Effekter av magesyre på kolonmikrobiom

Kolonmikrobiomet er essensielt for menneskers helse og sykdom. Clostridium difficile-assosiert diaré (CDAD), en svært sykelig form for smittsom diaré, er forårsaket av antibiotika som forstyrrer mikrobiomet og lar C. difficile spre seg. Protonpumpehemmere (PPI) er kraftige undertrykkere av magesyre og blant de vanligste medisinene i USA. Dusinvis av observasjonsstudier viser at langvarig PPI-bruk er assosiert med CDAD. Mekanismen som PPI forårsaker CDAD er imidlertid ukjent. Vi tror at PPI forårsaker CDAD ved å indusere endringer i det menneskelige kolonmikrobiomet. Vi vil bekrefte eller avkrefte den hypotesemekanismen for assosiasjonen mellom PPIer og CDAD ved å bruke et ublindet, enarmet studiedesign. Vi vil bruke pyrosekvensering av den hypervariable V4-regionen til det bakterielle 16S ribosomale underenhetsgenet i humane fekale prøver for å beskrive kolonfloraen. Vi vil samle inn fekale prøver fra frivillige før og etter PPI gitt for forskjellige varigheter og teste mikrobiomet for å bestemme 1) om PPI reduserer det totale mangfoldet, 2) om PPI reduserer relativ overflod av Bacteroidetes, 3) om økt varighet av PPI påvirker mangfoldet, og 4) om det er gjenoppretting av mangfold etter å ha fullført et definert kurs med PPI. Vi tror at PPI-er vil forårsake et mønster av redusert samlet mikrobiom-diversitet og reduserte anaerober - det samme mønsteret sett etter bruk av antibiotika. Videre tror vi at økt PPI-varighet vil redusere mangfoldet ytterligere og at mikrobiomet vil gå tilbake til pre-PPI-nivåer av mangfold etter at PPI er stoppet. Disse resultatene vil lette biologisk-baserte kliniske intervensjoner for å redusere forekomsten av CDAD blant pasienter som trenger syreundertrykkelse.