- ICH GCP
- Registre américain des essais cliniques
- Essai clinique NCT01050296
Analyse moléculaire des tumeurs solides (MAST)
Cette étude caractérisera de manière prospective les propriétés moléculaires, cellulaires et génétiques du neuroblastome primaire et métastatique, de l'ostéosarcome, du rétinoblastome, de la famille des tumeurs du sarcome d'Ewing, des sarcomes des tissus mous, des tumeurs corticosurrénales et des tumeurs malignes du foie. Ces isolats cellulaires seront utilisés pour l'analyse de matrice d'expression génique, l'analyse génomique par puce de polymorphisme de nucléotide unique [SNP], l'hybridation génomique comparative de matrice [CGH] et le séquençage de nouvelle génération, et l'analyse par microscopie électronique à transmission [TEM]. De plus, des lignées cellulaires et des xénogreffes orthotopiques seront créées à partir des échantillons de tumeur obtenus.
La spécificité des TCR sera examinée en comparant les TCR appariés provenant du sang périphérique et des lymphocytes T CD4+ et CD8+ infiltrant la tumeur. Des études épigénétiques seront réalisées en examinant le profil de méthylation de ces cellules et en étudiant la réponse anti-tumorale des lymphocytes T à la fois avant et après l'inhibition de PD1.
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Description détaillée
Type d'étude
Inscription (Estimé)
Contacts et emplacements
Coordonnées de l'étude
- Nom: Sara M. Federico, MD
- Numéro de téléphone: 1-866-278-5833
- E-mail: referralinfo@stjude.org
Lieux d'étude
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Tennessee
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Memphis, Tennessee, États-Unis, 38105
- Recrutement
- St. Jude Children's Research Hospital
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Contact:
- Sara M. Federico, MD
- Numéro de téléphone: 866-278-5833
- E-mail: referralinfo@stjude.org
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Chercheur principal:
- Sara M. Federico, MD
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Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
Accepte les volontaires sains
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
La description
Critère d'intégration:
- Doit avoir un diagnostic suspecté ou connu de neuroblastome, d'ostéosarcome, de tumeur de la famille des sarcomes d'Ewing ou de sarcome des tissus mous sur la base du bilan diagnostique initial et des preuves d'une maladie grave pouvant être excisée. Les échantillons peuvent être prélevés à certains ou à tous les moments suivants : biopsie initiale, procédures d'aspiration de moelle osseuse, résection tumorale et au moment d'une éventuelle rechute.
- Les patients avec un diagnostic de rétinoblastome basé sur le bilan diagnostique initial et qui nécessitent une énucléation peuvent être inscrits s'il n'y a pas de protocole thérapeutique ou biologique actif pour le rétinoblastome.
- Le patient ou son tuteur légal, selon le cas, doit fournir un consentement éclairé écrit dans les 30 jours suivant le prélèvement du premier prélèvement de tissu/moelle osseuse/échantillon de sang pour ce protocole.
- Le patient est vu au St. Jude Children's Research Hospital ou dans un établissement partenaire.
- Les patients doivent être âgés d'au moins 25 ans au moment de l'inscription.
Critère d'exclusion:
- Le patient est connu pour être séropositif pour l'hépatite B, l'hépatite C et/ou le VIH.
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Délai |
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Effectuer une analyse des profils d'expression génique. [ARN] L'acide ribonucléique sera isolé à partir d'échantillons de tumeurs fraîchement congelés et hybridé avec des matrices d'expression génique Affymetrix.
Délai: 5 années
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5 années
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Mesures de résultats secondaires
Mesure des résultats |
Délai |
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Effectuez une analyse des altérations chromosomiques importantes telles que les amplifications et les délétions. L'acide désoxyribonucléique [ADN] isolé de la tumeur et des échantillons de sang sera hybridé sur des puces d'hybridation génomique comparative [CGH].
Délai: 5 années
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5 années
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Effectuez une analyse des altérations focales du génome, y compris l'amplification, la suppression et la perte d'hétérozygotie (LOH). L'ADN isolé de la tumeur et des échantillons de sang sera hybridé sur des puces de polymorphisme mononucléotidique [SNP].
Délai: 5 années
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5 années
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Effectuer une analyse des mutations ponctuelles. L'ADN isolé de la tumeur et des échantillons de sang sera séquencé à l'aide de la technologie de séquençage de nouvelle génération pour déterminer la séquence du génome entier.
