Пероральные метагеномные биомаркеры при ревматоидном артрите
Ревматоидный артрит (РА) является хроническим и потенциально тяжелым аутоиммунным заболеванием, поражающим 2 миллиона человек в Соединенных Штатах. Роль факторов окружающей среды в модулировании патогенеза аутоиммунитета была четко описана, однако конкретные механизмы действия остаются плохо изученными. Растущее количество данных свидетельствует о причастности микробиоты слизистых оболочек к развитию аутоиммунных заболеваний. Различные исследования четко связывают РА с заболеванием пародонта. Последний связан с красным комплексом, который включает оральную бактерию Porphyromonas gingivalis. И все же не было проведено систематического анализа микробиоты полости рта при РА, чтобы определить, существуют ли специфические маркеры для P. gingivalis (и других бактерий полости рта), которые связаны с РА.
В этом исследовании исследователи охарактеризуют микробный состав полости рта (микробиом) и содержание генов (метагеном) ДНК, выделенной из образцов полости рта, полученных от пациентов с (i) ранней стадией РА до лечения биологическими препаратами и (ii) подгруппами пациентов с РА, которым реагирующие или не реагирующие на терапию анти-ФНО-альфа. Инновационный аспект этого исследования выходит за рамки идентификации видов бактерий полости рта на уровень штаммов и генов, связанных с этими группами. Общая гипотеза состоит в том, что между людьми существует оральная микробная вариация, которая влияет на развитие аутоиммунитета и аутоиммунного заболевания.
Обзор исследования
Статус
Условия
Вмешательство/лечение
Подробное описание
Это междисциплинарное исследование с пятью исследователями из разных, но взаимодополняющих дисциплин для установления этого нового сотрудничества. Информация, полученная в результате этого проекта, обладает высоким трансляционным потенциалом благодаря сотрудничеству ревматолога, стоматолога, оральных биологов и специалистов по инфекционным заболеваниям, обладающих знаниями в области иммунологии, микробиологии и геномики. Вкратце, участников РА будет набирать ревматолог. Всего будет набрано 100 участников для изучения двух групп; одна группа субъектов с РА, а другая группа будет здоровым контролем. Эти две группы будут разделены на следующие группы для участия в исследовании: Группа 1: будет состоять из 25 взрослых пациентов с РА, не получавших лечения биологическими препаратами, которые будут сравниваться с 25 здоровыми контрольными группами из тех же возрастных членов того же домохозяйства. . Группа 2 будет состоять из 25 взрослых субъектов с РА, отвечающих на терапию против TNF первой линии, которых будут сравнивать с 25 субъектами того же возраста и пола с RA, которые устойчивы к двум или более антагонистам TNF. Участникам будет назначен исследовательский визит в исследовательский отдел стоматологической клиники Университета Флориды. Во время осмотра будет проведено следующее: анкета многомерной оценки здоровья (MDHAQ), стоматологический осмотр, сбор слюны, зубной налет будет удален с разных поверхностей зубов для наддесневой.
Наддесневой участок будет подвергнут глубокому секвенированию в лаборатории геномики. Проверить две конкретные цели: 1) проверить гипотезу о том, что профили микробиома полости рта, основанные на данных 16S РНК, связаны с развитием РА или ответом на конкретную терапию, и 2) проверить гипотезу о том, что определенные гены, варианты и функциональные возможности (метагеномы) связаны с РА или с терапевтическим ответом. По завершении этого пилотного исследования исследователи будут систематически определять бактериальные биомаркеры (например, виды, подвиды, гены), которые коррелируют с РА и могут служить потенциальными мишенями для лечения заболевания. Эти маркеры могут быть превращены в новые лекарственные мишени для терапии РА в будущих исследованиях.
Тип исследования
Регистрация (Действительный)
Контакты и местонахождение
Места учебы
-
-
Florida
-
Gainesville, Florida, Соединенные Штаты, 32610
- University of Florida College of Dentistry-Periodontics
-
Gainesville, Florida, Соединенные Штаты, 32611
- Randall Malcom VA Medical Center
-
-
Критерии участия
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
Принимает здоровых добровольцев
Полы, имеющие право на обучение
Метод выборки
Исследуемая популяция
Описание
Критерии включения:
- должно присутствовать не менее 10 естественных зубов без коронок (исключая третьи моляры).
Критерий исключения:
- иметь менее 10 зубов;
- лечились антибиотиками в течение последних 3 месяцев, включая пациентов, которым требуется антибиотикопрофилактика перед стоматологическим лечением;
- лица с ослабленным иммунитетом (ВИЧ, СПИД, иммуносупрессивная медикаментозная терапия);
- участвовать в другом клиническом исследовании с использованием стоматологических продуктов за неделю до начала периода вымывания или в течение периода исследования; и
- не хотят или не могут дать информированное согласие и следовать инструкциям по сбору.
