Účinky žaludeční kyseliny na střevní mikrobiom

Mikrobiom tlustého střeva je nezbytný pro lidské zdraví a nemoci. Průjem spojený s Clostridium difficile (CDAD), vysoce morbidní forma infekčního průjmu, je způsoben antibiotiky, která narušují mikrobiom a umožňují proliferaci C. difficile. Inhibitory protonové pumpy (PPI) jsou silné supresory žaludeční kyseliny a patří mezi nejběžnější léky ve Spojených státech. Desítky observačních studií ukazují, že dlouhodobé užívání PPI je spojeno s CDAD. Mechanismus, kterým PPI způsobují CDAD, však není znám. Věříme, že PPI způsobují CDAD tím, že indukují změny v mikrobiomu lidského tlustého střeva. Potvrdíme nebo vyvrátíme předpokládaný mechanismus pro asociaci mezi PPI a CDAD pomocí nezaslepeného, ​​jednoramenného designu studie. K popisu flóry tlustého střeva použijeme pyrosekvenování hypervariabilní oblasti V4 bakteriálního genu ribozomální podjednotky 16S ve vzorcích lidské stolice. Budeme shromažďovat vzorky stolice od dobrovolníků před a po podávání PPI po různou dobu trvání a testovat mikrobiom, abychom určili 1) zda PPI snižují celkovou diverzitu, 2) zda PPI snižují relativní množství Bacteroidetes, 3) zda zvýšená doba trvání PPI ovlivňuje diverzitu a 4) zda dochází k obnově diverzity po dokončení definovaného kurzu PPI. Věříme, že PPI způsobí vzor zmenšené celkové diverzity mikrobiomů a snížení anaerobů – stejný vzorec pozorovaný po použití antibiotik. Kromě toho se domníváme, že zvýšené trvání PPI dále sníží diverzitu a že se mikrobiom vrátí na úroveň diverzity před PPI po zastavení PPI. Tyto výsledky usnadní klinicky založené biologické intervence ke snížení míry CDAD u pacientů, kteří vyžadují supresi kyseliny.