Orala metagenomiska biomarkörer vid reumatoid artrit
Reumatoid artrit (RA) är en kronisk och potentiellt allvarlig autoimmun sjukdom som drabbar 2 miljoner i USA. Rollen av miljöfaktorer för att modulera autoimmunitetspatogenes har tydligt beskrivits och ändå är de specifika verkningsmekanismerna fortfarande dåligt förstådda. En växande mängd bevis involverar mikrobiota av slemhinneytor i utvecklingen av autoimmuna sjukdomar. Olika studier har tydligt kopplat RA till periodontal sjukdom. Det senare är kopplat till det röda komplexet som inkluderar oral bakterien Porphyromonas gingivalis. Och ändå har det inte gjorts en systematisk analys av den orala mikrobiotan i RA för att avgöra om det finns specifika markörer för P. gingivalis (och andra orala bakterier) som är kopplade till RA.
I denna studie kommer utredarna att karakterisera oral mikrobiell sammansättning (mikrobiom) och geninnehåll (metagenom) i DNA isolerat från orala prover erhållna från patienter med (i) tidigt stadium av RA före biologiska behandlingar och (ii) undergrupper av RA-patienter som är svarar eller svarar inte på anti-TNF-alfa-terapi. Den innovativa aspekten av denna studie går utöver identifieringen av orala bakteriearter, till nivån av stammar och gener som är associerade med dessa grupper. Den övergripande hypotesen är att oral mikrobiell variation existerar mellan individer som påverkar utvecklingen av autoimmunitet och autoimmun sjukdom.
Studieöversikt
Status
Betingelser
Intervention / Behandling
Detaljerad beskrivning
Detta är en multidisciplinär forskningsstudie med fem utredare från olika, men kompletterande, discipliner för att etablera detta nya samarbete. Det finns en hög translationspotential för information från detta projekt baserat på samarbetet mellan en reumatolog, en tandläkare, orala biologer och experter på infektionssjukdomar med expertis inom immunologi, mikrobiologi och genomik. I korthet kommer RA-deltagare att rekryteras av reumatologen. Totalt kommer 100 deltagare att rekryteras till två grupper som ska studeras; en grupp försökspersoner med RA och den andra gruppen kommer att vara friska kontroller. Dessa två grupper kommer att delas in i följande grupper för deltagande i studien: Grupp 1: kommer att bestå av 25 RA vuxna patienter som inte har behandlats med biologiska läkemedel, vilket kommer att jämföras med 25 friska kontroller från åldersmatchade medlemmar i samma hushåll . Grupp 2 kommer att bestå av 25 RA vuxna individer som svarar på första linjens anti-TNF-terapi, vilket kommer att jämföras med 25 individer av samma ålder och kön med RA som är resistenta mot två eller flera TNF-antagonister. Deltagarna kommer att planeras för ett forskningsstudiebesök vid University of Florida Dental Clinic Research Unit. Under undersökningen kommer följande att ske: det multidimensionella hälsobedömningsformuläret (MDHAQ), tandundersökning, salivuppsamling och tandplack kommer att tas bort från olika tandytor för supragingival.
Den supragingival kommer att utsättas för djup sekvensering i genomiklabbet. Att testa två specifika syften: 1) testa hypotesen att orala mikrobiomprofiler baserade på 16S RNA-data är associerade med utvecklingen av RA eller med svaret på en specifik terapi, och 2) testa hypotesen att de specifika generna, varianterna och funktionella förmågor (metagenom) är associerade med RA eller med terapeutiskt svar. Efter avslutad pilotstudie kommer utredarna att systematiskt ha identifierat bakteriella biomarkörer (t.ex. arter, underarter, gener) som korrelerar med RA och kan fungera som potentiella mål för sjukdomsbehandling. Dessa markörer kan komma att utvecklas till nya läkemedelsmål för RA-terapi i framtida studier.
Studietyp
Inskrivning (Faktisk)
Kontakter och platser
Studieorter
-
-
Florida
-
Gainesville, Florida, Förenta staterna, 32610
- University of Florida College of Dentistry-Periodontics
-
Gainesville, Florida, Förenta staterna, 32611
- Randall Malcom VA Medical Center
-
-
Deltagandekriterier
Urvalskriterier
Åldrar som är berättigade till studier
Tar emot friska volontärer
Kön som är behöriga för studier
Testmetod
Studera befolkning
Beskrivning
Inklusionskriterier:
- med minst 10 naturliga okrönta tänder (exklusive tredje molarer) måste finnas.
Exklusions kriterier:
- har mindre än 10 tänder;
- har behandlats med antibiotika under de senaste 3 månaderna, inklusive patienter som kräver antibiotikaprofylax före tandbehandling;
- är immunförsvagade individer (HIV, AIDS, immunsuppressiv läkemedelsterapi);
- delta i en annan klinisk studie som involverar användning av dentala produkter en vecka före start av tvättperioden eller under studieperioden; och
- inte vill eller kan ge informerat samtycke och följer insamlingsinstruktionerna.
