personne responsable de la saisie des informations sur l'étude fournit volontairement ces publications. Il peut s'agir de tout ce qui concerne l'étude.

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

10 février 2010

Achèvement primaire (Estimé)

30 septembre 2026

Achèvement de l'étude (Estimé)

30 septembre 2026

Dates d'inscription aux études

Première soumission

14 janvier 2010

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

14 janvier 2010

Première publication (Estimé)

15 janvier 2010

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Estimé)

12 novembre 2025

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

7 novembre 2025

Dernière vérification

1 novembre 2025

Plus d'information

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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