Tato stránka byla automaticky přeložena a přesnost překladu není zaručena. Podívejte se prosím na anglická verze pro zdrojový text.

Orální metagenomické biomarkery u revmatoidní artritidy

8. srpna 2019 aktualizováno: University of Florida

Revmatoidní artritida (RA) je chronické a potenciálně závažné autoimunitní onemocnění postihující 2 miliony ve Spojených státech. Úloha environmentálních faktorů v modulaci autoimunitní patogeneze byla jasně popsána, a přesto zůstávají specifické mechanismy účinku nedostatečně pochopeny. Rostoucí množství důkazů naznačuje, že mikroflóra slizničních povrchů přispívá k rozvoji autoimunitních poruch. Různé studie jasně spojují RA s periodontálním onemocněním. Ten je spojen s červeným komplexem, který zahrnuje orální bakterii Porphyromonas gingivalis. A přesto nebyla provedena systematická analýza orální mikroflóry u RA, aby se zjistilo, zda existují specifické markery pro P. gingivalis (a další orální bakterie), které jsou spojeny s RA.

V této studii budou výzkumníci charakterizovat orální mikrobiální složení (mikrobiom) a genový obsah (metagenom) DNA izolované z orálních vzorků získaných od pacientů s (i) raným stádiem RA před biologickou léčbou a (ii) podskupinami pacientů s RA, kteří jsou reagující nebo nereagující na anti-TNF-alfa terapii. Inovativní aspekt této studie přesahuje identifikaci orálních bakteriálních druhů na úroveň kmenů a genů, které jsou s těmito skupinami spojeny. Celková hypotéza je, že mezi jednotlivci existují orální mikrobiální variace, které ovlivňují rozvoj autoimunity a autoimunitního onemocnění.

Přehled studie

Detailní popis

Toto je multidisciplinární výzkumná studie s pěti výzkumníky z různých, ale vzájemně se doplňujících oborů, aby navázala tuto novou spolupráci. Existuje vysoký translační potenciál pro informace získané z tohoto projektu založeného na spolupráci revmatologa, zubního lékaře, orálních biologů a odborníků na infekční onemocnění se zkušenostmi v imunologii, mikrobiologii a genomice. Stručně řečeno, účastníci RA budou náborováni revmatologem. Celkem bude vybráno 100 účastníků do dvou skupin, které budou studovány; jedna skupina subjektů s RA a druhá skupina budou zdravé kontroly. Tyto dvě skupiny budou rozděleny do následujících skupin pro účast ve studii: Skupina 1: bude sestávat z 25 dospělých subjektů s RA, kteří nebyli léčeni biologickými přípravky, které budou porovnány s 25 zdravými kontrolami od členů stejné domácnosti stejného věku. . Skupina 2 se bude skládat z 25 dospělých jedinců s RA, kteří reagují na anti-TNF terapii první linie, kteří budou porovnáni s 25 subjekty stejného věku a pohlaví s RA, kteří jsou rezistentní vůči dvěma nebo více antagonistům TNF. Účastníci budou naplánováni na výzkumnou studijní návštěvu na University of Florida Dental Clinic Research Unit. Během vyšetření bude probíhat následující: multidimenzionální dotazník hodnocení zdraví (MDHAQ), zubní vyšetření, odběr slin a zubní plak budou odstraněny z různých povrchů zubů pro supragingivální odstranění.

Supragingivální bude podrobeno hlubokému sekvenování v genomické laboratoři. Testovat dva specifické cíle: 1) testování hypotézy, že profily orálního mikrobiomu založené na datech 16S RNA jsou spojeny s rozvojem RA nebo s odpovědí na specifickou terapii, a 2) testování hypotézy, že specifické geny, varianty a funkční schopnosti (metagenom) jsou spojeny s RA nebo s terapeutickou odpovědí. Po dokončení této pilotní studie budou výzkumníci systematicky identifikovat bakteriální biomarkery (např. druhy, poddruhy, geny), které korelují s RA a mohou sloužit jako potenciální cíle pro léčbu onemocnění. Tyto markery mohou být v budoucích studiích vyvinuty jako nové cíle pro léčbu RA.

Typ studie

Pozorovací

Zápis (Aktuální)

92

Kontakty a umístění

Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.

Studijní místa

    • Florida
      • Gainesville, Florida, Spojené státy, 32610
        • University of Florida College of Dentistry-Periodontics
      • Gainesville, Florida, Spojené státy, 32611
        • Randall Malcom VA Medical Center

Kritéria účasti

Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.

Kritéria způsobilosti

Věk způsobilý ke studiu

18 let až 85 let (Dospělý, Starší dospělý)

Přijímá zdravé dobrovolníky

Ne

Pohlaví způsobilá ke studiu

Všechno

Metoda odběru vzorků

Ukázka pravděpodobnosti

Studijní populace

Dospělí pacienti s revmatoidní artritidou (RA), kteří nebyli léčeni biologickými látkami (naivní na biologickou léčbu), pacienti s RA reagující na anti-TNF terapii první linie, pacienti s RA, kteří jsou rezistentní vůči dvěma nebo více antagonistům TNF, a zdravé kontroly z věkově odpovídajícího členy jedné domácnosti.

Popis

Kritéria pro zařazení:

  • s alespoň 10 přirozenými nekorunovanými zuby (kromě třetích molárů).

