Denna sida har översatts automatiskt och översättningens korrekthet kan inte garanteras. Vänligen se engelsk version för en källtext.

Molekylär analys av fasta tumörer (MAST)

7 november 2025 uppdaterad av: St. Jude Children's Research Hospital

Denna studie kommer att prospektivt karakterisera de molekylära, cellulära och genetiska egenskaperna hos primära och metastaserande neuroblastom, osteosarkom, retinoblastom, Ewing-sarkomfamiljen av tumörer, mjukdelssarkom, binjurebarktumörer och levermaligniteter. Dessa cellisolat kommer att användas för genuttrycksarrayanalys, genomisk analys med [SNP] enkelnukleotidpolymorfismchip, array [CGH] jämförande genomisk hybridisering och nästa generations sekvensering och [TEM] transmissionselektronmikroskopanalys. Dessutom kommer cellinjer och ortotopiska xenotransplantat att skapas från de erhållna tumörproverna.

Specificiteten för TCR kommer att undersökas genom att jämföra parad TCR från perifert blod och tumörinfiltrerande CD4+ och CD8+ T-celler. Epigenetiska studier kommer att utföras och tittar på metyleringsprofilen för dessa celler och för att undersöka antitumör-T-cellsvaret både före och efter PD1-hämning.

Studieöversikt

Status

Rekrytering

Detaljerad beskrivning

Varje år diagnostiseras cirka 2 200 barn i USA med neuroblastom, osteosarkom, Ewing-sarkomfamiljen av tumörer (ESFT), retinoblastom, mjukdelssarkom, binjurebarktumörer och levermaligniteter. Dessa aggressiva pediatriska solida tumörer är utvecklingstumörer som initieras under perioder av vävnadstillväxt och morfogenes i nervkammen, ben och mjuka vävnader. Den totala överlevnaden för dessa tumörer i det avancerade stadiet är mindre än 30 %. Trots intensiva ansträngningar under de senaste tre decennierna med användning av flera terapeutiska metoder inklusive kemoterapi, kirurgi, strålning, autologa benmärgstransplantationer och biologiska medel har det skett en blygsam förbättring i den långsiktiga överlevnaden av dessa fasta tumörer hos barn i avancerad stadium. En bättre förståelse för de molekylära, cellulära och genetiska förändringarna som sker i de utvecklande vävnaderna när tumörer bildas kan förbättra behandlingen av dessa förödande cancerformer. Speciellt kan kemoterapeutiska medel vara mer effektivt inriktade på viktiga regulatoriska enzymer eller proteiner om studien hade en bättre förståelse för de vägar som störs när celler utvecklas från preneoplastiska lesioner till metastaserande sjukdom. Det specifika syftet med detta förslag är att identifiera de förändringar i genuttryck som förekommer i neuroblastom, retinoblastom, osteosarkom, Ewing sarkomfamiljen av tumörer [ESFT] och mjukvävnadssarkomceller och att korrelera dessa förändringar med genetiska och cellulära förändringar i tumörcellerna . [RNA] ribonukleinsyra och genomisk [DNA] deoxiribonukleinsyra kommer att isoleras från neuroblastom, retinoblastom, osteosarkom, ESFT [Ewing sarkomfamiljen av tumörer] och mjukdelssarkom (både primära och metastaserande lesioner) efter operation eller benmärgsaspiration av tidigare benmärgsaspiration. patienter. Ytterligare testning kommer att utföras på tumörprover när som helst under eller efter behandlingen där ett kirurgiskt prov erhålls. När det finns tillräckligt med tumörprov kvar efter patologisk analys och banking, kommer färska primära tumörceller att användas för att förbereda ortotopiska xenotransplantat och för att etablera modeller av varje sjukdom som rekapitulerar de avancerade formerna av neuroblastom, osteosarkom, Ewing-sarkomfamiljen av tumörer [ESFT], retinoblastom och mjukdelssarkom. För en liten grupp av dessa överskottsprover kommer denna studie att utföra fixering för elektronmikroskopi och bearbeta proverna för [TEM] transmissionselektronmikroskopanalys. Dessa studier kommer att komplettera vårt aktiva forskningsprogram som karakteriserar de molekylära, cellulära och genetiska egenskaperna hos genetiskt modifierade musmodeller för var och en av dessa sjukdomar. Biologiska prover från kohorten av patienter som behandlas på St. Jude Children's Research Hospital kommer att kompletteras med prover som samlas in och bearbetas av samverkande institutioner runt om i världen. Prover som samlas in från internationella samarbetspartners kommer att användas för analys av [DNA] deoxiribonukleinsyra och [RNA] ribonukleinsyra för att komplettera St. Jude Children's Research Hospital-kohorten. Genom detta samarbete förutser studien att de kommer att kunna erhålla tillräckligt med färska tumörprover för att förbättra sin förståelse av flerstegs tumörbildning i pediatriska solida maligniteter.