Учебный план
Как устроено исследование?
Детали дизайна
- Наблюдательные модели: Кейс-контроль
- Временные перспективы: Поперечный разрез
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
РА - наивный к биологическим препаратам
Эта группа будет состоять из 25 взрослых пациентов с ревматоидным артритом (РА), которые не лечились биологическими препаратами (наивными для биологических препаратов).
Во время осмотра будет проведено следующее: анкета многомерной оценки здоровья (MDHAQ), стоматологический осмотр, сбор слюны, зубной налет будет удален с разных поверхностей зубов для наддесневой.
|
У всех участников будет удален зубной налет с разных поверхностей зубов для наддесневой.
Группы RA получат многомерный опросник для оценки состояния здоровья (MDHAQ) для физической функции, боли и общего состояния.
Другие имена:
У всех участников будет сбор слюны.
|
|
Здоровый контроль
Эта группа будет состоять из 25 взрослых субъектов, которые будут здоровыми контрольными членами той же семьи, что и 25 человек, не получавших биологические препараты, и будут одного возраста.
Во время осмотра будет проведено следующее: стоматологический осмотр, сбор слюны, зубной налет будет удален с разных поверхностей зубов для наддесневой.
|
У всех участников будет удален зубной налет с разных поверхностей зубов для наддесневой.
У всех участников будет сбор слюны.
|
|
РА, чувствительный к анти-ФНО
Эта группа будет состоять из 25 взрослых пациентов с ревматоидным артритом (РА), которые реагируют на первую линию анти-ФНО-альфа-терапии.
Во время осмотра будет проведено следующее: анкета многомерной оценки здоровья (MDHAQ), стоматологический осмотр, сбор слюны, зубной налет будет удален с разных поверхностей зубов для наддесневой.
|
У всех участников будет удален зубной налет с разных поверхностей зубов для наддесневой.
Группы RA получат многомерный опросник для оценки состояния здоровья (MDHAQ) для физической функции, боли и общего состояния.
Другие имена:
У всех участников будет сбор слюны.
|
|
РА, не отвечающий на анти-ФНО
Эта группа будет состоять из 25 взрослых субъектов с ревматоидным артритом (РА), резистентных к двум или более видам терапии анти-ФНО-альфа, и быть того же возраста, что и группа пациентов с РА, реагирующих на анти-ФНО-альфа.
Во время осмотра будет проведено следующее: анкета многомерной оценки здоровья (MDHAQ), стоматологический осмотр, сбор слюны, зубной налет будет удален с разных поверхностей зубов для наддесневой.
|
У всех участников будет удален зубной налет с разных поверхностей зубов для наддесневой.
Группы RA получат многомерный опросник для оценки состояния здоровья (MDHAQ) для физической функции, боли и общего состояния.
Другие имена:
У всех участников будет сбор слюны.
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Оральный микробиом будет каталогизирован в каждой группе на предмет их связи с ревматоидным артритом.
Временное ограничение: 1 день
|
Критерий суммы рангов Уилкоксона будет вычисляться для каждого профиля, чтобы определить дифференциальное содержание метагеномных генов между каждой парой групп (пациенты с РА и контрольная группа).
Также будет оцениваться потенциальная микробная функциональная роль маркеров групп ортологов KEGG и ортологов гоголя-моголь в микробиоте полости рта пациентов с РА.
Все результаты будут скорректированы для многократного тестирования с использованием подхода ложного обнаружения.
|
1 день
|
|
Будет проведен метагеномный анализ, чтобы найти маркеры бактерий полости рта между группами.
Временное ограничение: 18 месяцев
|
Критерий суммы рангов Уилкоксона будет рассчитан для каждого профиля, чтобы определить дифференциальное содержание метагеномных генов между каждой группой.
|
18 месяцев
|
Соавторы и исследователи
Спонсор
Следователи
- Главный следователь: Michael R Bubb, MD, University of Florida
- Главный следователь: Edward K Chan, Ph.D., University of Florida
Даты записи исследования
Изучение основных дат
Начало исследования
Первичное завершение (Действительный)
Завершение исследования (Действительный)
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Первый опубликованный (Оценивать)
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последняя проверка
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
- IRB201500286
- 11712325 (Другой номер гранта/финансирования: Department of Defense)
- 12.420 (Другой номер гранта/финансирования: Department of Defense)
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .