DNMT 和 HDAC 基因 SNP 对骨髓增生异常综合征地西他滨治疗反应的临床相关性

本研究将包括在选择接受地西他滨治疗的 MDS 患者中签署受试者知情同意书的患者（第 I 部分），以及另外 140 名 MDS 患者作为历史对照（第 II 部分）。 在第 I 部分研究中，大约将包括 68 名满足以下纳入和排除标准的患者。

在开始地西他滨治疗之前，将对 MDS 患者进行外周血 DNA 的前瞻性收集。 我们将根据 DNMT 或 HDAC 基因单核苷酸多态性，根据以下参数评估地西他滨治疗的疗效：1) 血液学反应 (HR) 或改善 (HI)，或达到 HR 或 HI 所需的地西他滨剂量，2) 完全 (CR) ) 或部分反应 (PR)，或达到 CR 或 PR 所需的地西他滨剂量，以及 3) MDS 复发或进展的时间。

根据制造商的说明（www.sequenom.com； Sequenom 公司，美国加利福尼亚州圣地亚哥）。 根据赫尔辛基声明获取全血样本。 将使用 Puregene DNA 纯化试剂盒（Gentra Systems Inc, Minneapolis, MN, USA）提取 DNA。 SNP 的检测将通过使用基于 Sequenom 芯片的基质辅助激光解吸/电离飞行时间 (MALDI-TOF) 质谱平台分析先前扩增的基因组 DNA 产生的引物延伸产物来进行。 将使用 SpectroDesigner 软件 (Sequenom) 设计多重 SNP 测定。 96 个孔板中每孔含有 2.5 ng DNA，将按照 Sequenom 的规格通过 PCR 进行扩增。 PCR 产物中未掺入的核苷酸将使用虾碱性磷酸酶灭活。 将通过向每个孔中添加延伸引物、DNA聚合酶和三磷酸脱氧核苷酸和三磷酸二脱氧核苷酸的混合物来进行等位基因鉴别反应。 MassExtend 清洁树脂 (Sequenom) 将添加到混合物中，以去除可能干扰 MALDI-TOF 分析的外来盐分。 然后将引物延伸产物清洗并点样到 SpectroChip 上。 基因型将通过将每个样品的等分试样点样到 384 SpectroChip (Sequenom) 上来确定，随后由 MALDI-TOF 质谱仪读取。

除非另有说明，否则所有统计测试将是双侧的，显着性水平设置为 0.05。 统计数据将使用 SAS 9.1 版（SAS Institute，Cary NC，USA）获得。 以下是研究的终点。

1. 主要终点评估数据

   • 响应率：将获得一个响应率，并通过卡方检验估计其置信区间。 如果必须控制可能影响最终评价的主要终点，则进行分层分析（Cochran-Mantel-Haenzel等）。 如果必须控制所有受试者的特征终点，将使用逻辑回归模型进行分析。

2. 次要终点评估数据

   • 总生存期：通过Kaplan-Meier方法评估从登记日到死亡的生存期。
   • 无进展生存期：：从 MDS 进展到 AML 和任何原因死亡的时间。 将通过Kaplan-Meier方法分析无进展生存期。