Orális metagenomikus biomarkerek rheumatoid arthritisben
A rheumatoid arthritis (RA) egy krónikus és potenciálisan súlyos autoimmun betegség, amely 2 millió embert érint az Egyesült Államokban. Világosan leírták a környezeti tényezők szerepét az autoimmunitás patogenezisének modulálásában, de a konkrét hatásmechanizmusok továbbra is kevéssé ismertek. Egyre több bizonyíték támasztja alá, hogy a nyálkahártya felszínének mikrobiotája szerepet játszik az autoimmun betegségek kialakulásában. Különféle tanulmányok egyértelműen összefüggésbe hozták az RA-t a parodontális betegséggel. Ez utóbbi a Porphyromonas gingivalis szájbaktériumot magában foglaló vörös komplexhez kapcsolódik. Ennek ellenére nem végeztek szisztematikus elemzést a szájüregi mikrobiotáról RA-ban annak megállapítására, hogy vannak-e specifikus markerei a P. gingivalisnak (és más szájbaktériumoknak), amelyek az RA-hoz kapcsolódnak.
Ebben a vizsgálatban a kutatók jellemezni fogják a szájüregi mintákból izolált DNS szájüregi mikrobiális összetételét (mikrobiómát) és géntartalmát (metagenom) (i) korai stádiumú RA-ban szenvedő betegektől a biológiai kezelések előtt és (ii) olyan RA-betegek alcsoportjait, akik reagálnak vagy nem reagálnak az anti-TNF-alfa terápiára. A tanulmány innovatív aspektusa túlmutat a szájbaktériumfajták azonosításán, hanem az ezekkel a csoportokkal kapcsolatos törzsek és gének szintjén is. Az általános hipotézis az, hogy az egyének között az orális mikrobiális eltérések vannak, amelyek befolyásolják az autoimmunitás és az autoimmun betegségek kialakulását.
A tanulmány áttekintése
Állapot
Körülmények
Beavatkozás / kezelés
Részletes leírás
Ez egy multidiszciplináris kutatási tanulmány, amelyben öt, különböző, de egymást kiegészítő tudományterületről származó kutató vesz részt ennek az új együttműködésnek a létrehozására. Reumatológus, fogorvos, szájbiológus és immunológiai, mikrobiológiai és genomikai szakértelemmel rendelkező fertőző betegség-szakértő együttműködésén alapuló projektből származó információk nagy transzlációs potenciállal rendelkeznek. Röviden, az RA résztvevőket a reumatológus fogja toborozni. Összesen 100 résztvevőt vesznek fel két vizsgálandó csoportba; Az RA-ban szenvedő alanyok egyik csoportja, a másik pedig egészséges kontrollok. Ezt a két csoportot a következő csoportokra osztják a vizsgálatban való részvételhez: 1. csoport: 25 RA felnőtt alanyból áll, akiket nem kezeltek biológiai szerekkel, és összehasonlítják 25 egészséges kontrollcsoporttal, akik ugyanannak a háztartásnak a korú tagjaiból származnak. . A 2. csoport 25 RA-s felnőtt alanyból áll, akik reagálnak az első vonalbeli anti-TNF-terápiára, amelyet 25 azonos korú és nemű, RA-ban szenvedő alanyal hasonlítanak össze, akik rezisztensek két vagy több TNF-antagonistára. A résztvevőket a Floridai Egyetem Fogászati Klinika Kutatási Egységében egy kutatási tanulmányútra tervezik. A vizsgálat során a következőkre kerül sor: a többdimenziós állapotfelmérő kérdőív (MDHAQ), fogászati vizsgálat, nyálgyűjtés, valamint a foglepedék eltávolítása a különböző fogfelületekről supragingivális célból.
A supragingiválist mély szekvenálásnak vetik alá a genomikai laborban. Két konkrét cél tesztelése: 1) annak a hipotézisnek a tesztelése, miszerint a 16S RNS adatokon alapuló orális mikrobiomprofilok összefüggésben állnak az RA kialakulásával vagy egy adott terápiára adott válasszal, és 2) annak a hipotézisnek a tesztelése, hogy az adott gének, variánsok, ill. funkcionális képességek (metagenom) RA-hoz vagy terápiás válaszhoz kapcsolódnak. A kísérleti tanulmány befejezése után a kutatók szisztematikusan azonosítják a bakteriális biomarkereket (pl. fajok, alfajok, gének), amelyek korrelálnak az RA-val, és potenciális célpontként szolgálhatnak a betegség kezelésében. Ezeket a markereket a jövőbeni vizsgálatok során új gyógyszercélpontokká fejleszthetik az RA-terápia számára.
