Efectos del ácido gástrico en el microbioma del colon

El microbioma colónico es esencial en la salud y la enfermedad humanas. La diarrea asociada a Clostridium difficile (CDAD), una forma altamente morbosa de diarrea infecciosa, es causada por antibióticos que perturban el microbioma y permiten que C. difficile prolifere. Los inhibidores de la bomba de protones (IBP) son potentes supresores del ácido gástrico y se encuentran entre los medicamentos más comunes en los Estados Unidos. Docenas de estudios observacionales muestran que el uso de PPI a largo plazo está asociado con CDAD. Sin embargo, se desconoce el mecanismo por el cual los PPI causan CDAD. Creemos que los PPI causan CDAD al inducir alteraciones en el microbioma del colon humano. Confirmaremos o refutaremos el mecanismo hipotético para la asociación entre los PPI y CDAD utilizando un diseño de estudio de un solo brazo sin cegamiento. Usaremos la pirosecuenciación de la región V4 hipervariable del gen de la subunidad ribosomal 16S bacteriana en muestras fecales humanas para describir la flora colónica. Recolectaremos muestras fecales de voluntarios antes y después de administrar PPI por diferentes duraciones y analizaremos el microbioma para determinar 1) si los PPI disminuyen la diversidad general, 2) si los PPI disminuyen la abundancia relativa de Bacteroidetes, 3) si la mayor duración de los PPI afecta la diversidad y 4) si hay recuperación de la diversidad después de completar un curso definido de PPI. Creemos que los PPI causarán un patrón de disminución de la diversidad de microbiomas en general y anaerobios reducidos, el mismo patrón que se observa después del uso de antibióticos. Además, creemos que una mayor duración de los PPI disminuirá aún más la diversidad y que el microbioma volverá a los niveles de diversidad previos a los PPI después de que se detengan los PPI. Estos resultados facilitarán las intervenciones clínicas con base biológica para reducir las tasas de CDAD entre los pacientes que requieren supresión de ácido.