Impacto de las alteraciones de la metilación en el cáncer de colon: epidemiología y pronóstico

Realizamos un estudio preliminar en 2010 utilizando el innovador Illumina GoldenGate (ensayo de metilación) que nos permitió caracterizar el nivel de metilación de 807 marcadores potenciales en una serie de 200 adenocarcinomas de colon (C18) y unión rectosigmoidea (C19) resecados entre 1998 y 2001. Los resultados, validados por pirosecuenciación, permitieron establecer un panel de 12 marcadores para evaluar el nivel de metilación. El objetivo de este proyecto es validar el valor pronóstico de este panel en una segunda cohorte de pacientes con adenocarcinomas (estadio I a IV) resecados entre 2002 y 2006 en hospitales públicos y privados (n=685).

Este estudio se basa en una colección original de muestras quirúrgicas de cáncer colorrectal resecadas en hospitales públicos y privados entre pacientes residentes en el departamento de Côte-d'Or y seguidas por el registro de cáncer de Borgoña. Las muestras obtenidas de cada cáncer y de la mucosa normal adyacente se almacenan en nitrógeno líquido en el Centro de Recursos Biológicos Ferdinand Cabane (certificado S 96900). El personal del registro de cáncer recopila las anotaciones de múltiples fuentes (patólogos, gastroenterólogos, oncólogos y radioterapeutas).

Se utilizará pirosecuenciación para cuantificar el nivel de metilación. Se determinará el porcentaje de alelo metilado para cada marcador en el ADN canceroso y la relación de marcadores metilados con respecto al número de marcadores analizados. Se tendrá en cuenta el estado molecular de MSI, BRAF, KRAS y PI3K.

Para estudiar el pronóstico se calculará la supervivencia relativa y libre de recaídas. Se realizará un análisis de supervivencia relativa multivariante para determinar factores pronósticos independientes teniendo en cuenta las características de los pacientes y los tumores y las alteraciones epigenéticas y moleculares. Las alteraciones epigenéticas se describirán según grupo de edad, sexo y sublocalización. Los fenotipos epigenéticos se evaluarán según el estado molecular ya conocido utilizando modelos de regresión logística.