Tanulmány típusa
Beiratkozás (Tényleges)
Kapcsolatok és helyek
Tanulmányi helyek
-
-
Florida
-
Gainesville, Florida, Egyesült Államok, 32610
- University of Florida College of Dentistry-Periodontics
-
Gainesville, Florida, Egyesült Államok, 32611
- Randall Malcom VA Medical Center
-
-
Részvételi kritériumok
Jogosultsági kritériumok
Tanulmányozható életkorok
Egészséges önkénteseket fogad
Tanulmányozható nemek
Mintavételi módszer
Tanulmányi populáció
Leírás
Bevételi kritériumok:
- legalább 10 természetes koronázatlan foggal (a harmadik őrlőfogak kivételével) jelen kell lennie.
Kizárási kritériumok:
- 10-nél kevesebb foga van;
- az elmúlt 3 hónapban antibiotikumokkal kezelték, beleértve azokat a betegeket is, akiknek a fogászati kezelés előtt antibiotikus profilaxisra van szükségük;
- gyengült immunrendszerű személyek (HIV, AIDS, immunszuppresszív gyógyszeres terápia);
- részt vesz egy másik klinikai vizsgálatban, amely fogászati termékek használatát foglalja magában, egy héttel a kimosási időszak kezdete előtt vagy a vizsgálati időszak alatt; és
- nem hajlandók vagy nem tudnak tájékozott beleegyezést adni és követni az adatgyűjtési utasításokat.
Tanulási terv
Hogyan készül a tanulmány?
Tervezési részletek
- Megfigyelési modellek: Case-Control
- Időperspektívák: Keresztmetszeti
Kohorszok és beavatkozások
Csoport / Kohorsz |
Beavatkozás / kezelés |
|---|---|
|
RA - naiv a biológiával szemben
Ez a csoport 25 rheumatoid arthritisben (RA) szenvedő felnőtt alanyból áll, akiket nem kezeltek biológiai szerekkel (biológiai kezelésben naiv).
A vizsgálat során a következőkre kerül sor: a többdimenziós állapotfelmérő kérdőív (MDHAQ), fogászati vizsgálat, nyálgyűjtés, valamint a foglepedék eltávolítása a különböző fogfelületekről supragingivális célból.
|
Minden résztvevőnek eltávolítják a lepedéket a különböző fogfelületekről a supragingivális cél érdekében.
Az RA csoportok megkapják a többdimenziós állapotfelmérő kérdőívet (MDHAQ) a fizikai funkciók, a fájdalom és a globális állapot felmérésére.
Más nevek:
Minden résztvevőnek nyálgyűjtése lesz.
|
|
Egészséges ellenőrzések
Ez a csoport 25 felnőtt alanyból fog állni, akik egészséges kontrollok, akik ugyanabban a háztartásban élnek, mint a 25 naiv biológiai kezelés, és azonos korúak.
A vizsgálat során a következőkre kerül sor: fogászati vizsgálat, nyálgyűjtés, valamint foglepedék eltávolítása a különböző fogfelületekről supragingivális célból.
|
Minden résztvevőnek eltávolítják a lepedéket a különböző fogfelületekről a supragingivális cél érdekében.
Minden résztvevőnek nyálgyűjtése lesz.
|
|
Az anti-TNF-re reagáló RA
Ez a csoport 25 rheumatoid arthritisben (RA) szenvedő felnőttből áll, akik reagáltak az első vonalbeli anti-TNF-alfa terápiára.
A vizsgálat során a következőkre kerül sor: a többdimenziós állapotfelmérő kérdőív (MDHAQ), fogászati vizsgálat, nyálgyűjtés, valamint a foglepedék eltávolítása a különböző fogfelületekről supragingivális célból.
|
Minden résztvevőnek eltávolítják a lepedéket a különböző fogfelületekről a supragingivális cél érdekében.
