Denne side blev automatisk oversat, og nøjagtigheden af ​​oversættelsen er ikke garanteret. Der henvises til engelsk version for en kildetekst.

Molekylær analyse af faste tumorer (MAST)

28. august 2023 opdateret af: St. Jude Children's Research Hospital

Denne undersøgelse vil prospektivt karakterisere de molekylære, cellulære og genetiske egenskaber af primært og metastatisk neuroblastom, osteosarkom, retinoblastom, Ewing-sarkomfamilien af ​​tumorer, bløddelssarkomer, binyrebarktumorer og levermaligniteter. Disse celleisolater vil blive brugt til genekspression array analyse, genomisk analyse af [SNP] enkelt nucleotid polymorphism chip, array [CGH] komparativ genomisk hybridisering og næste generation sekventering og [TEM] transmission elektron mikroskopi analyse. Derudover vil cellelinjer og ortotopiske xenografter blive skabt ud fra de opnåede tumorprøver.

Specificiteten af ​​TCR'er vil blive undersøgt ved at sammenligne parret TCR fra perifert blod og tumorinfiltrerende CD4+ og CD8+ T-celler. Epigenetiske undersøgelser vil blive udført, hvor man ser på methyleringsprofilen af ​​disse celler og for at undersøge antitumor-T-celle-responsen både præ- og post-PD1-hæmning.

Studieoversigt

Status

Rekruttering

Detaljeret beskrivelse

Hvert år bliver cirka 2.200 børn i USA diagnosticeret med neuroblastom, osteosarkom, Ewing-sarkomfamilien af ​​tumorer (ESFT), retinoblastom, bløddelssarkomer, binyrebark-tumorer og levermaligniteter. Disse aggressive pædiatriske solide tumorer er udviklingsmæssige tumorer, der initieres i perioder med vævsvækst og morfogenese i neurale kam, knogler og blødt væv. Den samlede overlevelsesrate for disse tumorer i det fremskredne stadie er mindre end 30 %. På trods af intensiv indsats i løbet af de sidste tre årtier med brug af flere terapeutiske modaliteter, herunder kemoterapi, kirurgi, stråling, autolog knoglemarvstransplantation og biologiske midler, er der sket en beskeden forbedring i den langsigtede overlevelse af disse fremskredne pædiatriske solide tumorer. En bedre forståelse af de molekylære, cellulære og genetiske ændringer, der opstår i det udviklende væv, når tumorer dannes, kunne forbedre behandlingen af ​​disse ødelæggende kræftformer. Især kan kemoterapeutiske midler være mere effektivt målrettet mod centrale regulatoriske enzymer eller proteiner, hvis undersøgelsen havde en bedre forståelse af de veje, der forstyrres, når celler udvikler sig fra præneoplastiske læsioner til metastatisk sygdom. Det specifikke formål med dette forslag er at identificere de ændringer i genekspression, der forekommer i neuroblastom, retinoblastom, osteosarkom, Ewing-sarkomfamilien af ​​tumorer [ESFT] og bløddelssarkomceller og at korrelere disse ændringer med genetiske og cellulære ændringer i tumorcellerne . [RNA] ribonukleinsyre og genomisk [DNA] deoxyribonukleinsyre vil blive isoleret fra neuroblastom, retinoblastom, osteosarkom, ESFT [Ewing sarkomfamilie af tumorer] og bløddelssarkomer (både primære og metastatiske læsioner) efter operation eller knoglemarvsaspiration af tidligere ubehandlet aspiration. patienter. Yderligere testning vil blive udført på tumorprøver på ethvert tidspunkt under eller efter behandlingen, hvor en kirurgisk prøve tages. Når der er tilstrækkelig tumorprøve tilbage efter patologisk analyse og banking, vil friske primære tumorceller blive brugt til at forberede ortotopiske xenotransplantater og til at etablere modeller af hver sygdom, der rekapitulerer de fremskredne former for neuroblastom, osteosarkom, Ewing sarkom familie af tumorer [ESFT], retinoblastom og bløddelssarkomer. For en lille gruppe af disse overskydende prøver vil denne undersøgelse udføre fiksering til elektronmikroskopi og behandle prøverne til [TEM] transmissionselektronmikroskopianalyse. Disse undersøgelser vil komplementere vores aktive forskningsprogram, der karakteriserer de molekylære, cellulære og genetiske egenskaber ved gensplejsede musemodeller for hver af disse sygdomme. Biologiske prøver fra kohorten af ​​patienter behandlet på St. Jude Children's Research Hospital vil blive suppleret med prøver indsamlet og behandlet af samarbejdende institutioner rundt om i verden. Prøver indsamlet fra internationale samarbejdspartnere vil blive brugt til analyse af [DNA] deoxyribonukleinsyre og [RNA] ribonukleinsyre for at komplementere St. Jude Children's Research Hospital-kohorten. Gennem dette samarbejde forudser undersøgelsen, at de vil være i stand til at få nok friske tumorprøver til at forbedre deres forståelse af flertrins tumorgenese i pædiatriske solide maligniteter.