Délai: 5 années
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5 années
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Effectuer une analyse de la morphologie cellulaire. Les échantillons de tissus seront fixés dans un tampon adapté à la microscopie électronique à transmission et traités pour une analyse par microscopie électronique à transmission [TEM].
Délai: 5 années
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5 années
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Comparez les micro-ARN dans les tumeurs. Les micro-ARN seront isolés de l'acide ribonucléique [ARN] total restant de l'analyse de l'expression génique décrite ci-dessus. Ces échantillons seront utilisés pour l'analyse de micropuces [ARN] ou le séquençage en profondeur.
Délai: 5 années
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5 années
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Comparez les modifications épigénétiques de l'acide désoxyribonucléique [ADN]. L'ADN génomique sera isolé et la méthylation de l'ADN sera analysée à travers le génome pour déterminer si ce processus épigénétique est altéré dans les échantillons de tumeurs.
Délai: 5 années
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5 années
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Comparer les modifications épigénétiques de la chromatine. Les cellules seront rapidement fixées et la chromatine sera préparée afin de sonder directement les complexes protéine-ADN par [ChIP-seq]immunoprécipitation de la chromatine ou [ChIP-chip analysis] immunoprécipitation de la chromatine
Délai: 5 années
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5 années
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Effectuer une analyse des protéines. Les cellules tumorales seront rapidement congelées pour un isolement ultérieur de la protéine totale ou d'une fraction spécifique de protéines cellulaires (c'est-à-dire des protéines nucléaires, cytoplasmiques, membranaires).
Délai: 5 années
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5 années
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Effectuez des analyses immunohistochimiques et FISH des neuroblastomes, des ostéosarcomes, des rétinoblastomes, des ESFT et des sarcomes des tissus mous. Des puces à ADN tissulaires seront préparées à partir d'échantillons collectés dans cette étude.
Délai: 5 années
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5 années
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Des isolats cellulaires obtenus à partir d'échantillons de tumeurs primaires et métastatiques seront utilisés pour établir des lignées cellulaires et des xénogreffes orthotopiques chez des souris immunodéprimées.
Délai: 5 années
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5 années
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Effectuer une analyse de la croissance cellulaire, des métastases et de la sensibilité à la chimiothérapie.
Délai: 5 années
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5 années
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Évaluer l'étendue de l'infiltration des cellules immunitaires et leur statut fonctionnel dans les tumeurs solides pédiatriques en utilisant l'analyse cytométrique en flux d'échantillons de tumeurs fraîches.
Délai: 5 années
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5 années
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Évaluez les macrophages associés aux tumeurs (TAMS) après la thérapie pour localiser les modèles d'expression génique, les marqueurs et les corrélats fonctionnels des propriétés de réparation tissulaire des macrophages dans le microenvironnement post-thérapie.
Délai: 5 années
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5 années
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Collaborateurs et enquêteurs
Parrainer
Collaborateurs
Les enquêteurs
- Chercheur principal: Sara M. Federico, MD, St. Jude Children's Research Hospital
Publications et liens utiles
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
Achèvement primaire (Estimé)
Achèvement de l'étude (Estimé)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Estimé)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Estimé)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Mots clés
Termes MeSH pertinents supplémentaires
- Tumeurs par site
- Tumeurs
- Tumeurs par type histologique
- Maladies oculaires
- Tumeurs, glandulaires et épithéliales
- Maladies oculaires, héréditaires
- Tumeurs, neuroépithéliales
- Tumeurs neuroectodermiques
- Tumeurs, cellules germinales et embryonnaires
- Tumeurs, tissu nerveux
- Tumeurs, tissus conjonctifs et mous
- Tumeurs neuroectodermiques, primitives, périphériques
- Tumeurs neuroectodermiques primitives
- Tumeurs, tissu osseux
- Tumeurs, tissu conjonctif
- Tumeurs, tissus musculaires
- Myosarcome
- Tumeurs oculaires
- Maladies rétiniennes
- Tumeurs rétiniennes
- Neuroblastome
- Sarcome d'Ewing
- Sarcome
- Rhabdomyosarcome
- Ostéosarcome
- Rétinoblastome
Autres numéros d'identification d'étude
- MAST
- DOD-W81XWH-14-1-0103(CA130396) (Autre subvention/numéro de financement: DOD-Department of the Army)
Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude
Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine
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