Suun metagenomiset biomarkkerit nivelreumassa
Nivelreuma (RA) on krooninen ja mahdollisesti vakava autoimmuunisairaus, joka vaikuttaa 2 miljoonaan Yhdysvalloissa. Ympäristötekijöiden rooli autoimmuniteetin patogeneesin moduloinnissa on kuvattu selkeästi, mutta erityiset vaikutusmekanismit ovat edelleen huonosti ymmärrettyjä. Yhä useammat todisteet viittaavat limakalvopintojen mikrobiottoon autoimmuunisairauksien kehittymiseen. Useat tutkimukset ovat selvästi yhdistäneet nivelreuman parodontaaliin. Jälkimmäinen liittyy punaiseen kompleksiin, joka sisältää suun bakteerin Porphyromonas gingivalis. Silti ei ole tehty systemaattista analyysiä nivelreuman suun mikrobiotosta sen määrittämiseksi, onko P. gingivalikselle (ja muille suun bakteereille) spesifisiä markkereita, jotka liittyvät nivelreumaan.
Tässä tutkimuksessa tutkijat karakterisoivat suun mikrobikoostumusta (mikrobiomia) ja geenipitoisuutta (metagenomi) DNA:sta, joka on eristetty suunäytteistä, jotka on saatu potilailta, joilla on (i) varhaisen vaiheen nivelreuma ennen biologisia hoitoja ja (ii) nivelreumapotilaiden alaryhmiä. jotka reagoivat tai eivät reagoi anti-TNF-alfa-hoitoon. Tämän tutkimuksen innovatiivinen puoli on suun bakteerilajien tunnistamisen lisäksi näihin ryhmiin liittyvien kantojen ja geenien taso. Yleinen hypoteesi on, että yksilöiden välillä on suun mikrobien vaihtelua, joka vaikuttaa autoimmuniteetin ja autoimmuunisairauden kehittymiseen.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Ehdot
Yksityiskohtainen kuvaus
Tämä on monialainen tutkimus, jossa on viisi tutkijaa eri, mutta toisiaan täydentävistä tieteenaloista tämän uuden yhteistyön perustamiseksi. Tästä projektista saadulle tiedolle on suuri translaatiopotentiaali, joka perustuu reumatologin, hammaslääkärin, suubiologien ja immunologian, mikrobiologian ja genomiikan asiantuntemusta omaavien tartuntatautiasiantuntijoiden yhteistyöhön. Lyhyesti sanottuna reumatologi rekrytoi RA-osallistujat. Kahteen tutkittavaan ryhmään rekrytoidaan yhteensä 100 osallistujaa; yksi ryhmä nivelreumapotilaita ja toinen ryhmä on terveitä kontrolleja. Nämä kaksi ryhmää jaetaan seuraaviin ryhmiin tutkimukseen osallistumista varten: Ryhmä 1: koostuu 25 aikuisesta nivelreumapotilaasta, joita ei ole hoidettu biologisilla lääkkeillä ja joita verrataan 25 terveeseen kontrolliin saman kotitalouden samanikäisistä jäsenistä. . Ryhmä 2 koostuu 25 nivelreuman aikuisesta koehenkilöstä, jotka reagoivat ensimmäisen linjan anti-TNF-hoitoon ja joita verrataan 25:tä samaa ikää ja sukupuolta olevaan RA-potilaaseen, jotka ovat resistenttejä kahdelle tai useammalle TNF-antagonistille. Osallistujat järjestetään tutkimusvierailulle Floridan yliopiston hammasklinikan tutkimusyksikössä. Tutkimuksen aikana suoritetaan: moniulotteinen terveysarviokysely (MDHAQ), hammastutkimus, syljen kerääminen ja plakki poistetaan eri hampaiden pinnoilta supragingivaalia varten.
