결장암에서 메틸화 변화의 영향: 역학 및 예후

우리는 2010년에 혁신적인 Illumina GoldenGate(메틸화 분석)를 사용하여 예비 연구를 수행하여 결장(C18)과 직장구불결장 접합부(C19)의 일련의 200개 선암에서 807개의 잠재적 마커의 메틸화 수준을 특성화할 수 있었습니다. 1998년과 2001년. 파이로시퀀싱으로 검증된 결과를 통해 메틸화 수준을 평가하기 위한 12개의 마커 패널을 설정할 수 있었습니다. 이 프로젝트의 목적은 2002년과 2006년 사이에 공립 및 사립 병원에서 절제된 선암종(I기에서 IV기) 환자의 두 번째 코호트(n=685)에서 이 패널의 예후적 가치를 검증하는 것입니다.

이 연구는 Côte-d'Or의 département에 거주하고 Burgundy의 암 등록이 뒤따르는 환자들 사이에서 공립 및 사립 병원에서 절제된 대장암의 원래 수술 표본 수집에 의존합니다. 각 암 및 인접한 정상 점막에서 얻은 샘플은 Ferdinand Cabane Biological Resources Centre(인증 S 96900)의 액체 질소에 보관됩니다. 주석은 여러 소스(병리학자, 위장병학자, 종양학자 및 방사선 치료사)에서 암 등록 직원이 수집합니다.

파이로시퀀싱은 메틸화 수준을 정량화하는 데 사용됩니다. 암성 DNA 상의 각 마커에 대한 메틸화된 대립유전자의 백분율 및 분석된 마커의 수에 대한 메틸화된 마커의 비율이 결정될 것이다. MSI, BRAF, KRAS 및 PI3K의 분자 상태가 고려됩니다.

예후를 연구하기 위해 상대 생존율과 무재발 생존율을 계산합니다. 환자 및 종양의 특성과 후생유전학적 및 분자적 변이를 고려하여 독립적인 예후 인자를 결정하기 위해 다변량 상대 생존 분석을 수행할 것이다. 후생유전학적 변이는 연령 그룹, 성별 및 하위 부위에 따라 설명될 것입니다. 후성 유전적 표현형은 로지스틱 회귀 모델을 사용하여 이미 알려진 분자 상태에 따라 평가됩니다.