胃酸对结肠微生物组的影响

结肠微生物组对人类健康和疾病至关重要。 艰难梭菌相关性腹泻 (CDAD) 是一种高度病态的感染性腹泻，由抗生素引起，抗生素会扰乱微生物组并使艰难梭菌增殖。 质子泵抑制剂 (PPI) 是胃酸的强效抑制剂，是美国最常用的药物之一。 数十项观察性研究表明，长期使用 PPI 与 CDAD 相关。 然而，PPI 引起 CDAD 的机制尚不清楚。 我们认为 PPI 通过诱导人类结肠微生物组的改变来引起 CDAD。 我们将使用非盲、单臂研究设计来确认或反驳 PPI 与 CDAD 之间关联的假设机制。 我们将使用人粪便样本中细菌 16S 核糖体亚基基因的高变 V4 区的焦磷酸测序来描述结肠菌群。 我们将在给予不同持续时间的 PPI 之前和之后收集志愿者的粪便样本，并测试微生物组以确定 1) PPI 是否会降低总体多样性，2) PPI 是否会降低拟杆菌的相对丰度，3) PPI 持续时间的延长是否会影响多样性，以及4) 在完成规定的 PPI 课程后是否恢复了多样性。 我们认为 PPI 会导致整体微生物组多样性减少和厌氧菌减少的模式——与使用抗生素后看到的模式相同。 此外，我们认为增加 PPI 持续时间将进一步减少多样性，并且微生物组将在 PPI 停止后恢复到 PPI 前的多样性水平。 这些结果将促进基于生物学的临床干预，以降低需要抑制酸的患者的 CDAD 发生率。