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ThyroidPrint의 임상 검증: 불확정 갑상선 결절 진단을 위한 유전자 발현 시그니처

2017년 10월 24일 업데이트: Hernán González, Pontificia Universidad Catolica de Chile
미국 인구에서 새로운 유전자 검사(ThyroidPrint)의 진단 성능을 임상적으로 검증하기 위한 임상 시험이 제안되었습니다. 미세 바늘 흡인(FNA)을 통해 세포학에 의해 불확실한 것으로 알려진 갑상선 결절의 특성을 결정합니다. 불확실한 갑상선 결절에 대한 유전적 분류자는 10개의 바이오마커 패널(CXCR3, CCR3, CXCl10, CK19, TIMP1, CLDN1, CAR, XB130, HO-1 및 CCR7)의 발현을 결정하는 검사입니다. 유전자 발현 데이터는 악성 위험도를 예측하는 복합 점수를 생성하는 알고리즘을 통해 분석됩니다. 의도된 용도는 갑상선 세포학이 불확실한 환자를 위한 것입니다(Bethesda III 및 IV, The Bethesda System for Reporting Thyroid Cytopathology에 따름). 이 테스트는 FNA(Fine Needle Aspiration) 샘플을 사용합니다.

연구 개요

상태

알려지지 않은

정황

개입 / 치료

상세 설명

갑상선 결절은 성인 인구의 30-40%에 이르는 매우 흔한 질환입니다. 대부분의 갑상선 결절은 임상적 의미가 거의 없지만, 많은 경우에 미세 바늘 흡인(FNA) 생검을 수행하여 그 특성을 확인합니다. 사례의 70%에서 FNA는 양성으로 보고되고 사례의 10%에서 암으로 보고됩니다. 그러나 나머지 20%의 경우 갑상선 결절은 불확실한 것으로 보고됩니다. 후자의 환자는 15~25%의 악성 위험이 있으며, 대부분의 경우 환자는 최종 병리를 결정하기 위해 갑상선 폐엽 절제술 또는 전체 갑상선 절제술을 시행하게 되므로 용납할 수 없을 정도로 많은 불필요한 수술이 발생합니다. 이것은 외과적 위험과 영구적인 호르몬 보충뿐만 아니라 16억 달러로 추산되는 부당한 건강 비용을 포함하여 건강에 중대한 영향을 미칩니다. 따라서 FNA의 진단 정확도를 높이고 불필요한 수술의 높은 비율을 피하기 위한 진단 도구가 필요합니다.

GeneproDx는 불확실한 것으로 보고된 갑상선 결절의 FNA 생검의 진단 정확도를 향상시키기 위해 유전자 발현 시그니처를 개발했습니다. ThyroidPrint 진단은 FNA 샘플에서 10개 유전자의 발현을 측정합니다. 그것은 양성 갑상선 결절을 예측하기 위해 독점적인 알고리즘을 사용하여 10개의 바이오마커의 결과를 결합합니다. 이 분석은 다중 분석 알고리즘 분석(MAAA)으로 분류됩니다.

바이오마커는 FDA 승인 기기인 Qiagen의 Rotor-Gene Q MDx RT-PCR IVD 플랫폼 기기에서 실행되는 멀티플렉스 TaqMan® 유전자 발현 분석으로 구성됩니다. 다음 10개의 유전자가 바이오마커 패널을 구성합니다: CXCR3, CCR3, CXCL10, CK19, TIMP1, CLDN1, CAR, XB130, HO-1 및 CCR7. 각 유전자는 2개의 참조 유전자와 함께 멀티플렉스 구성으로 실행됩니다. 각 분석은 FDA 승인 기기에서 연구 전용(RUO) 키트 및 시약을 사용하여 수행됩니다.

