口腔微生物组和上呼吸消化道鳞状细胞癌
2017年10月5日 更新者：NYU Langone Health
人类口腔是一个多样化的栖息地，包含大约 700 种原核生物。
口腔微生物组由 44% 的已命名物种、12% 代表未命名物种的分离物和 44% 仅从基于 16S rRNA 的克隆研究 (http://www.homd.org/) 已知的种系型组成。
已鉴定出 11 个门的物种：厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门、放线菌门、螺旋体门、梭杆菌门、TM7、增效菌门、衣原体门、Chloroflexi 和 SR1 (http://www.homd.org/)。
由于这些观察主要基于传统 Sanger 测序产生的数据，因此很可能低估了口腔微生物组的多样性。
将高通量测序应用于口腔微生物组，类似于人类微生物组项目下其他身体部位（胃肠道、皮肤和阴道）的微生物组研究规模，对于获取了解微生物多样性和群落结构所必需的数据是必要的健康和疾病中的口腔微生物组。
研究概览
详细说明
前列腺癌、肺癌、结直肠癌和卵巢癌 (PLCO) 癌症筛查试验和美国癌症协会癌症预防研究 II (CPS-II) 的研究人员已经确定了 140 例 UADSCC 病例，这些病例通过发病率密度抽样进行了 3:1 频率匹配（420 例对照）用于研究（ACS.
PLCO)、性别、种族背景和年龄，10 年内。
研究类型
观察性的
注册 (实际的)
560
联系人和位置
本节提供了进行研究的人员的详细联系信息，以及有关进行该研究的地点的信息。
学习地点
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New York
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New York、New York、美国、10016
- New York University School of Medicine
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参与标准
研究人员寻找符合特定描述的人，称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。
资格标准
适合学习的年龄
40年 至 92年 (成人、OLDER_ADULT)
接受健康志愿者
是的
有资格学习的性别
全部
取样方法
非概率样本
研究人群
美国癌症协会癌症 (ACS) 预防研究 II 营养队列 (CPS-II) 成立于 1992 年；该队列包括来自美国 21 个州的 86,000 多名男性和 97,000 名女性，他们在 1992 年完成了邮寄问卷。 总共有 72 个 UADSCC 符合研究条件，并已完成知情同意和诊断前口腔清洗收集。
前列腺癌、肺癌、结肠癌和卵巢癌 (PLCO) 癌症筛查试验是一项针对大约 155,000 名男性和女性的随机对照试验。 参与者被随机分配到筛选或控制组。 总共有 68 个 UADSCC 符合研究条件，包括完成知情同意和诊断前口腔清洗收集。
描述
纳入标准：
- 诊断为上呼吸消化道鳞状细胞癌并登记于：
- 美国癌症协会癌症预防研究 II (CPS-II)
- 前列腺癌、肺癌、结直肠癌和卵巢癌 (PLCO) 癌症筛查试验。
学习计划
本节提供研究计划的详细信息，包括研究的设计方式和研究的衡量标准。
研究是如何设计的？
设计细节
队列和干预
团体/队列 |
干预/治疗 |
|---|---|
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上呼吸消化道鳞状细胞癌 (UADSCC) 病例
从 PLCO 和 ACS CPS II 中，确定了 140 个 UADSCC 病例。
这些病例通过研究的发病密度抽样（ACS。
PLCO),
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选择基于序列的方法是因为它通过考虑所分析样本之间 16S rRNA 基因序列的整体差异（遗传距离）对样本进行分类，不受分类法、序列长度甚至质量评分等人工细节的影响。
分类学方法是对基于序列的方法的补充，因为它将进一步识别特定的分类群或物种，以解释整体分析发现的差异。
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控件
从 PLCO 和 ACS CPS II，我们已经确定了 140 个 UADSCC 案例。
这些病例通过研究的发病密度抽样（ACS。
PLCO),
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选择基于序列的方法是因为它通过考虑所分析样本之间 16S rRNA 基因序列的整体差异（遗传距离）对样本进行分类，不受分类法、序列长度甚至质量评分等人工细节的影响。
分类学方法是对基于序列的方法的补充，因为它将进一步识别特定的分类群或物种，以解释整体分析发现的差异。
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研究衡量的是什么？
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
|---|---|---|
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用于微生物组表征的 16S rRNA 基因调查方法
大体时间：4年
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数据对齐和聚类以确定微生物组物种多样性
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4年
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合作者和调查者
在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。
研究记录日期
这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查，以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。
研究主要日期
学习开始 (实际的)
1992年12月1日
初级完成 (实际的)
2010年12月1日
研究完成 (实际的)
2010年12月1日
研究注册日期
首次提交
2017年10月3日
首先提交符合 QC 标准的
2017年10月3日
首次发布 (实际的)
2017年10月6日
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
2017年10月9日
上次提交的符合 QC 标准的更新
2017年10月5日
最后验证
2017年10月1日
更多信息
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