Effekter av magsyra på kolonmikrobiom

Kolonmikrobiomet är avgörande för människors hälsa och sjukdomar. Clostridium difficile-associerad diarré (CDAD), en mycket sjuklig form av infektiös diarré, orsakas av antibiotika som stör mikrobiomet och tillåter C. difficile att föröka sig. Protonpumpshämmare (PPI) är kraftfulla dämpare av magsyra och bland de vanligaste läkemedlen i USA. Dussintals observationsstudier visar att långvarig PPI-användning är associerad med CDAD. Mekanismen genom vilken PPI orsakar CDAD är dock okänd. Vi tror att PPI orsakar CDAD genom att inducera förändringar i det mänskliga kolonmikrobiomet. Vi kommer att bekräfta eller motbevisa den hypotesiska mekanismen för sambandet mellan PPI och CDAD med hjälp av en oblindad, enarmad studiedesign. Vi kommer att använda pyrosekvensering av den hypervariabla V4-regionen av den bakteriella 16S ribosomala subenhetsgenen i mänskliga fekala prover för att beskriva kolonfloran. Vi kommer att samla in fekala prover från frivilliga före och efter PPI som ges under olika varaktigheter och testa mikrobiomet för att avgöra 1) om PPI minskar den totala mångfalden, 2) om PPI minskar den relativa mängden Bacteroidetes, 3) om ökad varaktighet av PPI påverkar mångfalden, och 4) om det finns återhämtning av mångfald efter att ha genomfört en definierad kurs av PPI. Vi tror att PPI kommer att orsaka ett mönster av minskad total mikrobiomdiversitet och minskade anaerober - samma mönster som ses efter användning av antibiotika. Dessutom tror vi att ökad PPI-varaktighet ytterligare kommer att minska mångfalden och att mikrobiomet kommer att återgå till pre-PPI-nivåer av mångfald efter att PPI stoppas. Dessa resultat kommer att underlätta biologiskt baserade kliniska insatser för att minska frekvensen av CDAD bland patienter som kräver syradämpning.