Mahahapon vaikutukset paksusuolen mikrobiomiin

Paksusuolen mikrobiomi on välttämätön ihmisten terveydelle ja sairauksille. Clostridium difficilen aiheuttama ripuli (CDAD), erittäin sairaalloinen tarttuvan ripulin muoto, johtuu antibiooteista, jotka häiritsevät mikrobiomia ja mahdollistavat C. difficilen lisääntymisen. Protonipumpun estäjät (PPI:t) ovat tehokkaita mahahapon suppressoreita ja yksi yleisimmistä lääkkeistä Yhdysvalloissa. Kymmenet havaintotutkimukset osoittavat, että pitkäaikainen PPI-käyttö liittyy CDAD:hen. Mekanismia, jolla PPI:t aiheuttavat CDAD:n, ei kuitenkaan tunneta. Uskomme, että PPI:t aiheuttavat CDAD:ta indusoimalla muutoksia ihmisen paksusuolen mikrobiomissa. Vahvistamme tai kumoamme oletetun mekanismin PPI:iden ja CDAD:n väliselle yhteydelle käyttämällä sokkoutettua, yksikätistä tutkimussuunnitelmaa. Käytämme bakteeriperäisen 16S-ribosomaalisen alayksikön geenin hypervariaabelin V4-alueen pyrosekvensointia ihmisen ulostenäytteissä paksusuolen kasviston kuvaamiseen. Keräämme vapaaehtoisilta ulostenäytteet ennen ja jälkeen eripituisia PPI-lääkkeitä ja testaamme mikrobiomia määrittääksemme 1) vähentävätkö PPI:t yleistä monimuotoisuutta, 2) vähentävätkö PPI:t Bacteroidetes-bakteerien suhteellista runsautta, 3) vaikuttaako PPI-lääkkeiden pidentynyt kesto monimuotoisuuteen ja 4) onko monimuotoisuus palautumassa määritellyn PPI-kurssin suorittamisen jälkeen. Uskomme, että PPI:t vähentävät mikrobiomien yleistä monimuotoisuutta ja anaerobeja – sama kuvio, joka näkyy antibioottien käytön jälkeen. Lisäksi uskomme, että pidentynyt PPI-kesto vähentää monimuotoisuutta entisestään ja että mikrobiomi palaa PPI:tä edeltäneelle monimuotoisuuden tasolle PPI-lääkkeiden lopettamisen jälkeen. Nämä tulokset helpottavat biologisesti perustuvia kliinisiä interventioita CDAD:n vähentämiseksi potilailla, jotka tarvitsevat hapon suppressiota.