Studieplan
Hur är studien utformad?
Designdetaljer
- Observationsmodeller: Case-Control
- Tidsperspektiv: Tvärsnitt
Kohorter och interventioner
Grupp / Kohort |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
RA - naiv till biologiska läkemedel
Denna grupp kommer att bestå av 25 vuxna patienter med reumatoid artrit (RA) som inte har behandlats med biologiska läkemedel (naiva mot biologiska läkemedel).
Under undersökningen kommer följande att ske: det multidimensionella hälsobedömningsformuläret (MDHAQ), tandundersökning, salivuppsamling och tandplack kommer att tas bort från olika tandytor för supragingival.
|
Alla deltagare kommer att få tandplack borttaget från olika tandytor för supragingival.
RA-grupperna kommer att få det multidimensionella hälsobedömningsformuläret (MDHAQ) för fysisk funktion, smärta och global status.
Andra namn:
Alla deltagare kommer att ha en salivsamling.
|
|
Friska kontroller
Denna grupp kommer att bestå av 25 vuxna försökspersoner som kommer att vara friska kontroller från medlemmar av samma hushåll som de 25 naiva till biologiska läkemedel, och vara i samma ålder.
Under undersökningen kommer följande att ske: tandundersökning, salivuppsamling och tandplack kommer att avlägsnas från olika tandytor för supragingival.
|
Alla deltagare kommer att få tandplack borttaget från olika tandytor för supragingival.
Alla deltagare kommer att ha en salivsamling.
|
|
RA reagerar på anti-TNF
Denna grupp kommer att bestå av 25 vuxna patienter med reumatoid artrit (RA) som har svarat på första linjens anti-TNF-alfa-terapi.
Under undersökningen kommer följande att ske: det multidimensionella hälsobedömningsformuläret (MDHAQ), tandundersökning, salivuppsamling och tandplack kommer att tas bort från olika tandytor för supragingival.
|
Alla deltagare kommer att få tandplack borttaget från olika tandytor för supragingival.
RA-grupperna kommer att få det multidimensionella hälsobedömningsformuläret (MDHAQ) för fysisk funktion, smärta och global status.
Andra namn:
Alla deltagare kommer att ha en salivsamling.
|
|
RA svarar inte på anti-TNF
Denna grupp kommer att bestå av 25 vuxna patienter med reumatoid artrit (RA) som är resistenta mot två eller flera anti-TNF-alfa-terapier och vara i samma ålder som den RA som är känslig för anti-TNF-gruppen.
Under undersökningen kommer följande att ske: det multidimensionella hälsobedömningsformuläret (MDHAQ), tandundersökning, salivuppsamling och tandplack kommer att tas bort från olika tandytor för supragingival.
|
Alla deltagare kommer att få tandplack borttaget från olika tandytor för supragingival.
RA-grupperna kommer att få det multidimensionella hälsobedömningsformuläret (MDHAQ) för fysisk funktion, smärta och global status.
Andra namn:
Alla deltagare kommer att ha en salivsamling.
|
Vad mäter studien?
Primära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
Oralt mikrobiom kommer att katalogiseras i varje grupp för deras koppling till RA.
Tidsram: Dag 1
|
Ett Wilcoxon rank-summetest kommer att beräknas på varje profil för att identifiera differentiellt metagenomiskt geninnehåll mellan varje par av grupper (RA-patienter och kontroller).
De potentiella mikrobiella funktionella rollerna för KEGG-ortologernas och äggnogortologgruppens markörer i den orala mikrobiotan hos RA-patienter kommer också att bedömas.
Alla resultat kommer att korrigeras för flera tester med en metod för falsk upptäcktsfrekvens.
|
Dag 1
|
|
Metagenomiska analyser kommer att utföras för att hitta orala bakteriemarkörer mellan grupperna.
Tidsram: 18 månader
|
Ett Wilcoxon rank-summetest kommer att beräknas på varje profil för att identifiera differentiellt metagenomiskt geninnehåll mellan varje grupp.
|
18 månader
|
Samarbetspartners och utredare
Sponsor
Utredare
- Huvudutredare: Michael R Bubb, MD, University of Florida
- Huvudutredare: Edward K Chan, Ph.D., University of Florida
Studieavstämningsdatum
Studera stora datum
Studiestart
Primärt slutförande (Faktisk)
Avslutad studie (Faktisk)
Studieregistreringsdatum
Först inskickad
Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna
Första postat (Uppskatta)
Uppdateringar av studier
Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)
Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna
Senast verifierad
Mer information
Termer relaterade till denna studie
Nyckelord
Ytterligare relevanta MeSH-villkor
Andra studie-ID-nummer
- IRB201500286
- 11712325 (Annat bidrag/finansieringsnummer: Department of Defense)
- 12.420 (Annat bidrag/finansieringsnummer: Department of Defense)
Plan för individuella deltagardata (IPD)
Planerar du att dela individuella deltagardata (IPD)?
Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument
Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt
Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt
Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .