Suun mikrobiomi ja ylempi aerodigestive levyepiteelisyöpä
torstai 5. lokakuuta 2017 päivittänyt: NYU Langone Health
Ihmisen suuontelo on monipuolinen elinympäristö, jossa on noin 700 prokaryoottilajia.
Suun mikrobiomi koostuu 44 %:sta nimetyistä lajeista, 12 %:sta isolaateista, jotka edustavat nimeämättömiä lajeja, ja 44 %:sta fylotyyppejä, jotka tunnetaan vain 16S-rRNA-pohjaisista kloonaustutkimuksista (http://www.homd.org/).
Lajeja 11 fylasta on tunnistettu: Firmicutes, Bacteroidetes, Proteobacteria, Actinobacteria, Spirochaetes, Fusobacteria, TM7, Synergistetes, Chlamydiae, Chloroflexi ja SR1 (http://www.homd.org/).
Koska nämä havainnot ovat perustuneet pääasiassa perinteisestä Sanger-sekvensoinnista saatuun tietoon, suun mikrobiomin monimuotoisuus on erittäin todennäköisesti aliarvioitu.
Suuren suorituskyvyn sekvensoinnin soveltaminen suun mikrobiomiin, joka on samanlainen kuin ihmisen mikrobiomiprojektin yhteydessä tehdyt mikrobiomitutkimukset muissa kehon osissa (ruoansulatuskanava, iho ja emätin), on välttämätöntä, jotta saadaan tietoa, joka on olennaista ymmärtääkseen suun mikrobiomia ja yhteisörakennetta. suun mikrobiomi terveydessä ja sairauksissa.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Valmis
Ehdot
Yksityiskohtainen kuvaus
Eturauhasen, keuhkojen, kolorektaali- ja munasarjasyövän (PLCO) seulontatutkimus ja American Cancer Society Cancer Prevention Study II (CPS-II) -tutkijat ovat tunnistaneet 140 UADSCC-tapausta, joiden esiintymistiheysnäytteenottotaajuus on sovitettu 3:1 (420 kontrollia) opiskeluun (ACS.
PLCO), sukupuoli, etninen tausta ja ikä, 10 vuoden sisällä.
Opintotyyppi
Havainnollistava
Ilmoittautuminen (Todellinen)
560
Yhteystiedot ja paikat
Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.
Opiskelupaikat
-
-
New York
-
New York, New York, Yhdysvallat, 10016
- New York University School of Medicine
-
-
Osallistumiskriteerit
Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
40 vuotta - 92 vuotta (AIKUINEN, OLDER_ADULT)
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Joo
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Kaikki
Näytteenottomenetelmä
Ei-todennäköisyysnäyte
Tutkimusväestö
American Cancer Society Cancer (ACS) Prevention Study II Nutrition Cohort (CPS-II) perustettiin vuonna 1992; kohorttiin kuuluu yli 86 000 miestä ja 97 000 naista 21 Yhdysvaltain osavaltiosta, jotka täyttivät postitse lähetetyn kyselyn vuonna 1992. Kaiken kaikkiaan 72 UADSCC:tä oli kelvollinen tutkimukseen, jolle oli annettu tietoinen suostumus ja esidiagnostinen suuhuuhdekeräys.
Eturauhasen, keuhkojen, paksusuolen ja munasarjojen (PLCO) syövän seulontatutkimus on satunnaistettu kontrolloitu tutkimus, johon osallistui noin 155 000 miestä ja naista. Osallistujat satunnaistetaan joko seulonta- tai kontrolliryhmään. Yhteensä 68 UADSCC:tä oli kelvollinen tutkimukseen, mukaan lukien täytetty tietoinen suostumus ja esidiagnostinen suuhuuhtelu.
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Ylemmän aerodigestiivisen okasolusyövän diagnoosi ja rekisteröity:
- American Cancer Society Cancer Prevention Study II (CPS-II)
- Eturauhasen, keuhkojen, paksusuolen ja munasarjojen (PLCO) syövän seulontatutkimus.
Opintosuunnitelma
Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Ylempien aerodigestiivisten okasolusyöpien (UADSCC) tapaukset
PLCO:sta ja ACS CPS II:sta tunnistettiin 140 UADSCC-tapausta.
Nämä tapaukset on sovitettu frekvenssisuhteeseen 3:1 (420 kontrollia) ilmaantuvuustiheysnäytteenotolla tutkimusta varten (ACS.
PLCO),
|
Sekvenssipohjainen lähestymistapa valitaan, koska se luokittelee näytteet ottamalla huomioon koko eron (geneettinen etäisyys) 16S-rRNA-geenisekvensseissä analysoitujen näytteiden joukossa ilman puolueettomia keinotekoisia yksityiskohtia, kuten taksonomiat, sekvenssin pituus tai jopa laatupisteet.
Taksonominen lähestymistapa täydentää sekvenssipohjaista lähestymistapaa, koska se tunnistaa edelleen erityisiä taksonomisia ryhmiä tai lajeja, jotka voivat selittää yleisten analyysien perusteella havaitun eron.
|
|
Säätimet
PLCO:sta ja ACS CPS II:sta olemme tunnistaneet 140 UADSCC-tapausta.
Nämä tapaukset on sovitettu frekvenssisuhteeseen 3:1 (420 kontrollia) ilmaantuvuustiheysnäytteenotolla tutkimusta varten (ACS.
PLCO),
|
Sekvenssipohjainen lähestymistapa valitaan, koska se luokittelee näytteet ottamalla huomioon koko eron (geneettinen etäisyys) 16S-rRNA-geenisekvensseissä analysoitujen näytteiden joukossa ilman puolueettomia keinotekoisia yksityiskohtia, kuten taksonomiat, sekvenssin pituus tai jopa laatupisteet.
Taksonominen lähestymistapa täydentää sekvenssipohjaista lähestymistapaa, koska se tunnistaa edelleen erityisiä taksonomisia ryhmiä tai lajeja, jotka voivat selittää yleisten analyysien perusteella havaitun eron.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
16S rRNA -geenitutkimuksen lähestymistapa mikrobiomin karakterisointiin
Aikaikkuna: 4 Vuotta
|
Tietojen kohdistus ja klusterointi mikrobiomilajien monimuotoisuuden määrittämiseksi
|
4 Vuotta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.
Sponsori
Yhteistyökumppanit
Opintojen ennätyspäivät
Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan julkisella verkkosivustolla.
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (TODELLINEN)
Tiistai 1. joulukuuta 1992
Ensisijainen valmistuminen (TODELLINEN)
Keskiviikko 1. joulukuuta 2010
Opintojen valmistuminen (TODELLINEN)
Keskiviikko 1. joulukuuta 2010
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Tiistai 3. lokakuuta 2017
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Tiistai 3. lokakuuta 2017
Ensimmäinen Lähetetty (TODELLINEN)
Perjantai 6. lokakuuta 2017
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (TODELLINEN)
Maanantai 9. lokakuuta 2017
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Torstai 5. lokakuuta 2017
Viimeksi vahvistettu
Sunnuntai 1. lokakuuta 2017
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- 10-01834
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
EI
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Ei
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Ei
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .