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Biomarcadores metagenómicos orales en la artritis reumatoide

8 de agosto de 2019 actualizado por: University of Florida

La artritis reumatoide (AR) es una enfermedad autoinmune crónica y potencialmente grave que afecta a 2 millones en los Estados Unidos. El papel de los factores ambientales en la modulación de la patogenia de la autoinmunidad se ha descrito claramente y, sin embargo, los mecanismos de acción específicos siguen sin comprenderse bien. Un creciente cuerpo de evidencia implica a la microbiota de las superficies mucosas en el desarrollo de trastornos autoinmunes. Varios estudios han relacionado claramente la AR con la enfermedad periodontal. Este último está vinculado al complejo rojo que incluye la bacteria oral Porphyromonas gingivalis. Y, sin embargo, no ha habido un análisis sistemático de la microbiota oral en la AR para determinar si existen marcadores específicos para P. gingivalis (y otras bacterias orales) que estén relacionados con la AR.

En este estudio, los investigadores caracterizarán la composición microbiana oral (microbioma) y el contenido genético (metagenoma) del ADN aislado de muestras orales obtenidas de pacientes con (i) AR en etapa temprana antes de los tratamientos biológicos y (ii) subgrupos de pacientes con AR que están responde o no responde a la terapia anti-TNF-alfa. El aspecto innovador de este estudio va más allá de la identificación de especies bacterianas orales, al nivel de cepas y genes que se asocian a estos grupos. La hipótesis general es que existe una variación microbiana oral entre los individuos que influye en el desarrollo de la autoinmunidad y la enfermedad autoinmune.

Descripción general del estudio

Descripción detallada

Este es un estudio de investigación multidisciplinario con cinco investigadores de disciplinas diferentes pero complementarias para establecer esta nueva colaboración. Hay un alto potencial de traducción para la información obtenida de este proyecto basado en la colaboración de un reumatólogo, un dentista, biólogos orales y expertos en enfermedades infecciosas con experiencia en inmunología, microbiología y genómica. En resumen, los participantes con AR serán reclutados por el reumatólogo. Se reclutarán un total de 100 participantes para dos grupos a estudiar; un grupo de sujetos con AR y el otro grupo serán controles sanos. Estos dos grupos se dividirán en los siguientes grupos para participar en el estudio: Grupo 1: consistirá en 25 sujetos adultos con AR que no han sido tratados con productos biológicos que se compararán con 25 controles sanos de miembros del mismo hogar de la misma edad. . El grupo 2 consistirá en 25 sujetos adultos con AR que responden a la terapia anti-TNF de primera línea que se compararán con 25 sujetos de la misma edad y sexo con AR que son resistentes a dos o más antagonistas del TNF. Se programará a los participantes para una visita de estudio de investigación en la Unidad de Investigación de la Clínica Dental de la Universidad de Florida. Durante el examen se llevará a cabo lo siguiente: el cuestionario de evaluación de salud multidimensional (MDHAQ), examen dental, recolección de saliva y remoción de placa dental de diferentes superficies dentales para supragingival.

El supragingival se someterá a una secuenciación profunda en el laboratorio de genómica. Probar dos objetivos específicos: 1) probar la hipótesis de que los perfiles de microbioma oral basados ​​en datos de ARN 16S están asociados con el desarrollo de AR o con la respuesta a una terapia específica, y 2) probar la hipótesis de que los genes, variantes y las capacidades funcionales (metagenoma) están asociadas con la AR o con la respuesta terapéutica. Al finalizar este estudio piloto, los investigadores habrán identificado sistemáticamente biomarcadores bacterianos (p. especies, subespecies, genes) que se correlacionan con la AR y pueden servir como objetivos potenciales para el tratamiento de la enfermedad. Estos marcadores pueden convertirse en nuevos objetivos farmacológicos para la terapia de la AR en estudios futuros.