Studietyp

Observationell

Inskrivning (Beräknad)

1000

Kontakter och platser

Det här avsnittet innehåller kontaktuppgifter för dem som genomför studien och information om var denna studie genomförs.

Studiekontakt

Studieorter

    • Tennessee
      • Memphis, Tennessee, Förenta staterna, 38105
        • Rekrytering
        • St. Jude Children's Research Hospital
        • Kontakt:
        • Huvudutredare:
          • Sara M. Federico, MD

Deltagandekriterier

Forskare letar efter personer som passar en viss beskrivning, så kallade behörighetskriterier. Några exempel på dessa kriterier är en persons allmänna hälsotillstånd eller tidigare behandlingar.

Urvalskriterier

Åldrar som är berättigade till studier

Inte äldre än 25 år (Barn, Vuxen)

Tar emot friska volontärer

Nej

Testmetod

Sannolikhetsprov

Studera befolkning

Patienter som identifierats vid St. Jude Children's Research Hospital och samarbetsinstitutioner med en misstänkt eller känd diagnos av neuroblastom, osteosarkom, retinoblastom, Ewing-sarkom eller mjukdelssarkom baserad initial diagnostisk upparbetning och tecken på allvarlig sjukdom som kan utskäras.

Beskrivning

Inklusionskriterier:

  • Måste ha en misstänkt eller känd diagnos av neuroblastom, osteosarkom, Ewing-sarkomfamiljen av tumör- eller mjukdelssarkom baserat på den initiala diagnostiska upparbetningen och tecken på en allvarlig sjukdom som är mottaglig för excision. Prover kan tas vid några eller alla av följande tidpunkter: initial biopsi, benmärgsaspirationsprocedurer, tumörresektion och vid tidpunkten för eventuellt återfall.
  • Patienter med diagnosen retinoblastom baserad på initial diagnostisk upparbetning och som kräver enukleering kan inkluderas om det inte finns något aktivt terapeutiskt eller biologiskt protokoll för retinoblastom.
  • Patienten eller hans/hennes vårdnadshavare måste lämna skriftligt informerat samtycke inom 30 dagar efter avlägsnandet av den första insamlingen av vävnad/benmärg/blodprov för detta protokoll.
  • Patienten ses på St. Jude Children's Research Hospital eller på en samverkande institution.
  • Patienter måste vara yngre än eller lika med 25 år vid tidpunkten för inskrivningen.

Exklusions kriterier:

  • Patienten är känd för att vara Hepatit B, Hepatit C och/eller HIV-positiv.

Studieplan

Det här avsnittet ger detaljer om studieplanen, inklusive hur studien är utformad och vad studien mäter.

Hur är studien utformad?

Designdetaljer

Vad mäter studien?

Primära resultatmått

Resultatmått
Tidsram
Utför analys av genuttrycksprofiler. [RNA]-ribonukleinsyra kommer att isoleras från färska frysta tumörprover och hybridiseras till Affymetrix-genexpressionsmatriser.
Tidsram: 5 år
5 år