ThyroidPrint는 훈련 세트와 테스트 세트라는 두 가지 샘플 코호트를 사용하여 개발되었습니다. 선형 판별 분석을 사용하여 교육 세트는 다음을 포함하는 최종 바이오마커 패널을 식별했습니다. CXCR3, CCR3, CXCL10, CK19, TIMP1, CLDN1, CAR, XB130, HO-1 및 CCR7. 간단히 말해서 바이오마커는 다음과 같은 의미를 갖는다. CCR3 및 CCR7은 유두상 갑상선암 종양 세포에서 높게 발현되는 케모카인 수용체입니다. CXCR3은 또한 케모카인 수용체이며 수용체인 CXCL10과 함께 갑상선 자가면역 질환에서 검출됩니다. CAR은 G-커플 수용체이며 암에 관여하는 것으로 나타났으며 부갑상선 선종에서 발현이 감소했습니다. CK19는 케라틴이며 유두상 암종을 인식하기 위해 갑상선 종양에 사용되었습니다. CLDN1은 구조 단백질이며 정상 조직과 비교하여 종양에서 차별적으로 발현되는 것으로 나타났으며 유두상 갑상선 암종에서 mRNA 수준이 증가했습니다. XB130은 또한 구조 단백질이며 그 발현은 유두상 갑상선 암종에서 입증되었습니다. TIMP1은 갑상선암의 진행 단계에서 mRNA 수준이 증가하는 프로테아제 억제제입니다. HO-1은 옥시게나제이며 그 발현은 갑상선암의 종양 공격성과 관련이 있습니다. 최종 분류기에서 각 유전자의 발현은 개별적인 상대적인 분류 능력을 기준으로 "가중"되었습니다. 컷오프 점수는 높은 음수 예측 값(>95%)을 보장하기 위해 92%의 최소 민감도를 기반으로 훈련 세트에서 생성된 ROC 곡선에서 선택되었습니다. 이 컷오프 점수는 83%의 특이성을 제공했습니다. 샘플의 독립적인 테스트 세트는 훈련 세트에서 관찰된 진단 성능을 재현했으며 FNA 샘플에서 일관된 결과를 보여주었습니다. 이 분석은 두 코호트에서 96%의 음성 예측 값과 83%의 특이성으로 갑상선 FNA 샘플에서 양성 결절을 정확하게 예측하는 것으로 입증되었습니다. MAAA의 최종 검증에는 일상적인 임상 환경에서 사용될 샘플을 분석하는 최종 검증 세트가 필요합니다. 이 경우 불확실한 갑상선 결절 샘플. 또한 임상적 타당성을 보여주기 위해 데이터가 광범위한 인구 스펙트럼에 적용 가능하고 적절한 신뢰 구간을 가지고 있음을 보장하기 위해 통계적으로 강화된 다중 기관 시험으로 검증 세트를 수행해야 합니다. 임상 타당성을 입증하기 위해 통계적으로 강화된 최초의 다중 기관 시험이 현재 칠레에서 진행 중입니다. 이 시험에는 8개 사이트가 포함되며 2017년 12월까지 완료될 약 3000명의 FNA를 모집할 것입니다.

연구 유형

관찰

등록 (예상)

1500

연락처 및 위치

이 섹션에서는 연구를 수행하는 사람들의 연락처 정보와 이 연구가 수행되는 장소에 대한 정보를 제공합니다.

연구 장소

  • 미국
    • Alabama
      • Guntersville, Alabama, 미국, 35976
        • 모병
        • Avantt Research
        • 연락하다:
          • Dr. Nixon, MD
    • California
      • Palo Alto, California, 미국, 94305
        • 모병
        • Stanford University
        • 연락하다:
          • Chris Holsinger, MD
    • Florida
      • Tampa, Florida, 미국
        • 모병
        • Lee Moffit Cancer Center
        • 연락하다:
          • Bryan McIver, MD, PhD
    • Louisiana
      • New Orleans, Louisiana, 미국
        • 모병
        • Tulane University
        • 연락하다:
          • Emad Kandil, MD
    • Ohio
      • Cincinnati, Ohio, 미국, 45220
        • 모병
        • Universidad de Cincinnati
        • 연락하다:
          • Davis Stewart, MD
    • Texas
      • Houston, Texas, 미국, 77030
        • 모병
        • University of Texas MD Anderson Cancer Center
        • 연락하다:
          • Mark Zafareo, MD

참여기준

연구원은 적격성 기준이라는 특정 설명에 맞는 사람을 찾습니다. 이러한 기준의 몇 가지 예는 개인의 일반적인 건강 상태 또는 이전 치료입니다.

