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ThyroidPrint 的临床验证：用于诊断不确定甲状腺结节的基因表达特征

2017年10月24日 更新者：Hernán González、Pontificia Universidad Catolica de Chile
建议进行一项临床试验，以在美国人群中临床验证新基因检测 (ThyroidPrint) 的诊断性能。 它将通过细针穿刺 (FNA) 确定细胞学无法确定的甲状腺结节的性质。 不确定甲状腺结节的遗传分类器是一项确定一组 10 种生物标志物（CXCR3、CCR3、CXCl10、CK19、TIMP1、CLDN1、CAR、XB130、HO-1 和 CCR7）表达的测试。 基因表达数据通过一种算法进行分析，该算法生成一个预测恶性肿瘤风险的综合评分。 它的预期用途是用于甲状腺细胞学不确定的患者（Bethesda III 和 IV，根据用于报告甲状腺细胞病理学的 Bethesda 系统）。 该测试使用细针穿刺 (FNA) 样本。

研究概览

地位

未知

条件

干预/治疗

详细说明

甲状腺结节是一种非常常见的疾病，在成年人中的发病率高达 30-40%。 虽然大多数甲状腺结节几乎没有临床意义，但在许多情况下，将进行细针穿刺 (FNA) 活检以确定其性质。 在 70% 的病例中，FNA 将被报告为良性，而在 10% 的病例中，FNA 将被报告为癌症。 然而，其余 20% 的甲状腺结节病例将报告为不确定。 后者患者发生恶性肿瘤的风险在 15% 到 25% 之间，并且在大多数情况下，患者将接受甲状腺叶切除术或甲状腺全切除术以确定最终病理，导致不可接受的不必要手术数量。 这对健康有重大影响，包括手术风险和永久性激素补充，以及估计为 16 亿美元的不必要的健康成本。 因此，需要诊断工具以提高 FNA 的诊断准确性并避免不必要手术的高发生率。

GeneproDx 开发了一种基因表达特征，以提高报告为不确定的甲状腺结节的 FNA 活检的诊断准确性。 ThyroidPrint 诊断测量 FNA 样本中 10 个基因的表达。 它使用专有算法结合 10 种生物标志物的结果来预测良性甲状腺结节。 该测定被归类为多分析物算法测定 (MAAA)。

生物标志物包括在 Qiagen 的 Rotor-Gene Q MDx RT-PCR IVD 平台仪器上运行的多重 TaqMan® 基因表达测定，该仪器是 FDA 批准的仪器。 以下 10 个基因构成生物标志物组：CXCR3、CCR3、CXCL10、CK19、TIMP1、CLDN1、CAR、XB130、HO-1 和 CCR7。 每个基因在具有两个参考基因的多重配置中运行。 每次测定均在 FDA 批准的仪器上使用仅供研究使用 (RUO) 的试剂盒和试剂进行。

ThyroidPrint 是使用两个不同的样本队列开发的，一个训练集和一个测试集。 使用线性判别分析，训练集确定了最终的生物标志物组，包括： CXCR3、CCR3、CXCL10、CK19、TIMP1、CLDN1、CAR、XB130、HO-1 和 CCR7。 简而言之，生物标志物具有以下意义。 CCR3 和 CCR7 是在甲状腺乳头状癌肿瘤细胞中高表达的趋化因子受体。 CXCR3 也是一种趋化因子受体，与其受体 CXCL10 一起在甲状腺自身免疫性疾病中检测到。 CAR 是一种 G 偶联受体，已被证明与癌症有关，并且在甲状旁腺腺瘤中的表达降低。 CK19 是一种角蛋白，已用于甲状腺肿瘤以识别乳头状癌。 CLDN1 是一种结构蛋白，已被证明与正常组织相比在肿瘤中有差异表达，并且在甲状腺乳头状癌中增加了 mRNA 水平。 XB130 也是一种结构蛋白，其表达已在甲状腺乳头状癌中得到证实。 TIMP1 是一种蛋白酶抑制剂，其 mRNA 水平在甲状腺癌的晚期阶段升高。 HO-1 是一种加氧酶，其表达与甲状腺癌中的肿瘤侵袭性相关。 在最终的分类器中，每个基因的表达都根据其个体的相对分类能力进行加权。 在训练集中生成的 ROC 曲线中根据 92% 的最小灵敏度选择截止分数，以保证较高的阴性预测值 (>95%)。 该截止分数提供了 83% 的特异性。独立的样本测试集重现了在训练集中观察到的诊断性能，并在 FNA 样本中显示出一致的结果。 事实证明，该检测可准确预测甲状腺 FNA 样本中的良性结节，两个队列的阴性预测值为 96%，特异性为 83%。 MAAA 的最终验证需要一个最终验证集，它分析将在常规临床环境中使用的样本；在这种情况下，不确定的甲状腺结节样本。 此外，为了显示临床有效性，必须执行验证集，作为统计动力的多机构试验，以确保数据适用于广泛的人群范围并具有适当的置信区间。 智利目前正在进行第一项具有统计学意义的多机构试验，以证明临床有效性。 该试验包括 8 个站点，将招募约 3000 名 FNA，将于 2017 年 12 月完成。

