A DNMT és a HDAC gén SNP klinikai jelentősége a mielodiszpláziás szindróma decitabin-terápiára adott válaszában
A DNS metiltranszferáz és hiszton deacetiláz gén egynukleotid polimorfizmusának klinikai jelentősége mielodiszplasztikus szindrómában
A közelmúltban végzett vizsgálatok kimutatták, hogy a DNMT gén polimorfizmusai hozzájárulhatnak az interindividuális variánsokhoz a DNMT expressziójában. Ennek megfelelően feltételeztük, hogy a DNMT és a HDAC gének SNP-i előre jelezhetik a decitabin terápia kimenetelét a mielodiszpláziás szindróma esetében. Az MDS-ben szenvedő betegeknél a decitabin-terápia megkezdése előtt a perifériás vérből jövő DNS-gyűjtést végeznek. A decitabin terápia hatékonyságát a DNMT vagy HDAC gén SNP-k alapján a következő paraméterek alapján értékeljük: 1) hematolotikus válasz (HR) vagy javulás (HI), vagy decitabin dózis szükségessége a HR vagy HI eléréséhez, 2) teljes (CR) ) vagy részleges válasz (PR), vagy decitabin dózisának szükségessége a CR vagy PR eléréséhez, és 3) az MDS visszaeséséig vagy progressziójáig eltelt idő.
Ennek a vizsgálatnak a célja 1) genotípusok meghatározása a decitabin-kezelésben részesülő MDS-betegek DNS-mintáiból, 2) a klinikai eredmények (HR, HI, CR, PR vagy a leukémiáig való progresszióig eltelt idő) összefüggésének meghatározása a decitabin-kezelést követően DNMT-vel. vagy HDAC genotípusok, és 3) a citogenetikai kockázat hatásának elemzése a válaszre vagy a leukémiás evolúcióra az MDS decitabin-terápiáját követően.
A tanulmány áttekintése
Állapot
Körülmények
Részletes leírás
Ez a vizsgálat magában foglalja azokat a betegeket, akik aláírták az alany tájékozott beleegyező nyilatkozatát azon MDS-ben szenvedő betegek közül, akiket választottak decitabin-kezelésre (I. rész), valamint további 140 MDS-beteget történelmi kontrollként (II. rész). Körülbelül 68 olyan beteget vonnak be az I. részbeni vizsgálatba, akik megfelelnek a következő felvételi és kizárási kritériumoknak.
Az MDS-ben szenvedő betegeknél a decitabin-terápia megkezdése előtt a perifériás vérből jövő DNS-gyűjtést végeznek. A decitabin terápia hatékonyságát a DNMT vagy HDAC gén SNP-k alapján a következő paraméterek alapján értékeljük: 1) hematolotikus válasz (HR) vagy javulás (HI), vagy decitabin dózis szükségessége a HR vagy HI eléréséhez, 2) teljes (CR) ) vagy részleges válasz (PR), vagy decitabin dózisának szükségessége a CR vagy PR eléréséhez, és 3) az MDS visszaeséséig vagy progressziójáig eltelt idő.