Supragingivalille suoritetaan syvä sekvensointi genomiikkalaboratoriossa. Testaamalla kahta erityistä tavoitetta: 1) testata hypoteesia, että 16S-RNA-tietoihin perustuvat suun mikrobiomiprofiilit liittyvät nivelreuman kehittymiseen tai vasteeseen tiettyyn hoitoon, ja 2) testata hypoteesia, että tietyt geenit, variantit ja toiminnalliset kyvyt (metagenomi) liittyvät nivelreumaan tai terapeuttiseen vasteeseen. Tämän pilottitutkimuksen päätyttyä tutkijat ovat systemaattisesti tunnistaneet bakteerien biomarkkereita (esim. lajit, alalajit, geenit), jotka korreloivat RA:n kanssa ja voivat toimia mahdollisina kohteina taudin hoidossa. Näistä markkereista voidaan kehittää uusia lääkekohteita nivelreumahoitoon tulevissa tutkimuksissa.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Todellinen)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskelupaikat
-
-
Florida
-
Gainesville, Florida, Yhdysvallat, 32610
- University of Florida College of Dentistry-Periodontics
-
Gainesville, Florida, Yhdysvallat, 32611
- Randall Malcom VA Medical Center
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- on oltava vähintään 10 luonnollista kruunaamatonta hammasta (pois lukien kolmatta poskihampaa).
Poissulkemiskriteerit:
- on alle 10 hammasta;
- olet saanut antibiootteja viimeisen 3 kuukauden aikana, mukaan lukien potilaat, jotka tarvitsevat antibioottiprofylaksiaa ennen hammashoitoa;
- ovat immuunipuutteisia henkilöitä (HIV, AIDS, immuunivastetta heikentävä lääkehoito);
- osallistua toiseen kliiniseen tutkimukseen, johon liittyy hammashoitotuotteiden käyttöä viikkoa ennen huuhtelujakson alkua tai tutkimusjakson aikana; ja
- eivät halua tai pysty antamaan tietoista suostumusta ja noudattamaan keräysohjeita.
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Havaintomallit: Case-Control
- Aikanäkymät: Poikkileikkaus
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
RA - naiivi biologioiden suhteen
Tämä ryhmä koostuu 25 nivelreumaa (RA) sairastavasta aikuisesta henkilöstä, joita ei ole hoidettu biologisilla lääkkeillä (naiiveja biologisille lääkkeille).
Tutkimuksen aikana suoritetaan: moniulotteinen terveysarviokysely (MDHAQ), hammastutkimus, syljen kerääminen ja plakki poistetaan eri hampaiden pinnoilta supragingivaalia varten.
|
Kaikilta osallistujilta poistetaan plakki eri hampaiden pinnoilta supragingivaalia varten.
RA-ryhmät saavat moniulotteisen terveysarviokyselylomakkeen (MDHAQ) fyysistä toimintaa, kipua ja globaalia tilaa varten.
Muut nimet:
Kaikilla osallistujilla on sylkikokoelma.
|
|
Terveelliset kontrollit
Tämä ryhmä koostuu 25 aikuisesta koehenkilöstä, jotka ovat terveitä verrokkeja saman kotitalouden jäsenistä kuin 25 naiivia biologiaa käyttävää henkilöä ja ovat samanikäisiä.
Tutkimuksen aikana suoritetaan hammastutkimus, syljen kerääminen ja plakin poisto eri hampaiden pinnoilta supragingivaalia varten.
|
Kaikilta osallistujilta poistetaan plakki eri hampaiden pinnoilta supragingivaalia varten.
Kaikilla osallistujilla on sylkikokoelma.
|
|
RA herkkä anti-TNF:lle
Tämä ryhmä koostuu 25 aikuisesta nivelreumaa (RA) sairastavasta henkilöstä, jotka ovat reagoineet ensilinjan anti-TNF-alfa-hoitoon.
Tutkimuksen aikana suoritetaan: moniulotteinen terveysarviokysely (MDHAQ), hammastutkimus, syljen kerääminen ja plakki poistetaan eri hampaiden pinnoilta supragingivaalia varten.
|
Kaikilta osallistujilta poistetaan plakki eri hampaiden pinnoilta supragingivaalia varten.
RA-ryhmät saavat moniulotteisen terveysarviokyselylomakkeen (MDHAQ) fyysistä toimintaa, kipua ja globaalia tilaa varten.