Tipo de estudio

De observación

Inscripción (Actual)

92

Contactos y Ubicaciones

Esta sección proporciona los datos de contacto de quienes realizan el estudio e información sobre dónde se lleva a cabo este estudio.

Ubicaciones de estudio

    • Florida
      • Gainesville, Florida, Estados Unidos, 32610
        • University of Florida College of Dentistry-Periodontics
      • Gainesville, Florida, Estados Unidos, 32611
        • Randall Malcom VA Medical Center

Criterios de participación

Los investigadores buscan personas que se ajusten a una determinada descripción, denominada criterio de elegibilidad. Algunos ejemplos de estos criterios son el estado de salud general de una persona o tratamientos previos.

Criterio de elegibilidad

Edades elegibles para estudiar

18 años a 85 años (Adulto, Adulto Mayor)

Acepta Voluntarios Saludables

No

Géneros elegibles para el estudio

Todos

Método de muestreo

Muestra de probabilidad

Población de estudio

Pacientes adultos con artritis reumatoide (AR) que no han sido tratados con productos biológicos (naïve a los productos biológicos), pacientes con AR que responden a la terapia anti-TNF de primera línea, pacientes con AR que son resistentes a dos o más antagonistas del TNF y controles sanos de pacientes de la misma edad. miembros del mismo hogar.

Descripción

Criterios de inclusión:

  • con al menos 10 dientes naturales sin corona (excluyendo terceros molares) debe estar presente.

Criterio de exclusión:

  • tener menos de 10 dientes;
  • han sido tratados con antibióticos en los últimos 3 meses, incluidos los pacientes que requieren profilaxis antibiótica antes del tratamiento dental;
  • son personas inmunocomprometidas (VIH, SIDA, terapia con medicamentos inmunosupresores);
  • participar en otro estudio clínico que involucre el uso de productos dentales una semana antes del inicio del período de lavado o durante el período de estudio; y
  • no quieren o no pueden dar su consentimiento informado y seguir las instrucciones de recolección.

Plan de estudios

Esta sección proporciona detalles del plan de estudio, incluido cómo está diseñado el estudio y qué mide el estudio.

¿Cómo está diseñado el estudio?

Detalles de diseño

  • Modelos observacionales: Control de caso
  • Perspectivas temporales: Transversal

Cohortes e Intervenciones

Grupo / Cohorte
Intervención / Tratamiento
RA - ingenuo a los productos biológicos
Este grupo consistirá en 25 sujetos adultos con artritis reumatoide (AR) que no han sido tratados con productos biológicos (sin experiencia previa con productos biológicos). Durante el examen se llevará a cabo lo siguiente: el cuestionario de evaluación de salud multidimensional (MDHAQ), examen dental, recolección de saliva y remoción de placa dental de diferentes superficies dentales para supragingival.
A todos los participantes se les quitará la placa dental de diferentes superficies dentales para supragingival.
Los grupos de AR recibirán el cuestionario de evaluación de salud multidimensional (MDHAQ) para la función física, el dolor y el estado global.
Otros nombres:
  • MDHAQ
Todos los participantes tendrán una colección de saliva.
Controles saludables
Este grupo consistirá en 25 sujetos adultos que serán controles sanos de miembros del mismo hogar que los 25 ingenuos a los productos biológicos y de la misma edad. Durante el examen se llevará a cabo lo siguiente: examen dental, recolección de saliva y remoción de placa dental de diferentes superficies dentales para supragingival.
A todos los participantes se les quitará la placa dental de diferentes superficies dentales para supragingival.
Todos los participantes tendrán una colección de saliva.
AR sensible a anti-TNF
Este grupo estará formado por 25 sujetos adultos con artritis reumatoide (AR) que han respondido a la terapia anti-TNF-alfa de primera línea. Durante el examen se llevará a cabo lo siguiente: el cuestionario de evaluación de salud multidimensional (MDHAQ), examen dental, recolección de saliva y remoción de placa dental de diferentes superficies dentales para supragingival.
A todos los participantes se les quitará la placa dental de diferentes superficies dentales para supragingival.
Los grupos de AR recibirán el cuestionario de evaluación de salud multidimensional (MDHAQ) para la función física, el dolor y el estado global.
Otros nombres:
  • MDHAQ
Todos los participantes tendrán una colección de saliva.
AR que no responde a anti-TNF
Este grupo estará formado por 25 sujetos adultos con artritis reumatoide (AR) que son resistentes a dos o más terapias anti-TNF-alfa y tienen la misma edad que la AR que responde al grupo anti-TNF. Durante el examen se llevará a cabo lo siguiente: el cuestionario de evaluación de salud multidimensional (MDHAQ), examen dental, recolección de saliva y remoción de placa dental de diferentes superficies dentales para supragingival.
A todos los participantes se les quitará la placa dental de diferentes superficies dentales para supragingival.
Los grupos de AR recibirán el cuestionario de evaluación de salud multidimensional (MDHAQ) para la función física, el dolor y el estado global.
Otros nombres:
  • MDHAQ
Todos los participantes tendrán una colección de saliva.