Az RA csoportok megkapják a többdimenziós állapotfelmérő kérdőívet (MDHAQ) a fizikai funkciók, a fájdalom és a globális állapot felmérésére.
Más nevek:
Minden résztvevőnek nyálgyűjtése lesz.
|
|
Az RA nem reagál az anti-TNF-re
Ez a csoport 25 rheumatoid arthritisben (RA) szenvedő felnőttből áll, akik rezisztensek két vagy több anti-TNF-alfa terápiára, és egyidősek az anti-TNF-re reagáló RA csoporttal.
A vizsgálat során a következőkre kerül sor: a többdimenziós állapotfelmérő kérdőív (MDHAQ), fogászati vizsgálat, nyálgyűjtés, valamint a foglepedék eltávolítása a különböző fogfelületekről supragingivális célból.
|
Minden résztvevőnek eltávolítják a lepedéket a különböző fogfelületekről a supragingivális cél érdekében.
Az RA csoportok megkapják a többdimenziós állapotfelmérő kérdőívet (MDHAQ) a fizikai funkciók, a fájdalom és a globális állapot felmérésére.
Más nevek:
Minden résztvevőnek nyálgyűjtése lesz.
|
Mit mér a tanulmány?
Elsődleges eredményintézkedések
Eredménymérő |
Intézkedés leírása |
Időkeret |
|---|---|---|
|
Az orális mikrobiomot minden csoportban katalogizálják az RA-val való kapcsolatuk szempontjából.
Időkeret: 1. nap
|
Wilcoxon rang-összeg tesztet számítanak ki minden egyes profilon, hogy azonosítsák az eltérő metagenomikus géntartalmat az egyes csoportok (RA-s betegek és kontrollok) között.
Felmérjük a KEGG ortológok és a tojáslikőr ortológ csoport markereinek lehetséges mikrobiális funkcionális szerepét az RA-s betegek orális mikrobiotájában.
Valamennyi eredményt többszörös teszteléshez korrigálunk, hamis felfedezési arány módszerrel.
|
1. nap
|
|
Metagenómiai elemzéseket végeznek, hogy megtalálják az orális baktériummarkereket a csoportok között.
Időkeret: 18 hónap
|
Minden profilon Wilcoxon rang-összeg tesztet számítanak ki, hogy azonosítsák az egyes csoportok közötti eltérő metagenomikus géntartalmat.
|
18 hónap
|
Együttműködők és nyomozók
Szponzor
Nyomozók
- Kutatásvezető: Michael R Bubb, MD, University of Florida
- Kutatásvezető: Edward K Chan, Ph.D., University of Florida
Tanulmányi rekorddátumok
Tanulmány főbb dátumok
Tanulmány kezdete
Elsődleges befejezés (Tényleges)
A tanulmány befejezése (Tényleges)
Tanulmányi regisztráció dátumai
Először benyújtva
Először nyújtották be, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
Első közzététel (Becslés)
Tanulmányi rekordok frissítései
Utolsó frissítés közzétéve (Tényleges)
Az utolsó frissítés elküldve, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
Utolsó ellenőrzés
Több információ
A tanulmányhoz kapcsolódó kifejezések
Kulcsszavak
További vonatkozó MeSH feltételek
Egyéb vizsgálati azonosító számok
- IRB201500286
- 11712325 (Egyéb támogatási/finanszírozási szám: Department of Defense)
- 12.420 (Egyéb támogatási/finanszírozási szám: Department of Defense)
Terv az egyéni résztvevői adatokhoz (IPD)
Tervezi megosztani az egyéni résztvevői adatokat (IPD)?
Gyógyszer- és eszközinformációk, tanulmányi dokumentumok
Egy amerikai FDA által szabályozott gyógyszerkészítményt tanulmányoz
Egy amerikai FDA által szabályozott eszközterméket tanulmányoz
Ezt az információt közvetlenül a clinicaltrials.gov webhelyről szereztük be, változtatás nélkül. Ha bármilyen kérése van vizsgálati adatainak módosítására, eltávolítására vagy frissítésére, kérjük, írjon a következő címre: register@clinicaltrials.gov. Amint a változás bevezetésre kerül a clinicaltrials.gov oldalon, ez a webhelyünkön is automatikusan frissül. .