Undersøgelsestype

Observationel

Tilmelding (Anslået)

1000

Kontakter og lokationer

Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.

Studiekontakt

Studiesteder

    • Tennessee
      • Memphis, Tennessee, Forenede Stater, 38105
        • Rekruttering
        • St. Jude Children's Research Hospital
        • Kontakt:
        • Ledende efterforsker:
          • Sara M. Federico, MD

Deltagelseskriterier

Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.

Berettigelseskriterier

Aldre berettiget til at studere

Ikke ældre end 25 år (Barn, Voksen)

Tager imod sunde frivillige

Ingen

Prøveudtagningsmetode

Sandsynlighedsprøve

Studiebefolkning

Patienter identificeret på St. Jude Children's Research Hospital og samarbejdsinstitutioner med en formodet eller kendt diagnose af neuroblastom, osteosarkom, retinoblastom, Ewing sarkom eller bløddelssarkom baseret indledende diagnostisk oparbejdning og tegn på grov sygdom, der er modtagelig for excision.

Beskrivelse

Inklusionskriterier:

  • Skal have en formodet eller kendt diagnose af neuroblastom, osteosarkom, Ewing-sarkomfamilien af ​​tumor- eller bløddelssarkom baseret på den indledende diagnostiske undersøgelse og tegn på grov sygdom, der er modtagelig for excision. Prøver kan tages på nogle eller alle af følgende tidspunkter: initial biopsi, knoglemarvsaspirationsprocedurer, tumorresektion og på tidspunktet for muligt tilbagefald.
  • Patienter med en diagnose retinoblastom baseret på indledende diagnostisk oparbejdning, og som kræver enucleation, kan tilmeldes, hvis der ikke er nogen aktiv terapeutisk eller biologisk protokol for retinoblastom.
  • Patienten eller hans/hendes værge skal, alt efter hvad der er relevant, give skriftligt informeret samtykke inden for 30 dage efter fjernelse af den første indsamling af væv/knoglemarv/blodprøve til denne protokol.
  • Patienten tilses på St. Jude Børneforskningshospital eller på en samarbejdsinstitution.
  • Patienter skal være mindre end eller lig med 25 år på indskrivningstidspunktet.

Ekskluderingskriterier:

  • Patienten er kendt for at være hepatitis B, hepatitis C og/eller HIV-positiv.

Studieplan

Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.

Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?

Design detaljer

Hvad måler undersøgelsen?

Primære resultatmål

Resultatmål
Tidsramme
Udfør analyse af genekspressionsprofiler. [RNA]-ribonukleinsyre vil blive isoleret fra frisk frosne tumorprøver og hybridiseret til Affymetrix-genekspressionsarrays.
Tidsramme: 5 år
5 år

