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Biomarcatori metagenomici orali nell'artrite reumatoide

8 agosto 2019 aggiornato da: University of Florida

L'artrite reumatoide (AR) è una malattia autoimmune cronica e potenzialmente grave che colpisce 2 milioni di persone negli Stati Uniti. Il ruolo dei fattori ambientali nella modulazione della patogenesi dell'autoimmunità è stato chiaramente descritto e tuttavia i meccanismi d'azione specifici rimangono poco conosciuti. Un numero crescente di prove implica il microbiota delle superfici mucose nello sviluppo di malattie autoimmuni. Vari studi hanno chiaramente collegato l'AR alla malattia parodontale. Quest'ultimo è legato al complesso rosso che comprende il batterio orale Porphyromonas gingivalis. Eppure non c'è stata un'analisi sistematica del microbiota orale nell'AR per determinare se ci sono marcatori specifici per P. gingivalis (e altri batteri orali) che sono collegati all'AR.

In questo studio, i ricercatori caratterizzeranno la composizione microbica orale (microbioma) e il contenuto genico (metagenoma) del DNA isolato da campioni orali ottenuti da pazienti con (i) RA in stadio iniziale prima dei trattamenti biologici e (ii) sottogruppi di pazienti affetti da AR che sono responsivo o non responsivo alla terapia anti-TNF-alfa. L'aspetto innovativo di questo studio sta andando oltre l'identificazione delle specie batteriche orali, a livello di ceppi e geni associati a questi gruppi. L'ipotesi generale è che esista una variazione microbica orale tra gli individui che influenza lo sviluppo dell'autoimmunità e delle malattie autoimmuni.

Panoramica dello studio

Stato

Completato

Condizioni

Intervento / Trattamento

Descrizione dettagliata

Questo è uno studio di ricerca multidisciplinare con cinque ricercatori provenienti da discipline diverse, ma complementari, per stabilire questa nuova collaborazione. Esiste un alto potenziale di traduzione per le informazioni ottenute da questo progetto basato sulla collaborazione di un reumatologo, un dentista, biologi orali ed esperti di malattie infettive con esperienza in immunologia, microbiologia e genomica. In breve, i partecipanti RA saranno reclutati dal reumatologo. Verrà reclutato un totale di 100 partecipanti per due gruppi da studiare; un gruppo di soggetti con AR e l'altro gruppo saranno controlli sani. Questi due gruppi saranno divisi nei seguenti gruppi per la partecipazione allo studio: Gruppo 1: sarà composto da 25 soggetti adulti con RA che non sono stati trattati con farmaci biologici che saranno confrontati con 25 controlli sani di membri della stessa età della stessa famiglia . Il gruppo 2 sarà composto da 25 soggetti adulti affetti da AR che rispondono alla terapia anti-TNF di prima linea che saranno confrontati con 25 soggetti della stessa età e sesso con AR che sono resistenti a due o più antagonisti del TNF. I partecipanti saranno programmati per una visita di studio di ricerca presso l'Unità di ricerca della clinica odontoiatrica dell'Università della Florida. Durante l'esame si svolgeranno: il questionario di valutazione della salute multidimensionale (MDHAQ), l'esame odontoiatrico, la raccolta della saliva e la placca dentale verrà rimossa dalle diverse superfici dei denti per sopragengivale.

Il sopragengivale sarà sottoposto a sequenziamento profondo nel laboratorio di genomica. Testare due obiettivi specifici: 1) testare l'ipotesi che i profili del microbioma orale basati sui dati dell'RNA 16S siano associati allo sviluppo dell'AR o alla risposta a una terapia specifica, e 2) testare l'ipotesi che i geni specifici, le varianti e le capacità funzionali (metagenoma) sono associate all'artrite reumatoide o alla risposta terapeutica. Al termine di questo studio pilota, i ricercatori avranno identificato sistematicamente i biomarcatori batterici (ad es. specie, sottospecie, geni) che correlano con l'artrite reumatoide e possono servire come potenziali bersagli per il trattamento della malattia. Questi marcatori possono essere sviluppati in nuovi bersagli farmacologici per la terapia dell'AR in studi futuri.

Tipo di studio

Osservativo

Iscrizione (Effettivo)

92

Contatti e Sedi

Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.

Luoghi di studio

  • Stati Uniti
    • Florida
      • Gainesville, Florida, Stati Uniti, 32610
        • University of Florida College of Dentistry-Periodontics
      • Gainesville, Florida, Stati Uniti, 32611
        • Randall Malcom VA Medical Center

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

Da 18 anni a 85 anni (Adulto, Adulto più anziano)

Accetta volontari sani

No

Sessi ammissibili allo studio

Tutto

Metodo di campionamento

Campione di probabilità

Popolazione di studio

Pazienti adulti con artrite reumatoide (AR) che non sono stati trattati con farmaci biologici (naïve ai farmaci biologici), pazienti con AR che rispondono alla terapia anti-TNF di prima linea, pazienti con AR che sono resistenti a due o più antagonisti del TNF e controlli sani della stessa età membri della stessa famiglia.

Descrizione

Criterio di inclusione:

  • devono essere presenti almeno 10 denti naturali non coronati (esclusi i terzi molari).

Criteri di esclusione:

  • avere meno di 10 denti;
  • sono stati trattati con antibiotici negli ultimi 3 mesi, compresi i pazienti che necessitano di profilassi antibiotica prima del trattamento odontoiatrico;
  • sono individui immunocompromessi (HIV, AIDS, terapia farmacologica immunosoppressiva);
  • partecipare a un altro studio clinico che prevede l'uso di prodotti dentali una settimana prima dell'inizio del periodo di sospensione o durante il periodo di studio; e
  • non vogliono o non possono fornire il consenso informato e seguire le istruzioni per la raccolta.

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

  • Modelli osservazionali: Caso di controllo
  • Prospettive temporali: Trasversale

Coorti e interventi

Gruppo / Coorte
Intervento / Trattamento
RA - naïve ai prodotti biologici
Questo gruppo sarà composto da 25 soggetti adulti con artrite reumatoide (AR) che non sono stati trattati con farmaci biologici (naïve ai biologici). Durante l'esame si svolgeranno: il questionario di valutazione della salute multidimensionale (MDHAQ), l'esame odontoiatrico, la raccolta della saliva e la placca dentale verrà rimossa dalle diverse superfici dei denti per sopragengivale.
Procedura: Placca dentale
A tutti i partecipanti verrà rimossa la placca dentale da diverse superfici dei denti per sopragengivale.
Altro: Questionario multidimensionale per la valutazione della salute (MDHAQ)
I gruppi RA riceveranno il questionario di valutazione della salute multidimensionale (MDHAQ) per la funzione fisica, il dolore e lo stato globale.
Altri nomi:
  • MDHAQ
Altro: Raccolta della saliva
Tutti i partecipanti avranno una raccolta della saliva.
Controlli sani
Questo gruppo sarà composto da 25 soggetti adulti che saranno controlli sani provenienti da membri della stessa famiglia dei 25 naive ai biologici e avranno la stessa età. Durante l'esame si svolgeranno: esame dentale, raccolta della saliva e rimozione della placca dentale da diverse superfici dentali per sopragengivale.
Procedura: Placca dentale
A tutti i partecipanti verrà rimossa la placca dentale da diverse superfici dei denti per sopragengivale.
Altro: Raccolta della saliva
Tutti i partecipanti avranno una raccolta della saliva.
RA sensibile all'anti-TNF
Questo gruppo sarà composto da 25 soggetti adulti con artrite reumatoide (RA) che hanno risposto alla terapia anti-TNF-alfa di prima linea. Durante l'esame si svolgeranno: il questionario di valutazione della salute multidimensionale (MDHAQ), l'esame odontoiatrico, la raccolta della saliva e la placca dentale verrà rimossa dalle diverse superfici dei denti per sopragengivale.
Procedura: Placca dentale
A tutti i partecipanti verrà rimossa la placca dentale da diverse superfici dei denti per sopragengivale.
Altro: Questionario multidimensionale per la valutazione della salute (MDHAQ)
I gruppi RA riceveranno il questionario di valutazione della salute multidimensionale (MDHAQ) per la funzione fisica, il dolore e lo stato globale.
Altri nomi:
  • MDHAQ
Altro: Raccolta della saliva
Tutti i partecipanti avranno una raccolta della saliva.
AR non responsivo all'anti-TNF
Questo gruppo sarà composto da 25 soggetti adulti con artrite reumatoide (AR) resistenti a due o più terapie anti-TNF-alfa e della stessa età dell'AR che risponde al gruppo anti-TNF. Durante l'esame si svolgeranno: il questionario di valutazione della salute multidimensionale (MDHAQ), l'esame odontoiatrico, la raccolta della saliva e la placca dentale verrà rimossa dalle diverse superfici dei denti per sopragengivale.
Procedura: Placca dentale
A tutti i partecipanti verrà rimossa la placca dentale da diverse superfici dei denti per sopragengivale.
Altro: Questionario multidimensionale per la valutazione della salute (MDHAQ)
I gruppi RA riceveranno il questionario di valutazione della salute multidimensionale (MDHAQ) per la funzione fisica, il dolore e lo stato globale.
Altri nomi:
  • MDHAQ
Altro: Raccolta della saliva
Tutti i partecipanti avranno una raccolta della saliva.