자격 기준

공부할 수 있는 나이

18년 이상 (성인, 고령자)

건강한 자원 봉사자를 받아들입니다

아니

연구 대상 성별

모두

샘플링 방법

비확률 샘플

연구 인구

주치의가 미세 바늘 흡인(FNA) 세포학 평가를 받을 것을 권장하는 갑상선 결절이 있는 환자를 시험에 참여하도록 초대합니다. FNA 시 분자 테스트를 위해 추가 샘플을 수집합니다. 결과가 불확실한 환자(Bethesda III 및 IV)만 임상시험을 계속합니다.

설명

포함 기준:

  1. 갑상선 결절의 FNA를 받는 환자.
  2. 갑상선 결절 1cm 이상
  3. 18세 이상.

제외 기준:

  1. 갑상선 결절 1cm 이상
  2. 18세 미만의 환자,
  3. 응고 장애 및 환자의 이전 병력.
  4. 악성 자궁 경부 선종증의 초음파 증거.

공부 계획

이 섹션에서는 연구 설계 방법과 연구가 측정하는 내용을 포함하여 연구 계획에 대한 세부 정보를 제공합니다.

연구는 어떻게 설계됩니까?

디자인 세부사항

  • 관찰 모델: 보병대
  • 시간 관점: 유망한

연구는 무엇을 측정합니까?

주요 결과 측정

결과 측정
측정값 설명
기간
양성 갑상선 결절을 예측하는 능력.
기간: 24개월
이는 음의 예측 값에 의해 결정됩니다.
24개월
악성 갑상선 결절을 예측하는 능력.
기간: 24개월
이는 양의 예측 값에 의해 결정됩니다.
24개월
시험의 감도
기간: 24개월
진정한 긍정 사례의 수
24개월
테스트의 특이성
기간: 24개월
참음성 사례의 수
24개월

공동 작업자 및 조사자

여기에서 이 연구와 관련된 사람과 조직을 찾을 수 있습니다.

스폰서

Pontificia Universidad Catolica de Chile

협력자

Geneprodx

수사관

  • 수석 연구원: Mark Zafareo, MD, M.D. Anderson Cancer Center

간행물 및 유용한 링크

연구에 대한 정보 입력을 담당하는 사람이 자발적으로 이러한 간행물을 제공합니다. 이것은 연구와 관련된 모든 것에 관한 것일 수 있습니다.

일반 간행물

연구 기록 날짜

이 날짜는 ClinicalTrials.gov에 대한 연구 기록 및 요약 결과 제출의 진행 상황을 추적합니다. 연구 기록 및 보고된 결과는 공개 웹사이트에 게시되기 전에 특정 품질 관리 기준을 충족하는지 확인하기 위해 국립 의학 도서관(NLM)에서 검토합니다.

연구 주요 날짜

연구 시작 (실제)

2016년 3월 1일

기본 완료 (예상)

2018년 3월 30일

연구 완료 (예상)

2018년 6월 30일

연구 등록 날짜

최초 제출

2017년 10월 1일

QC 기준을 충족하는 최초 제출

2017년 10월 12일

처음 게시됨 (실제)

2017년 10월 13일

연구 기록 업데이트

마지막 업데이트 게시됨 (실제)

2017년 10월 26일

QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출

2017년 10월 24일

마지막으로 확인됨

2017년 10월 1일

추가 정보

이 연구와 관련된 용어

키워드

추가 관련 MeSH 약관

기타 연구 ID 번호

  • GPDX-001

개별 참가자 데이터(IPD) 계획

개별 참가자 데이터(IPD)를 공유할 계획입니까?

아니

약물 및 장치 정보, 연구 문서

미국 FDA 규제 의약품 연구

아니

미국 FDA 규제 기기 제품 연구

아니

미국에서 제조되어 미국에서 수출되는 제품

아니

이 정보는 변경 없이 clinicaltrials.gov 웹사이트에서 직접 가져온 것입니다. 귀하의 연구 세부 정보를 변경, 제거 또는 업데이트하도록 요청하는 경우 register@clinicaltrials.gov. 문의하십시오. 변경 사항이 clinicaltrials.gov에 구현되는 즉시 저희 웹사이트에도 자동으로 업데이트됩니다. .

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