研究类型

观察性的

注册 (预期的)

1500

联系人和位置

本节提供了进行研究的人员的详细联系信息，以及有关进行该研究的地点的信息。

学习地点

  • 美国
    • Alabama
      • Guntersville、Alabama、美国、35976
        • 招聘中
        • Avantt Research
        • 接触：
          • Dr. Nixon, MD
    • California
      • Palo Alto、California、美国、94305
        • 招聘中
        • Stanford University
        • 接触：
          • Chris Holsinger, MD
    • Florida
      • Tampa、Florida、美国
        • 招聘中
        • Lee Moffit Cancer Center
        • 接触：
          • Bryan McIver, MD, PhD
    • Louisiana
      • New Orleans、Louisiana、美国
        • 招聘中
        • Tulane University
        • 接触：
          • Emad Kandil, MD
    • Ohio
      • Cincinnati、Ohio、美国、45220
        • 招聘中
        • Universidad de Cincinnati
        • 接触：
          • Davis Stewart, MD
    • Texas
      • Houston、Texas、美国、77030
        • 招聘中
        • University of Texas MD Anderson Cancer Center
        • 接触：
          • Mark Zafareo, MD

参与标准

研究人员寻找符合特定描述的人，称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。

资格标准

适合学习的年龄

18年 及以上 (成人、年长者)

接受健康志愿者

不

有资格学习的性别

全部

取样方法

非概率样本

研究人群

邀请主治医师推荐接受细针穿刺 (FNA) 细胞学评估的甲状腺结节患者参加试验。 在进行 FNA 时，将收集额外的样本进行分子检测。 只有结果不确定的患者（Bethesda III 和 IV）将继续参加试验。

描述

纳入标准：

  1. 接受甲状腺结节 FNA 的患者。
  2. 甲状腺结节大于1cm
  3. 年龄大于18岁。

排除标准：

  1. 甲状腺结节大于1cm
  2. 18岁以下患者，
  3. 凝血障碍和患者的既往病史。
  4. 恶性颈淋巴结肿大的超声证据。

学习计划

本节提供研究计划的详细信息，包括研究的设计方式和研究的衡量标准。

研究是如何设计的？

设计细节

  • 观测模型：队列
  • 时间观点：预期

研究衡量的是什么？

主要结果指标

结果测量
措施说明
大体时间
能够预测良性甲状腺结节。
大体时间：24个月
这将由阴性预测值决定
24个月
预测恶性甲状腺结节的能力。
大体时间：24个月
这将由阳性预测值决定
24个月
测试的灵敏度
大体时间：24个月
真正例数
24个月
测试的特异性
大体时间：24个月
真阴性病例数
24个月

合作者和调查者

在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。

赞助

Pontificia Universidad Catolica de Chile

合作者

Geneprodx

调查人员

  • 首席研究员：Mark Zafareo, MD、M.D. Anderson Cancer Center

出版物和有用的链接

负责输入研究信息的人员自愿提供这些出版物。这些可能与研究有关。

一般刊物

研究记录日期

这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查，以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。

研究主要日期

学习开始 (实际的)

2016年3月1日

初级完成 (预期的)

2018年3月30日

研究完成 (预期的)

2018年6月30日

研究注册日期

首次提交

2017年10月1日

首先提交符合 QC 标准的

2017年10月12日

首次发布 (实际的)

2017年10月13日

研究记录更新

最后更新发布 (实际的)

2017年10月26日

上次提交的符合 QC 标准的更新

2017年10月24日

最后验证

2017年10月1日

更多信息

与本研究相关的术语

关键字

其他相关的 MeSH 术语

其他研究编号

  • GPDX-001

计划个人参与者数据 (IPD)

计划共享个人参与者数据 (IPD)？

不

药物和器械信息、研究文件

研究美国 FDA 监管的药品

不

研究美国 FDA 监管的设备产品

不

在美国制造并从美国出口的产品

不

此信息直接从 clinicaltrials.gov 网站检索，没有任何更改。如果您有任何更改、删除或更新研究详细信息的请求，请联系 register@clinicaltrials.gov. clinicaltrials.gov 上实施更改，我们的网站上也会自动更新.

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