Muut nimet:
Kaikilla osallistujilla on sylkikokoelma.
|
|
RA ei reagoi anti-TNF:ään
Tämä ryhmä koostuu 25 aikuisesta nivelreumaa (RA) sairastavasta henkilöstä, jotka ovat resistenttejä kahdelle tai useammalle anti-TNF-alfa-hoidolle ja ovat samanikäisiä kuin nivelreuma, joka reagoi anti-TNF-hoitoon.
Tutkimuksen aikana suoritetaan: moniulotteinen terveysarviokysely (MDHAQ), hammastutkimus, syljen kerääminen ja plakki poistetaan eri hampaiden pinnoilta supragingivaalia varten.
|
Kaikilta osallistujilta poistetaan plakki eri hampaiden pinnoilta supragingivaalia varten.
RA-ryhmät saavat moniulotteisen terveysarviokyselylomakkeen (MDHAQ) fyysistä toimintaa, kipua ja globaalia tilaa varten.
Muut nimet:
Kaikilla osallistujilla on sylkikokoelma.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Suun mikrobiomi luetteloidaan kussakin ryhmässä sen suhteen, miten ne liittyvät nivelreumaan.
Aikaikkuna: Päivä 1
|
Jokaiselle profiilille lasketaan Wilcoxonin rank-sum testi, jolla tunnistetaan erilainen metagenominen geenisisältö kunkin ryhmäparin (RA-potilaat ja kontrollit) välillä.
Arvioidaan myös KEGG-ortologien ja munanogin ortologiryhmien markkereiden mahdolliset mikrobitoiminnalliset roolit nivelreumapotilaiden suun mikrobiotassa.
Kaikki tulokset korjataan useita testauksia varten käyttämällä väärän havaitsemisnopeuden lähestymistapaa.
|
Päivä 1
|
|
Metagenomiset analyysit suoritetaan suun bakteerimarkkerien löytämiseksi ryhmien välillä.
Aikaikkuna: 18 kuukautta
|
Jokaiselle profiilille lasketaan Wilcoxonin rank-sum -testi, jotta voidaan tunnistaa erilainen metagenominen geenisisältö kunkin ryhmän välillä.
|
18 kuukautta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Tutkijat
- Päätutkija: Michael R Bubb, MD, University of Florida
- Päätutkija: Edward K Chan, Ph.D., University of Florida
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Opintojen valmistuminen (Todellinen)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Arvio)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- IRB201500286
- 11712325 (Muu apuraha/rahoitusnumero: Department of Defense)
- 12.420 (Muu apuraha/rahoitusnumero: Department of Defense)
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .
Kliiniset tutkimukset Nivelreuma
-
RemeGen Co., Ltd.ValmisKeskivaikea ja vaikea RheumatoId-niveltulehdusKiina
Kliiniset tutkimukset Hammasplakki
-
Bon-Kwon KooSeoul St. Mary's Hospital, The Catholic UniversityRekrytointi
-
National Taiwan University HospitalValmisBite Force | Skannauksen viiveTaiwan
-
Chimei Medical CenterKaohsiung Medical UniversityRekrytointiDiabetes mellitus tyyppi 2 ja parodontaalinen sairausTaiwan
-
Murad AlrashidiEi vielä rekrytointiaHampaiden karies | Hampaiden vammat | Primary Tooth RestorationSaudi-Arabia
-
Virginia Commonwealth UniversityValmisHenkinen vamma | Hammaslääkärin ahdistus | KehitysvammaYhdysvallat
-
Kaohsiung Medical University Chung-Ho Memorial...RekrytointiDiabetes mellitus tyyppi 2 ja parodontaalinen sairausTaiwan
-
Biotech DentalRekrytointiHammasimplantti | Hampaiden restaurointi | Hammaslääketiede | Implanttituettu kiinteä proteesiRanska
-
Solvay Dental 360ValmisPuuttuvat hampaat | HammasvaatteetYhdysvallat, Yhdistynyt kuningaskunta
-
Asst. Prof. Dr. Suleyman Emre MeseliValmis
-
University of California, IrvineMassachusetts General Hospital; Nationwide Children's Hospital; California... ja muut yhteistyökumppanitValmisAutismispektrihäiriöYhdysvallat