Влияние желудочной кислоты на микробиом толстой кишки

Микробиом толстой кишки имеет важное значение для здоровья и болезней человека. Clostridium difficile-ассоциированная диарея (CDAD), крайне болезненная форма инфекционной диареи, вызывается антибиотиками, которые нарушают микробиом и способствуют размножению C. difficile. Ингибиторы протонной помпы (ИПП) являются мощными подавителями желудочной кислоты и одними из самых распространенных лекарств в Соединенных Штатах. Десятки обсервационных исследований показывают, что длительное использование ИПП связано с CDAD. Однако механизм, с помощью которого ИПП вызывают CDAD, неизвестен. Мы считаем, что ИПП вызывают CDAD, вызывая изменения в микробиоме толстой кишки человека. Мы подтвердим или опровергнем предполагаемый механизм связи между ИПП и CDAD, используя дизайн неслепого одногруппового исследования. Мы будем использовать пиросеквенирование гипервариабельной области V4 бактериального гена рибосомной субъединицы 16S в образцах фекалий человека для описания флоры толстой кишки. Мы соберем образцы фекалий у добровольцев до и после применения ИПП в течение разной продолжительности и проверим микробиом, чтобы определить 1) уменьшают ли ИПП общее разнообразие, 2) уменьшают ли ИПП относительную численность Bacteroidetes, 3) влияет ли увеличение продолжительности приема ИПП на разнообразие и 4) происходит ли восстановление разнообразия после прохождения определенного курса ИПП. Мы полагаем, что ИПП вызовут снижение общего разнообразия микробиома и снижение количества анаэробов — та же картина, наблюдаемая после использования антибиотиков. Кроме того, мы считаем, что увеличение продолжительности ИПП еще больше уменьшит разнообразие и что микробиом вернется к уровням разнообразия, существовавшим до ИПП, после прекращения приема ИПП. Эти результаты облегчат биологически обоснованные клинические вмешательства для снижения частоты CDAD среди пациентов, которым требуется подавление кислотности.