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Il microbioma orale sarà catalogato in ciascun gruppo per la sua associazione con l'AR.
Lasso di tempo: Giorno 1
Un test Wilcoxon per la somma dei ranghi sarà calcolato su ogni profilo per identificare il contenuto genico metagenomico differenziale tra ogni coppia di gruppi (pazienti con AR e controlli). Saranno inoltre valutati i potenziali ruoli funzionali microbici degli ortologhi KEGG e dei marcatori dei gruppi ortologhi di zabaione nel microbiota orale dei pazienti affetti da AR. Tutti i risultati verranno corretti per test multipli utilizzando un approccio al tasso di scoperta falso.
Giorno 1
Verranno eseguite analisi metagenomiche per trovare marcatori di batteri orali tra i gruppi.
Lasso di tempo: 18 mesi
Un test di Wilcoxon per la somma dei ranghi sarà calcolato su ciascun profilo per identificare il contenuto genico metagenomico differenziale tra ciascun gruppo.
18 mesi

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Sponsor

University of Florida

Collaboratori

United States Department of Defense
VA Medical Center-Gainesville

Investigatori

  • Investigatore principale: Michael R Bubb, MD, University of Florida
  • Investigatore principale: Edward K Chan, Ph.D., University of Florida

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio

1 maggio 2016

Completamento primario (Effettivo)

8 agosto 2019

Completamento dello studio (Effettivo)

8 agosto 2019

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

31 agosto 2015

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

4 settembre 2015

Primo Inserito (Stima)

9 settembre 2015

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)

12 agosto 2019

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

8 agosto 2019

Ultimo verificato

1 agosto 2019

Maggiori informazioni

Termini relativi a questo studio

Parole chiave

Termini MeSH pertinenti aggiuntivi

Altri numeri di identificazione dello studio

  • IRB201500286
  • 11712325 (Altro numero di sovvenzione/finanziamento: Department of Defense)
  • 12.420 (Altro numero di sovvenzione/finanziamento: Department of Defense)

Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)

Hai intenzione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD)?

Indeciso

Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio

Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Queste informazioni sono state recuperate direttamente dal sito web clinicaltrials.gov senza alcuna modifica. In caso di richieste di modifica, rimozione o aggiornamento dei dettagli dello studio, contattare register@clinicaltrials.gov. Non appena verrà implementata una modifica su clinicaltrials.gov, questa verrà aggiornata automaticamente anche sul nostro sito web .

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