- ICH GCP
- Amerikanska kliniska prövningsregistret
- Klinisk prövning NCT01050296
Molekylär analys av fasta tumörer (MAST)
Denna studie kommer att prospektivt karakterisera de molekylära, cellulära och genetiska egenskaperna hos primära och metastaserande neuroblastom, osteosarkom, retinoblastom, Ewing-sarkomfamiljen av tumörer, mjukdelssarkom, binjurebarktumörer och levermaligniteter. Dessa cellisolat kommer att användas för genuttrycksarrayanalys, genomisk analys med [SNP] enkelnukleotidpolymorfismchip, array [CGH] jämförande genomisk hybridisering och nästa generations sekvensering och [TEM] transmissionselektronmikroskopanalys. Dessutom kommer cellinjer och ortotopiska xenotransplantat att skapas från de erhållna tumörproverna.
Specificiteten för TCR kommer att undersökas genom att jämföra parad TCR från perifert blod och tumörinfiltrerande CD4+ och CD8+ T-celler. Epigenetiska studier kommer att utföras och tittar på metyleringsprofilen för dessa celler och för att undersöka antitumör-T-cellsvaret både före och efter PD1-hämning.
Studieöversikt
Status
Betingelser
Detaljerad beskrivning
Studietyp
Inskrivning (Beräknad)
Kontakter och platser
Studiekontakt
- Namn: Sara M. Federico, MD
- Telefonnummer: 1-866-278-5833
- E-post: referralinfo@stjude.org
Studieorter
-
-
Tennessee
-
Memphis, Tennessee, Förenta staterna, 38105
- Rekrytering
- St. Jude Children's Research Hospital
-
Kontakt:
- Sara M. Federico, MD
- Telefonnummer: 866-278-5833
- E-post: referralinfo@stjude.org
-
Huvudutredare:
- Sara M. Federico, MD
-
-
Deltagandekriterier
Urvalskriterier
Åldrar som är berättigade till studier
Tar emot friska volontärer
Testmetod
Studera befolkning
Beskrivning
Inklusionskriterier:
- Måste ha en misstänkt eller känd diagnos av neuroblastom, osteosarkom, Ewing-sarkomfamiljen av tumör- eller mjukdelssarkom baserat på den initiala diagnostiska upparbetningen och tecken på en allvarlig sjukdom som är mottaglig för excision. Prover kan tas vid några eller alla av följande tidpunkter: initial biopsi, benmärgsaspirationsprocedurer, tumörresektion och vid tidpunkten för eventuellt återfall.
- Patienter med diagnosen retinoblastom baserad på initial diagnostisk upparbetning och som kräver enukleering kan inkluderas om det inte finns något aktivt terapeutiskt eller biologiskt protokoll för retinoblastom.
- Patienten eller hans/hennes vårdnadshavare måste lämna skriftligt informerat samtycke inom 30 dagar efter avlägsnandet av den första insamlingen av vävnad/benmärg/blodprov för detta protokoll.
- Patienten ses på St. Jude Children's Research Hospital eller på en samverkande institution.
- Patienter måste vara yngre än eller lika med 25 år vid tidpunkten för inskrivningen.
Exklusions kriterier:
- Patienten är känd för att vara Hepatit B, Hepatit C och/eller HIV-positiv.
Studieplan
Hur är studien utformad?
Designdetaljer
Vad mäter studien?
Primära resultatmått
Resultatmått |
Tidsram |
|---|---|
|
Utför analys av genuttrycksprofiler. [RNA]-ribonukleinsyra kommer att isoleras från färska frysta tumörprover och hybridiseras till Affymetrix-genexpressionsmatriser.
Tidsram: 5 år
|
5 år
|
Sekundära resultatmått
Resultatmått |
Tidsram |
|---|---|
|
Utför analys av stora kromosomförändringar såsom amplifieringar och deletioner. [DNA] deoxiribonukleinsyra isolerad från tumören och blodprover kommer att hybridiseras till array [CGH] jämförande genomiska hybridiseringschips.
Tidsram: 5 år
|
5 år
|
|
Utför analys av fokala förändringar i genomet inklusive amplifiering, deletion och förlust av heterozygositet (LOH). DNA isolerat från tumören och blodprover kommer att hybridiseras till [SNP] enkelnukleotidpolymorfismchips.
Tidsram: 5 år
|
5 år
|
|
Utför analys av punktmutationer. DNA isolerat från tumören och blodprover kommer att sekvenseras med hjälp av nästa generations sekvenseringsteknologi för att bestämma sekvensen av hela genomet.
Tidsram: 5 år
|
5 år
|
|
Utför analys av cellmorfologi. Vävnadsprover kommer att fixeras i en buffert lämplig för transmissionselektronmikroskopi och bearbetas för [TEM] transmissionselektronmikroskopanalys.
Tidsram: 5 år
|
5 år
|
|
Jämför mikro-RNA i tumörer. Mikro-RNA kommer att isoleras från den totala [RNA]-ribonukleinsyra som blir över från genuttrycksanalysen som beskrivs ovan. Dessa prover kommer att användas för mikro [RNA] chipanalys eller djup sekvensering.
Tidsram: 5 år
|
5 år
|
|
Jämför epigenetiska modifieringar av [DNA] deoxiribonukleinsyra. Genomiskt DNA kommer att isoleras och DNA-metylering kommer att analyseras över genomet för att avgöra om denna epigenetiska process har förändrats i tumörproverna.
Tidsram: 5 år
|
5 år
|
|
Jämför epigenetiska modifieringar av kromatin. Celler kommer snabbt att fixeras och kromatin kommer att beredas för att direkt sondera protein-DNA-komplex genom [ChIP-seq]kromatinimmunutfällning eller [ChIP-chipanalys] kromatinimmunutfällning
Tidsram: 5 år
|
5 år
|
|
Utför proteinanalys. Tumörceller kommer snabbt att frysas för efterföljande isolering av totalt protein eller specifik fraktion av cellulära proteiner (dvs nukleära, cytoplasmatiska, membranproteiner).
Tidsram: 5 år
|
5 år
|
|
Utför immunhistokemisk och FISH-analys av neuroblastom, osteosarkom, retinoblastom, ESFT och mjukdelssarkom. Vävnadsmikroarrayer kommer att förberedas från prover som samlats in i denna studie.
Tidsram: 5 år
|
5 år
|
|
Cellisolat erhållna från primära och metastatiska tumörprover kommer att användas för att etablera cellinjer och ortotopiska xenotransplantat i immunförsvagade möss.
Tidsram: 5 år
|
5 år
|
|
Utför analys av celltillväxt, metastaser och känslighet för kemoterapi.
Tidsram: 5 år
|
5 år
|
|
Utvärdera omfattningen av immuncellsinfiltration och deras funktionella status i pediatriska solida tumörer med hjälp av flödescytometrisk analys av färska tumörprover.
Tidsram: 5 år
|
5 år
|
|
Utvärdera tumörassocierade makrofager (TAMS) efter terapi för att lokalisera genuttrycksmönster, markörer och funktionella korrelat av vävnadsreparationsegenskaperna hos makrofager i mikromiljön efter terapi.
Tidsram: 5 år
|
5 år
|
Samarbetspartners och utredare
Samarbetspartners
Utredare
- Huvudutredare: Sara M. Federico, MD, St. Jude Children's Research Hospital
Publikationer och användbara länkar
Användbara länkar
Studieavstämningsdatum
Studera stora datum
Studiestart (Faktisk)
Primärt slutförande (Beräknad)
Avslutad studie (Beräknad)
Studieregistreringsdatum
Först inskickad
Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna
Första postat (Beräknad)
Uppdateringar av studier
Senaste uppdatering publicerad (Beräknad)
Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna
Senast verifierad
Mer information
Termer relaterade till denna studie
Nyckelord
Ytterligare relevanta MeSH-villkor
- Neoplasmer efter plats
- Neoplasmer
- Neoplasmer efter histologisk typ
- Ögonsjukdomar
- Neoplasmer, körtel och epitel
- Ögonsjukdomar, ärftliga
- Neoplasmer, neuroepitelial
- Neuroektodermala tumörer
- Neoplasmer, könsceller och embryonala
- Neoplasmer, nervvävnad
- Neoplasmer, bindväv och mjukvävnad
- Neuroektodermala tumörer, primitiva, perifera
- Neuroektodermala tumörer, primitiva
- Neoplasmer, benvävnad
- Neoplasmer, bindväv
- Neoplasmer, muskelvävnad
- Myosarkom
- Ögonneoplasmer
- Näthinnesjukdomar
- Retinala neoplasmer
- Neuroblastom
- Sarkom, Ewing
- Sarkom
- Rabdomyosarkom
- Osteosarkom
- Retinoblastom
Andra studie-ID-nummer
- MAST
- DOD-W81XWH-14-1-0103(CA130396) (Annat bidrag/finansieringsnummer: DOD-Department of the Army)
Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument
Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt
Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt
Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .