Orale metagenomische biomarkers bij reumatoïde artritis

Dit is een multidisciplinair onderzoek met vijf onderzoekers uit verschillende, maar complementaire disciplines om deze nieuwe samenwerking tot stand te brengen. Er is een hoog vertaalpotentieel voor informatie die uit dit project is verkregen, gebaseerd op de samenwerking van een reumatoloog, een tandarts, orale biologen en deskundigen op het gebied van infectieziekten met expertise in immunologie, microbiologie en genomica. Kortom, RA-deelnemers worden geworven door de reumatoloog. Er zullen in totaal 100 deelnemers worden geworven voor twee te bestuderen groepen; de ene groep proefpersonen met RA en de andere groep zullen gezonde controles zijn. Deze twee groepen zullen worden verdeeld in de volgende groepen voor deelname aan het onderzoek: Groep 1: zal bestaan ​​uit 25 volwassen proefpersonen met RA die niet zijn behandeld met biologische geneesmiddelen die zullen worden vergeleken met 25 gezonde controles van leeftijdsgenoten uit hetzelfde huishouden . Groep 2 zal bestaan ​​uit 25 volwassen RA-patiënten die reageren op eerstelijns anti-TNF-therapie, die zal worden vergeleken met 25 patiënten van dezelfde leeftijd en hetzelfde geslacht met RA die resistent zijn tegen twee of meer TNF-antagonisten. De deelnemers zullen worden ingepland voor een onderzoeksbezoek aan de University of Florida Dental Clinic Research Unit. Tijdens het onderzoek vindt het volgende plaats: de multidimensionale gezondheidsbeoordelingsvragenlijst (MDHAQ), tandheelkundig onderzoek, speekselverzameling en tandplak worden verwijderd van verschillende tandoppervlakken voor supragingivaal.

Het supragingivaal zal worden onderworpen aan deep sequencing in het genomics lab. Om twee specifieke doelen te testen: 1) het testen van de hypothese dat orale microbioomprofielen op basis van 16S RNA-gegevens geassocieerd zijn met de ontwikkeling van RA of met de respons op een specifieke therapie, en 2) het testen van de hypothese dat de specifieke genen, varianten en functionele mogelijkheden (metagenoom) zijn geassocieerd met RA of met therapeutische respons. Na voltooiing van deze pilootstudie zullen de onderzoekers systematisch bacteriële biomarkers hebben geïdentificeerd (bijv. soorten, ondersoorten, genen) die correleren met RA en mogelijk dienen als doelwit voor ziektebehandeling. Deze markers kunnen in toekomstige studies worden ontwikkeld tot nieuwe medicijndoelen voor RA-therapie.