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Tidsramme
Udfør analyse af store kromosomale ændringer såsom amplifikationer og deletioner. [DNA] deoxyribonukleinsyre isoleret fra tumoren og blodprøver vil blive hybridiseret til array [CGH] komparative genomiske hybridiseringschips.
Tidsramme: 5 år
5 år
Udfør analyse af fokale ændringer i genomet, herunder amplifikation, deletion og tab af heterozygositet (LOH). DNA isoleret fra tumoren og blodprøver vil blive hybridiseret til [SNP] single nucleotid polymorphism chips.
Tidsramme: 5 år
5 år
Udfør analyse af punktmutationer. DNA isoleret fra tumoren og blodprøver vil blive sekventeret ved hjælp af næste generations sekventeringsteknologi for at bestemme sekvensen af ​​hele genomet.
Tidsramme: 5 år
5 år
Udfør analyse af cellemorfologi. Vævsprøver vil blive fikseret i en buffer, der er egnet til transmissionselektronmikroskopi og behandlet til [TEM] transmissionselektronmikroskopianalyse.
Tidsramme: 5 år
5 år
Sammenlign mikro-RNA'er i tumorer. Mikro-RNA'er vil blive isoleret fra den totale [RNA]-ribonukleinsyre, der er tilbage fra genekspressionsanalysen beskrevet ovenfor. Disse prøver vil blive brugt til mikro [RNA] chipanalyse eller dyb sekventering.
Tidsramme: 5 år
5 år
Sammenlign epigenetiske modifikationer af [DNA] deoxyribonukleinsyre. Genomisk DNA vil blive isoleret, og DNA-methylering vil blive analyseret på tværs af genomet for at bestemme, om denne epigenetiske proces er ændret i tumorprøverne.
Tidsramme: 5 år
5 år
Sammenlign epigenetiske modifikationer af kromatin. Celler vil blive hurtigt fikseret, og kromatin vil blive fremstillet for direkte at probe protein-DNA-komplekser ved [ChIP-seq]chromatin immunopræcipitation eller [ChIP-chip analyse] kromatin immunopræcipitation
Tidsramme: 5 år
5 år
Udfør proteinanalyse. Tumorceller vil hurtigt blive frosset til efterfølgende isolering af totalt protein eller specifik fraktion af cellulære proteiner (dvs. nukleare, cytoplasmatiske, membranproteiner).
Tidsramme: 5 år
5 år
Udfør immunhistokemisk og FISH-analyse af neuroblastom, osteosarkom, retinoblastom, ESFT og bløddelssarkomer. Vævsmikroarrays vil blive fremstillet ud fra prøver indsamlet i denne undersøgelse.
Tidsramme: 5 år
5 år
Celleisolater opnået fra primære og metastatiske tumorprøver vil blive brugt til at etablere cellelinjer og ortotopiske xenografter i immunkompromitterede mus.
Tidsramme: 5 år
5 år
Udfør analyse af cellevækst, metastaser og følsomhed over for kemoterapi.
Tidsramme: 5 år
5 år
Evaluer omfanget af immuncelleinfiltration og deres funktionelle status i pædiatriske solide tumorer ved hjælp af flowcytometrisk analyse af friske tumorprøver.
Tidsramme: 5 år
5 år
Evaluer tumorassocierede makrofager (TAMS'er) efter terapi for at lokalisere genekspressionsmønstre, markører og funktionelle korrelater af makrofagers vævsreparationsegenskaber i post-terapi mikromiljøet.
Tidsramme: 5 år
5 år

Samarbejdspartnere og efterforskere

Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.

Efterforskere

  • Ledende efterforsker: Sara M. Federico, MD, St. Jude Children's Research Hospital

Publikationer og nyttige links

Den person, der er ansvarlig for at indtaste oplysninger om undersøgelsen, leverer frivilligt disse publikationer. Disse kan handle om alt relateret til undersøgelsen.

Datoer for undersøgelser

Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.

Studer store datoer

Studiestart (Faktiske)

10. februar 2010

Primær færdiggørelse (Anslået)

30. september 2024

Studieafslutning (Anslået)

30. september 2024

Datoer for studieregistrering

Først indsendt

14. januar 2010

Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier

14. januar 2010

Først opslået (Anslået)

15. januar 2010

Opdateringer af undersøgelsesjournaler

Sidste opdatering sendt (Faktiske)

29. august 2023

Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier

28. august 2023

Sidst verificeret

1. august 2023

Mere information

Begreber relateret til denne undersøgelse

Yderligere relevante MeSH-vilkår

Andre undersøgelses-id-numre

  • MAST
  • DOD-W81XWH-14-1-0103(CA130396) (Andet bevillings-/finansieringsnummer: DOD-Department of the Army)

Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter

Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt

Ingen

Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt

Ingen

Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .

Kliniske forsøg med Pædiatriske solide tumorer

3
Abonner