¿Qué mide el estudio?

Medidas de resultado primarias

Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
El microbioma oral se catalogará en cada grupo por su asociación con la AR.
Periodo de tiempo: Día 1
Se calculará una prueba de suma de rangos de Wilcoxon en cada perfil para identificar el contenido genético metagenómico diferencial entre cada par de grupos (pacientes con AR y controles). También se evaluarán los roles funcionales microbianos potenciales de los ortólogos de KEGG y los marcadores de grupos de ortólogos de ponche de huevo en la microbiota oral de pacientes con AR. Todos los resultados se corregirán para múltiples pruebas utilizando un enfoque de tasa de descubrimiento falso.
Día 1
Se realizarán análisis metagenómicos para encontrar marcadores de bacterias orales entre los grupos.
Periodo de tiempo: 18 meses
Se calculará una prueba de suma de rangos de Wilcoxon en cada perfil para identificar el contenido de genes metagenómicos diferenciales entre cada grupo.
18 meses

Colaboradores e Investigadores

Aquí es donde encontrará personas y organizaciones involucradas en este estudio.

Patrocinador

Investigadores

  • Investigador principal: Michael R Bubb, MD, University of Florida
  • Investigador principal: Edward K Chan, Ph.D., University of Florida

Fechas de registro del estudio

Estas fechas rastrean el progreso del registro del estudio y los envíos de resultados resumidos a ClinicalTrials.gov. Los registros del estudio y los resultados informados son revisados ​​por la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) para asegurarse de que cumplan con los estándares de control de calidad específicos antes de publicarlos en el sitio web público.

Fechas importantes del estudio

Inicio del estudio

1 de mayo de 2016

Finalización primaria (Actual)

8 de agosto de 2019

Finalización del estudio (Actual)

8 de agosto de 2019

Fechas de registro del estudio

Enviado por primera vez

31 de agosto de 2015

Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad

4 de septiembre de 2015

Publicado por primera vez (Estimar)

9 de septiembre de 2015

Actualizaciones de registros de estudio

Última actualización publicada (Actual)

12 de agosto de 2019

Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad

8 de agosto de 2019

Última verificación

1 de agosto de 2019

Más información

Términos relacionados con este estudio

Otros números de identificación del estudio

  • IRB201500286
  • 11712325 (Otro número de subvención/financiamiento: Department of Defense)
  • 12.420 (Otro número de subvención/financiamiento: Department of Defense)

Plan de datos de participantes individuales (IPD)

¿Planea compartir datos de participantes individuales (IPD)?

Indeciso

Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio

Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.

No

Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.

No

Esta información se obtuvo directamente del sitio web clinicaltrials.gov sin cambios. Si tiene alguna solicitud para cambiar, eliminar o actualizar los detalles de su estudio, comuníquese con register@clinicaltrials.gov. Tan pronto como se implemente un cambio en clinicaltrials.gov, también se actualizará automáticamente en nuestro sitio web. .

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