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Le microbiome buccal et le cancer épidermoïde aérodigestif supérieur

5 octobre 2017 mis à jour par: NYU Langone Health
La cavité buccale humaine est un habitat diversifié qui contient environ 700 espèces procaryotes. Le microbiome oral est composé de 44 % d'espèces nommées, 12 % d'isolats représentant des espèces sans nom et 44 % de phylotypes connus uniquement à partir d'études de clonage basées sur l'ARNr 16S (http://www.homd.org/). Des espèces de 11 phyla ont été identifiées : Firmicutes, Bacteroidetes, Proteobacteria, Actinobacteria, Spirochaetes, Fusobacteria, TM7, Synergistetes, Chlamydiae, Chloroflexi et SR1 (http://www.homd.org/). Parce que ces observations ont été principalement basées sur des données générées à partir du séquençage Sanger traditionnel, la diversité du microbiome oral est très probablement sous-estimée. L'application d'un séquençage à haut débit au microbiome oral similaire à l'échelle des études sur le microbiome d'autres sites corporels (tractus gastro-intestinal, peau et vagin) dans le cadre du projet sur le microbiome humain est nécessaire pour obtenir des données essentielles à la compréhension de la diversité et de la structure communautaire du microbiote oral dans la santé et la maladie.

Aperçu de l'étude

Description détaillée

L'essai de dépistage du cancer de la prostate, du poumon, colorectal et de l'ovaire (PLCO) et les enquêteurs de l'American Cancer Society Cancer Prevention Study II (CPS-II) ont identifié 140 cas de l'UADSCC dont la fréquence a été appariée 3: 1 (420 témoins) par échantillonnage de la densité d'incidence pour étude (ACS. PLCO), sexe, origine ethnique et âge, dans les 10 ans.

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Réel)

560

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Lieux d'étude

    • New York
      • New York, New York, États-Unis, 10016
        • New York University School of Medicine

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

40 ans à 92 ans (ADULTE, OLDER_ADULT)

Accepte les volontaires sains

Oui

Sexes éligibles pour l'étude

Tout

Méthode d'échantillonnage

Échantillon non probabiliste

Population étudiée

L'American Cancer Society Cancer (ACS) Prevention Study II Nutrition Cohort (CPS-II) a été créée en 1992; la cohorte comprend plus de 86 000 hommes et 97 000 femmes de 21 États américains qui ont rempli un questionnaire par la poste en 1992. Au total, 72 UADSCC étaient éligibles pour l'étude, avec un consentement éclairé rempli et une collecte de lavage buccal prédiagnostique.

L'essai de dépistage du cancer de la prostate, du poumon, du côlon et de l'ovaire (PLCO) est un essai contrôlé randomisé d'environ 155 000 hommes et femmes. Les participants sont randomisés dans un bras de dépistage ou de contrôle. Au total, 68 UADSCC étaient éligibles pour l'étude, y compris le consentement éclairé rempli et la collecte de lavage buccal prédiagnostique.

La description

Critère d'intégration:

  • Diagnostic de cancer épidermoïde aérodigestif supérieur et enregistré dans :
  • L'étude II sur la prévention du cancer de l'American Cancer Society (CPS-II)
  • L'essai de dépistage du cancer de la prostate, du poumon, colorectal et de l'ovaire (PLCO).

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

Cohortes et interventions

Groupe / Cohorte
Intervention / Traitement
Cas de cancers épidermoïdes aérodigestifs supérieurs (UADSCC)
De PLCO et ACS CPS II, identifié 140 cas UADSCC. Ces cas sont appariés en fréquence 3: 1 (420 témoins) par échantillonnage de densité d'incidence pour l'étude (ACS. PLCO),
L'approche basée sur les séquences est sélectionnée car elle classe les échantillons en tenant compte de la différence totale (distance génétique) dans les séquences de gènes d'ARNr 16S parmi les échantillons analysés, sans biais par des détails artificiels tels que les taxonomies, la longueur de la séquence ou même les scores de qualité.
L'approche taxonomique est un complément à l'approche basée sur les séquences en ce sens qu'elle identifiera plus en détail des groupes taxonomiques ou des espèces spécifiques qui peuvent expliquer la différence trouvée par les analyses globales.
Contrôles
De PLCO et ACS CPS II, nous avons identifié 140 cas UADSCC. Ces cas sont appariés en fréquence 3: 1 (420 témoins) par échantillonnage de densité d'incidence pour l'étude (ACS. PLCO),
L'approche basée sur les séquences est sélectionnée car elle classe les échantillons en tenant compte de la différence totale (distance génétique) dans les séquences de gènes d'ARNr 16S parmi les échantillons analysés, sans biais par des détails artificiels tels que les taxonomies, la longueur de la séquence ou même les scores de qualité.
L'approche taxonomique est un complément à l'approche basée sur les séquences en ce sens qu'elle identifiera plus en détail des groupes taxonomiques ou des espèces spécifiques qui peuvent expliquer la différence trouvée par les analyses globales.

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Approche d'enquête sur les gènes de l'ARNr 16S pour la caractérisation du microbiome
Délai: 4 années
Alignement et regroupement des données pour déterminer la diversité des espèces du microbiome
4 années

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (RÉEL)

1 décembre 1992

Achèvement primaire (RÉEL)

1 décembre 2010

Achèvement de l'étude (RÉEL)

1 décembre 2010

Dates d'inscription aux études

Première soumission

3 octobre 2017

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

3 octobre 2017

Première publication (RÉEL)

6 octobre 2017

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (RÉEL)

9 octobre 2017

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

5 octobre 2017

Dernière vérification

1 octobre 2017

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Plan pour les données individuelles des participants (IPD)

Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?

NON

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Non

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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