甲基化改变对结肠癌的影响：流行病学和预后

我们在 2010 年使用创新的 Illumina GoldenGate（甲基化测定）进行了一项初步研究，这使我们能够表征一系列 200 个结肠腺癌（C18）和直肠乙状结肠腺癌（C19）上切除的 807 个潜在标记物的甲基化水平。 1998 年和 2001 年。 通过焦磷酸测序验证的结果使我们能够建立一组 12 个标记来评估甲基化水平。 该项目的目的是在 2002 年至 2006 年期间在公立和私立医院 (n=685) 切除的第二组腺癌患者（I 至 IV 期）中验证该组的预后价值。

这项研究依赖于在公立和私立医院切除的结直肠癌手术标本的原始收集，这些标本是在 Côte-d'Or 省的居民中进行的，随后是勃艮第的癌症登记处。 从每种癌症和邻近的正常粘膜获得的样本储存在 Ferdinand Cabane 生物资源中心（经 S 96900 认证）的液氮中。 注释由癌症登记处工作人员从多个来源（病理学家、胃肠病学家、肿瘤学家和放射治疗师）收集。

焦磷酸测序将用于量化甲基化水平。 将确定癌性 DNA 上每个标记的甲基化等位基因百分比以及甲基化标记与所分析标记数量的比率。 将考虑 MSI、BRAF、KRAS 和 PI3K 的分子状态。

为了研究预后，将计算相对和复发自由生存期。 将进行多变量相对生存分析以确定独立的预后因素，同时考虑患者和肿瘤的特征以及表观遗传和分子改变。 将根据年龄组、性别和亚位点描述表观遗传改变。 表观遗传表型将根据已知的分子状态使用逻辑回归模型进行评估。