Sekundära resultatmått

Resultatmått
Tidsram
Utför analys av stora kromosomförändringar såsom amplifieringar och deletioner. [DNA] deoxiribonukleinsyra isolerad från tumören och blodprover kommer att hybridiseras till array [CGH] jämförande genomiska hybridiseringschips.
Tidsram: 5 år
5 år
Utför analys av fokala förändringar i genomet inklusive amplifiering, deletion och förlust av heterozygositet (LOH). DNA isolerat från tumören och blodprover kommer att hybridiseras till [SNP] enkelnukleotidpolymorfismchips.
Tidsram: 5 år
5 år
Utför analys av punktmutationer. DNA isolerat från tumören och blodprover kommer att sekvenseras med hjälp av nästa generations sekvenseringsteknologi för att bestämma sekvensen av hela genomet.
Tidsram: 5 år
5 år
Utför analys av cellmorfologi. Vävnadsprover kommer att fixeras i en buffert lämplig för transmissionselektronmikroskopi och bearbetas för [TEM] transmissionselektronmikroskopanalys.
Tidsram: 5 år
5 år
Jämför mikro-RNA i tumörer. Mikro-RNA kommer att isoleras från den totala [RNA]-ribonukleinsyra som blir över från genuttrycksanalysen som beskrivs ovan. Dessa prover kommer att användas för mikro [RNA] chipanalys eller djup sekvensering.
Tidsram: 5 år
5 år
Jämför epigenetiska modifieringar av [DNA] deoxiribonukleinsyra. Genomiskt DNA kommer att isoleras och DNA-metylering kommer att analyseras över genomet för att avgöra om denna epigenetiska process har förändrats i tumörproverna.
Tidsram: 5 år
5 år
Jämför epigenetiska modifieringar av kromatin. Celler kommer snabbt att fixeras och kromatin kommer att beredas för att direkt sondera protein-DNA-komplex genom [ChIP-seq]kromatinimmunutfällning eller [ChIP-chipanalys] kromatinimmunutfällning
Tidsram: 5 år
5 år
Utför proteinanalys. Tumörceller kommer snabbt att frysas för efterföljande isolering av totalt protein eller specifik fraktion av cellulära proteiner (dvs nukleära, cytoplasmatiska, membranproteiner).
Tidsram: 5 år
5 år
Utför immunhistokemisk och FISH-analys av neuroblastom, osteosarkom, retinoblastom, ESFT och mjukdelssarkom. Vävnadsmikroarrayer kommer att förberedas från prover som samlats in i denna studie.
Tidsram: 5 år
5 år
Cellisolat erhållna från primära och metastatiska tumörprover kommer att användas för att etablera cellinjer och ortotopiska xenotransplantat i immunförsvagade möss.
Tidsram: 5 år
5 år
Utför analys av celltillväxt, metastaser och känslighet för kemoterapi.
Tidsram: 5 år
5 år
Utvärdera omfattningen av immuncellsinfiltration och deras funktionella status i pediatriska solida tumörer med hjälp av flödescytometrisk analys av färska tumörprover.
Tidsram: 5 år
5 år
Utvärdera tumörassocierade makrofager (TAMS) efter terapi för att lokalisera genuttrycksmönster, markörer och funktionella korrelat av vävnadsreparationsegenskaperna hos makrofager i mikromiljön efter terapi.
Tidsram: 5 år
5 år

Samarbetspartners och utredare

Det är här du hittar personer och organisationer som är involverade i denna studie.

Utredare

  • Huvudutredare: Sara M. Federico, MD, St. Jude Children's Research Hospital

Publikationer och användbara länkar

Den som ansvarar för att lägga in information om studien tillhandahåller frivilligt dessa publikationer. Dessa kan handla om allt som har med studien att göra.

Studieavstämningsdatum

Dessa datum spårar framstegen för inlämningar av studieposter och sammanfattande resultat till ClinicalTrials.gov. Studieposter och rapporterade resultat granskas av National Library of Medicine (NLM) för att säkerställa att de uppfyller specifika kvalitetskontrollstandarder innan de publiceras på den offentliga webbplatsen.

Studera stora datum

Studiestart (Faktisk)

10 februari 2010

Primärt slutförande (Beräknad)

30 september 2026

Avslutad studie (Beräknad)

30 september 2026

Studieregistreringsdatum

Först inskickad

14 januari 2010

Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna

14 januari 2010

Första postat (Beräknad)

15 januari 2010

Uppdateringar av studier

Senaste uppdatering publicerad (Beräknad)

12 november 2025

Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna

7 november 2025

Senast verifierad

1 november 2025

Mer information

Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .

Prenumerera