类风湿性关节炎的口服宏基因组生物标志物
类风湿性关节炎 (RA) 是一种慢性且可能严重的自身免疫性疾病，在美国影响 200 万人。 环境因素在调节自身免疫发病机制中的作用已得到明确描述，但具体的作用机制仍知之甚少。 越来越多的证据表明粘膜表面的微生物群与自身免疫性疾病的发展有关。 各种研究已明确将 RA 与牙周病联系起来。 后者与包括口腔细菌牙龈卟啉单胞菌在内的红色复合体有关。 然而，尚未对 RA 中的口腔微生物群进行系统分析，以确定是否存在与 RA 相关的牙龈卟啉单胞菌（和其他口腔细菌）的特异性标记物。
在这项研究中，研究人员将描述从以下患者的口腔样本中分离出的口腔微生物组成（微生物组）和基因含量（宏基因组）的特征：(i) 生物制剂治疗前的早期 RA 患者和 (ii) 正在接受治疗的 RA 患者亚群对抗 TNF-α 治疗有反应或无反应。 这项研究的创新之处在于超越了口腔细菌种类的鉴定，延伸到了与这些群体相关的菌株和基因的水平。 总体假设是个体之间存在影响自身免疫和自身免疫性疾病发展的口腔微生物变异。
研究概览
详细说明
这是一项多学科研究，五名来自不同但互补学科的研究人员建立了这种新的合作关系。 基于风湿病学家、牙医、口腔生物学家和具有免疫学、微生物学和基因组学专业知识的传染病专家的合作，从该项目获得的信息具有很高的转化潜力。 简而言之，RA 参与者将由风湿病学家招募。 总共将招募 100 名参与者，分为两组进行研究；一组患有 RA 的受试者和另一组将作为健康对照。 这两组将分为以下几组参与研究： 第 1 组：将由 25 名未接受生物制剂治疗的 RA 成年受试者组成，将与来自同一家庭的年龄匹配成员的 25 名健康对照者进行比较. 第 2 组将由 25 名对一线抗 TNF 治疗有反应的 RA 成年受试者组成，这些受试者将与 25 名对两种或更多种 TNF 拮抗剂有抗性的同年龄和性别的 RA 受试者进行比较。 参与者将被安排在佛罗里达大学牙科诊所研究单位进行研究访问。 在检查期间将进行以下操作：多维健康评估问卷 (MDHAQ)、牙科检查、唾液收集和牙菌斑将从不同的牙齿表面去除以用于龈上。
龈上组织将在基因组学实验室进行深度测序。 测试两个特定目标：1) 测试基于 16S RNA 数据的口腔微生物组概况与 RA 的发展或对特定治疗的反应相关的假设，以及 2) 测试特定基因、变体和功能能力（宏基因组）与 RA 或治疗反应相关。 完成这项试点研究后，研究人员将系统地确定细菌生物标志物（例如 种、亚种、基因）与 RA 相关，可作为疾病治疗的潜在靶点。 在未来的研究中，这些标志物可能会被开发成用于 RA 治疗的新药物靶点。
研究类型
注册 (实际的)
联系人和位置
学习地点
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Florida
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Gainesville、Florida、美国、32610
- University of Florida College of Dentistry-Periodontics
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Gainesville、Florida、美国、32611
- Randall Malcom VA Medical Center
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参与标准
资格标准
适合学习的年龄
接受健康志愿者
有资格学习的性别
取样方法
研究人群
描述
纳入标准：
- 必须至少有 10 颗天然无冠牙齿（不包括第三磨牙）。
排除标准：
- 少于10颗牙齿；
- 在过去 3 个月内接受过抗生素治疗，包括在牙科治疗前需要预防性使用抗生素的患者；
- 是免疫受损的个体（HIV、AIDS、免疫抑制药物治疗）；
- 在清除期开始前一周或研究期间参加另一项涉及使用牙科产品的临床研究；和
- 不愿意或不能提供知情同意并遵循收集说明。
学习计划
研究是如何设计的？
设计细节
- 观测模型：病例对照
- 时间观点：横截面
队列和干预
团体/队列 |
干预/治疗 |
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RA - 未接触生物制剂
该组将由 25 名未接受过生物制剂治疗（未接受过生物制剂治疗）的类风湿性关节炎 (RA) 成年受试者组成。
在检查期间将进行以下操作：多维健康评估问卷 (MDHAQ)、牙科检查、唾液收集和牙菌斑将从不同的牙齿表面去除以用于龈上。
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所有参与者都将从不同的牙齿表面去除牙菌斑以进行龈上治疗。
RA 小组将收到关于身体功能、疼痛和整体状态的多维健康评估问卷 (MDHAQ)。
其他名称：
所有参与者都将收集唾液。
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健康对照
该组将由 25 名成年受试者组成，他们将是与 25 名未接触过生物制剂的同一家庭成员的健康对照，并且年龄相同。
在检查期间将进行以下操作：牙科检查、唾液收集和牙菌斑将从不同的牙齿表面去除以用于龈上。
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所有参与者都将从不同的牙齿表面去除牙菌斑以进行龈上治疗。
所有参与者都将收集唾液。
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RA对抗TNF有反应
该组将由 25 名患有类风湿性关节炎 (RA) 的成年受试者组成，他们对一线抗 TNF-α 疗法有反应。
在检查期间将进行以下操作：多维健康评估问卷 (MDHAQ)、牙科检查、唾液收集和牙菌斑将从不同的牙齿表面去除以用于龈上。
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所有参与者都将从不同的牙齿表面去除牙菌斑以进行龈上治疗。
RA 小组将收到关于身体功能、疼痛和整体状态的多维健康评估问卷 (MDHAQ)。
其他名称：
所有参与者都将收集唾液。
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RA 对抗 TNF 无反应
该组将由 25 名患有类风湿性关节炎 (RA) 的成年受试者组成，他们对两种或多种抗 TNF-α 疗法有抵抗力，并且与对抗 TNF 组有反应的 RA 年龄相同。
在检查期间将进行以下操作：多维健康评估问卷 (MDHAQ)、牙科检查、唾液收集和牙菌斑将从不同的牙齿表面去除以用于龈上。
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所有参与者都将从不同的牙齿表面去除牙菌斑以进行龈上治疗。
RA 小组将收到关于身体功能、疼痛和整体状态的多维健康评估问卷 (MDHAQ)。
其他名称：
所有参与者都将收集唾液。
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研究衡量的是什么？
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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口腔微生物组将在每组中进行分类，以了解它们与 RA 的关联。
大体时间：第一天
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将在每个配置文件上计算 Wilcoxon 秩和检验，以识别每对组（RA 患者和对照）之间的差异宏基因组基因含量。
还将评估 KEGG 直向同源物和蛋酒直向同源物组标记物在 RA 患者口腔微生物群中的潜在微生物功能作用。
将使用错误发现率方法对所有结果进行多次测试更正。
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第一天
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将进行宏基因组分析以发现各组之间的口腔细菌标记。
大体时间：18个月
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将在每个配置文件上计算 Wilcoxon 秩和检验，以确定每个组之间的差异宏基因组基因含量。
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18个月
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合作者和调查者
调查人员
- 首席研究员：Michael R Bubb, MD、University of Florida
- 首席研究员：Edward K Chan, Ph.D.、University of Florida
研究记录日期
研究主要日期
学习开始
初级完成 (实际的)
研究完成 (实际的)
研究注册日期
首次提交
首先提交符合 QC 标准的
首次发布 (估计)
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
上次提交的符合 QC 标准的更新
最后验证
更多信息
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