Orale metagenomiske biomarkører ved revmatoid artritt

Dette er en tverrfaglig forskningsstudie med fem etterforskere fra forskjellige, men komplementære, disipliner for å etablere dette nye samarbeidet. Det er et høyt translasjonspotensial for informasjon oppnådd fra dette prosjektet basert på samarbeid mellom en revmatolog, en tannlege, orale biologer og eksperter på infeksjonssykdommer med ekspertise innen immunologi, mikrobiologi og genomikk. Kort fortalt vil RA-deltakere rekrutteres av revmatologen. Totalt 100 deltakere skal rekrutteres til to grupper som skal studeres; en gruppe forsøkspersoner med RA og den andre gruppen vil være friske kontroller. Disse to gruppene vil bli delt inn i følgende grupper for deltakelse i studien: Gruppe 1: vil bestå av 25 RA voksne individer som ikke har blitt behandlet med biologiske legemidler som vil bli sammenlignet med 25 friske kontroller fra aldersmatchede medlemmer av samme husholdning . Gruppe 2 vil bestå av 25 RA voksne individer som reagerer på førstelinje anti-TNF-terapi som vil bli sammenlignet med 25 individer av samme alder og kjønn med RA som er resistente mot to eller flere TNF-antagonister. Deltakerne vil bli planlagt for et forskningsstudiebesøk ved University of Florida Dental Clinic Research Unit. Under eksamen vil følgende finne sted: det flerdimensjonale helsevurderingsspørreskjemaet (MDHAQ), tannundersøkelse, spyttoppsamling og tannplakk vil bli fjernet fra forskjellige tannoverflater for supragingival.

Den supragingival vil bli utsatt for dyp sekvensering i genomikklaboratoriet. For å teste to spesifikke mål: 1) teste hypotesen om at orale mikrobiomprofiler basert på 16S RNA-data er assosiert med utviklingen av RA eller med responsen på en spesifikk terapi, og 2) teste hypotesen om at de spesifikke genene, variantene og funksjonelle evner (metagenom) er assosiert med RA eller med terapeutisk respons. Etter fullføring av denne pilotstudien vil etterforskerne ha systematisk identifisert bakterielle biomarkører (f. arter, underarter, gener) som korrelerer med RA og kan tjene som potensielle mål for sykdomsbehandling. Disse markørene kan bli utviklet til nye medikamentmål for RA-behandling i fremtidige studier.