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Effets de l'acide gastrique sur le microbiome colique

22 juillet 2024 mis à jour par: Daniel Freedberg, MD

Les effets de la suppression de l'acide gastrique sur le microbiome colique

Le microbiome colique est essentiel à la santé et à la maladie humaines. La diarrhée associée à Clostridium difficile (CDAD), une forme très morbide de diarrhée infectieuse, est causée par des antibiotiques qui perturbent le microbiome et permettent à C. difficile de proliférer. Les inhibiteurs de la pompe à protons (IPP) sont de puissants suppresseurs de l'acide gastrique et comptent parmi les médicaments les plus courants aux États-Unis. Des dizaines d'études observationnelles montrent que l'utilisation à long terme d'IPP est associée à la DACD. Cependant, le mécanisme par lequel les IPP causent la CDAD est inconnu. Nous croyons que les IPP causent la CDAD en induisant des altérations du microbiome colique humain. Nous confirmerons ou réfuterons le mécanisme hypothétique de l'association entre les IPP et la DACD en utilisant un plan d'étude à un bras sans insu. Nous utiliserons le pyroséquençage de la région V4 hypervariable du gène bactérien de la sous-unité ribosomique 16S dans des échantillons fécaux humains pour décrire la flore colique. Nous collecterons des échantillons fécaux de volontaires avant et après les IPP administrés pour différentes durées et testerons le microbiome pour déterminer 1) si les IPP diminuent la diversité globale, 2) si les IPP diminuent l'abondance relative des Bacteroidetes, 3) si l'augmentation de la durée des IPP affecte la diversité, et 4) s'il y a récupération de la diversité après avoir terminé un cours défini d'IPP. Nous pensons que les IPP entraîneront un schéma de diminution de la diversité globale du microbiome et une réduction des anaérobies - le même schéma que celui observé après l'utilisation d'antibiotiques. De plus, nous pensons que l'augmentation de la durée des IPP réduira davantage la diversité et que le microbiome reviendra aux niveaux de diversité pré-IPP après l'arrêt des IPP. Ces résultats faciliteront les interventions cliniques fondées sur la biologie pour réduire les taux de DACD chez les patients nécessitant une suppression de l'acide.

Aperçu de l'étude

Statut

Complété

Les conditions

Intervention / Traitement

Description détaillée

Conception de l'étude Nous recruterons 12 volontaires adultes pour une étude croisée d'une durée totale de 12 semaines. Les sujets seront observés hors IPP pendant 4 semaines, puis seront placés sous IPP pendant 4 semaines. Par la suite, les sujets seront randomisés pour recevoir 4 semaines supplémentaires d'IPP ou aucun traitement. Des échantillons de selles seront prélevés à 4 moments distincts.

Résultats de l'étude et analyses statistiques Le résultat principal sera le changement de la diversité globale de la flore fécale après 4 semaines d'IPP par rapport à 4 semaines sans suppression d'acide. Les résultats supplémentaires à évaluer comprennent l'effet des IPP sur l'abondance relative des Bacteroidetes à la semaine 4 et le changement de la diversité de la flore fécale à la semaine 8.

Type d'étude

Interventionnel

Inscription (Réel)

14

Phase

  • Phase 4

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Lieux d'étude

  • États-Unis
    • New York
      • New York, New York, États-Unis, 10032
        • Columbia University

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

18 ans et plus (Adulte, Adulte plus âgé)

Accepte les volontaires sains

Oui

La description

Critère d'intégration:

  • 18 ans ou plus
  • Capable de donner un consentement éclairé

Critère d'exclusion:

  • Utilisation d'antibiotiques systémiques au cours de l'année écoulée
  • Utilisation de médicaments antiacides (IPP ou antagonistes des récepteurs H2) au cours de la dernière année (antiacides autorisés si plus d'un mois à compter de la date d'inscription)
  • Antécédents de maladie chronique de la muqueuse gastro-intestinale (par ex. maladie intestinale inflammatoire, maladie coeliaque, colite microscopique)
  • Toute morbidité majeure cliniquement significative ou non contrôlée, y compris, mais sans s'y limiter, une maladie cardiaque ou respiratoire grave ou le VIH non contrôlé
  • Fréquence intestinale anormale (minimum une fois tous les 2 jours, maximum 3 fois par jour)
  • Utilisation de clopidogrel ou de médicaments ayant une interaction significative potentielle avec les IPP
  • Ostéoporose ou antécédent de fracture osseuse non traumatique
  • Antécédents de réactions indésirables aux IPP
  • Initiation de tout nouveau médicament dans le mois précédant l'inscription
  • Grossesse
  • Incapacité à donner un consentement éclairé

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

  • Objectif principal: Science basique
  • Répartition: N / A
  • Modèle interventionnel: Affectation à un seul groupe
  • Masquage: Aucun (étiquette ouverte)

Armes et Interventions

Groupe de participants / Bras
Intervention / Traitement
Expérimental: Oméprazole 40 mg bid x 4-8 semaines
Voir la description de l'étude pour plus de détails.
Médicament: Oméprazole 40 mg bid
Comme ci-dessus.
Autres noms:
  • Nom de marque: Prilosec

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Indice de diversité de Shannon mesurant le changement dans la diversité du microbiome
Délai: Référence (semaine 0), semaine 4, semaine 8

Afin d'évaluer la diversité du microbiome colique, l'indice de diversité de Shannon sera calculé pour chaque sujet :

  • Après quatre semaines sans suppression d'acide (semaine 0 vs semaine 4)
  • Après quatre semaines d'IPP deux fois par jour (semaine 4 vs. Semaine 8)

L'indice de diversité de Shannon est une mesure mathématique de la diversité des espèces dans une communauté donnée. L'indice de Shannon est calculé comme suit : -∑[(pi)×ln(pi)] où H est l'indice de diversité de Shannon et pi est la proportion d'individus de la i-ème espèce dans l'ensemble d'une communauté. La valeur minimale de l'indice de diversité de Shannon est 0, ce qui indique qu'il n'y a pas de diversité : une seule espèce se trouve dans cet habitat. Il n’y a pas de limite supérieure à l’indice de Shannon. Plus la valeur de H est élevée, plus la diversité des espèces dans une communauté particulière est élevée.
Référence (semaine 0), semaine 4, semaine 8

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Parrainer

Daniel Freedberg, MD

Les enquêteurs

  • Chercheur principal: Julian A Abrams, MD, MS, Columbia University

Publications et liens utiles

La personne responsable de la saisie des informations sur l'étude fournit volontairement ces publications. Il peut s'agir de tout ce qui concerne l'étude.

Publications générales

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude

1 août 2013

Achèvement primaire (Réel)

1 mars 2015

Achèvement de l'étude (Réel)

1 mars 2015

Dates d'inscription aux études

Première soumission

12 juillet 2013

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

15 juillet 2013

Première publication (Estimé)

17 juillet 2013

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

15 août 2024

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

22 juillet 2024

Dernière vérification

1 juillet 2024

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Mots clés

Termes MeSH pertinents supplémentaires

Autres numéros d'identification d'étude

  • AAAL3307

Plan pour les données individuelles des participants (IPD)

Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?

NON

Description du régime IPD

Reportez-vous aux résultats de l’étude publiés pour obtenir des données récapitulatives.

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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