Kritéria vyloučení:

  • mít méně než 10 zubů;
  • byli léčeni antibiotiky během posledních 3 měsíců, včetně pacientů, kteří vyžadují antibiotickou profylaxi před zubním ošetřením;
  • jsou jedinci s oslabenou imunitou (HIV, AIDS, imunosupresivní léková terapie);
  • účastnit se jiné klinické studie zahrnující použití dentálních produktů jeden týden před začátkem vymývacího období nebo během období studie; a
  • nejsou ochotni nebo schopni poskytnout informovaný souhlas a řídit se pokyny pro sběr.

Studijní plán

Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.

Jak je studie koncipována?

Detaily designu

  • Observační modely: Case-Control
  • Časové perspektivy: Průřezový

Kohorty a intervence

Skupina / kohorta
Intervence / Léčba
RA – naivní vůči biologickým přípravkům
Tato skupina se bude skládat z 25 dospělých pacientů s revmatoidní artritidou (RA), kteří nebyli léčeni biologickými přípravky (naivními biologickými přípravky). Během vyšetření bude probíhat následující: multidimenzionální dotazník hodnocení zdraví (MDHAQ), zubní vyšetření, odběr slin a zubní plak budou odstraněny z různých povrchů zubů pro supragingivální odstranění.
Všem účastníkům bude supragingiválně odstraněn zubní plak z různých povrchů zubů.
Skupiny RA obdrží vícerozměrný dotazník hodnocení zdraví (MDHAQ) pro fyzické funkce, bolest a globální stav.
Ostatní jména:
  • MDHAQ
Všichni účastníci budou mít odběr slin.
Zdravé ovládání
Tato skupina se bude skládat z 25 dospělých jedinců, kteří budou zdravými kontrolami od členů stejné domácnosti jako 25 naivních biologických a budou stejného věku. Během vyšetření bude probíhat následující: zubní vyšetření, odběr slin a zubní plak budou odstraněny z různých povrchů zubů pro supragingivální odstranění.
Všem účastníkům bude supragingiválně odstraněn zubní plak z různých povrchů zubů.
Všichni účastníci budou mít odběr slin.
RA reagující na anti-TNF
Tato skupina se bude skládat z 25 dospělých pacientů s revmatoidní artritidou (RA), kteří reagovali na anti-TNF-alfa terapii první linie. Během vyšetření bude probíhat následující: multidimenzionální dotazník hodnocení zdraví (MDHAQ), zubní vyšetření, odběr slin a zubní plak budou odstraněny z různých povrchů zubů pro supragingivální odstranění.
Všem účastníkům bude supragingiválně odstraněn zubní plak z různých povrchů zubů.
Skupiny RA obdrží vícerozměrný dotazník hodnocení zdraví (MDHAQ) pro fyzické funkce, bolest a globální stav.
Ostatní jména:
  • MDHAQ
Všichni účastníci budou mít odběr slin.
RA nereagující na anti-TNF
Tato skupina se bude skládat z 25 dospělých subjektů s revmatoidní artritidou (RA), kteří jsou rezistentní na dvě nebo více anti-TNF-alfa terapií a budou ve stejném věku jako skupina s RA reagující na anti-TNF. Během vyšetření bude probíhat následující: multidimenzionální dotazník hodnocení zdraví (MDHAQ), zubní vyšetření, odběr slin a zubní plak budou odstraněny z různých povrchů zubů pro supragingivální odstranění.
Všem účastníkům bude supragingiválně odstraněn zubní plak z různých povrchů zubů.
Skupiny RA obdrží vícerozměrný dotazník hodnocení zdraví (MDHAQ) pro fyzické funkce, bolest a globální stav.
Ostatní jména:
  • MDHAQ
Všichni účastníci budou mít odběr slin.

Co je měření studie?

Primární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Orální mikrobiom bude katalogizován v každé skupině pro jejich asociaci s RA.
Časové okno: Den 1
Pro každý profil bude vypočítán Wilcoxonův rank-sum test, aby se identifikoval rozdílný obsah metagenomických genů mezi každým párem skupin (pacienti s RA a kontroly). Budou také hodnoceny potenciální mikrobiální funkční role markerů skupin ortologů KEGG a ortologů vaječného likéru v orální mikrobiotě pacientů s RA. Všechny výsledky budou korigovány pro vícenásobné testování pomocí přístupu falešných objevů.
Den 1
K nalezení markerů orálních bakterií mezi skupinami budou provedeny metagenomické analýzy.
Časové okno: 18 měsíců
Pro každý profil bude vypočítán Wilcoxonův rank-sum test, aby se identifikoval rozdílný obsah metagenomických genů mezi jednotlivými skupinami.
18 měsíců

Spolupracovníci a vyšetřovatelé

Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.

Vyšetřovatelé

  • Vrchní vyšetřovatel: Michael R Bubb, MD, University of Florida
  • Vrchní vyšetřovatel: Edward K Chan, Ph.D., University of Florida

Termíny studijních záznamů

Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.

Hlavní termíny studia

Začátek studia

1. května 2016

Primární dokončení (Aktuální)

8. srpna 2019

Dokončení studie (Aktuální)

8. srpna 2019

Termíny zápisu do studia

První předloženo

31. srpna 2015

První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality

4. září 2015

První zveřejněno (Odhad)

9. září 2015

Aktualizace studijních záznamů

Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)

12. srpna 2019

Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality

8. srpna 2019

Naposledy ověřeno

1. srpna 2019

Více informací

Termíny související s touto studií

Další identifikační čísla studie

  • IRB201500286
  • 11712325 (Jiné číslo grantu/financování: Department of Defense)
  • 12.420 (Jiné číslo grantu/financování: Department of Defense)

Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)

Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?

Nerozhodný

Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty

Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA

Ne

Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA

Ne

Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .

Klinické studie na Zubní plak

Předplatit