A genotipizálás a Sequenom® iPLEX platform™ használatával történik, a gyártó utasításainak megfelelően (www.sequenom.com; Sequenom Inc, San Diego, CA, USA). A teljes vérmintákat Helsinki nyilatkozata szerint veszik. A DNS-t a Puregene DNS purification Kit (Gentra Systems Inc, Minneapolis, MN, USA) segítségével extraháljuk. Az SNP-k kimutatását a korábban amplifikált genomiális DNS-ből előállított primer kiterjesztési termékek analízisével végezzük egy Sequenom chip-alapú mátrix-asszisztált lézer deszorpciós / ionizációs repülési idő (MALDI-TOF) tömegspektrometriás platform segítségével. A multiplex SNP vizsgálatokat SpectroDesigner szoftverrel (Sequenom) tervezik. 96 lyukú lemezeket, amelyek mindegyik lyukban 2,5 ng DNS-t tartalmaznak, PCR-rel amplifikáljuk a Sequenom specifikációi szerint. A PCR-termékben nem beépült nukleotidokat a garnélarák alkalikus foszfatáza segítségével deaktiválják. Az allél megkülönböztetési reakciókat úgy hajtják végre, hogy az extenziós primer(eke)t, a DNS-polimerázt és a dezoxinukleotid-trifoszfátok és di-dezoxinukleotid-trifoszfátok koktélkeverékét minden lyukba adják. MassExtend tiszta gyantát (Sequenom) adunk a keverékhez, hogy eltávolítsuk az idegen sókat, amelyek megzavarhatják a MALDI-TOF analízist. Az alapozó hosszabbító termékeket ezután megtisztítják, és egy SpectroChipre helyezik. A genotípusokat úgy határozzuk meg, hogy minden mintából egy alikvotot 384 SpectroChip-re (Sequenom) helyezünk, amelyet ezt követően a MALDI-TOF tömegspektrométer olvas le.
Minden statisztikai teszt kétoldali, a szignifikanciaszint 0,05, hacsak másként nem jelezzük. A statisztikai adatokat a SAS 9.1-es verziójával nyerjük (SAS Institute, Cary NC, USA). Az alábbiakban a vizsgálat végpontjait ismertetjük.
Elsődleges végpont értékelési adatok
• Válaszadási arány: A rendszer megkapja a válaszadási arányt, és ennek konfidenciaintervallumát khi-négyzet teszttel kiértékeli. Ha ellenőrizni kell azokat a fő végpontokat, amelyek befolyásolhatják a végső értékelést, réteganalízist kell végezni (Cochran-Mantel-Haenzel stb.). Ha az alanyok összes jellemző végpontját ellenőrizni kell, akkor a logisztikus regressziós modellt használjuk az elemzéshez.
Másodlagos végpont értékelési adatok
- Teljes túlélés: a túlélést a regisztráció napjától a halálig Kaplan-Meier módszerrel értékelik.
- Progressziómentes túlélés: Az MDS-ből AML-be történő progresszió és bármilyen okból bekövetkezett halálozás ideje. A progressziómentes túlélést Kaplan-Meier módszerrel elemezzük.
Tanulmány típusa
Beiratkozás (Várható)
Kapcsolatok és helyek
Tanulmányi helyek
-
-
-
Seoul, Koreai Köztársaság, 135-710
- Samsung Medical Center
-
-
Részvételi kritériumok
Jogosultsági kritériumok
Tanulmányozható életkorok
Egészséges önkénteseket fogad
Tanulmányozható nemek
Mintavételi módszer
Tanulmányi populáció
Leírás
Bevételi kritériumok:
Decitabin kezelési csoport
- Férfi és nő 18 éves vagy idősebb.
- Azok a betegek, akiknél (elsődleges vagy másodlagos) MDS-t diagnosztizáltak
- ≥ Int-1 IPSS-pontszámmal rendelkező betegek
- Legalább 1 cikluson át Decitabine-nal kezelt betegek.
- Aláírt és dátummal ellátott, tájékozott beleegyezés a vérmintából származó genomiális DNS felhasználásával végzett genetikai vizsgálat megkezdése előtt.
Történelmi kontrollcsoport
- Férfi és nő 18 éves vagy idősebb.
- Azok a betegek, akiknél (elsődleges vagy másodlagos) MDS-t diagnosztizáltak
Kizárási kritériumok:
- Akut mielogén leukémiával (AML, 20%-ot meghaladó csontvelői őssejtszám) vagy más progresszív rosszindulatú betegséggel diagnosztizált betegek.
- Krónikus myelomonocytás leukémia (CMML) vagy MDS/MPD diagnózisa kizárt.
Tanulási terv
Hogyan készül a tanulmány?
Tervezési részletek
Kohorszok és beavatkozások
Csoport / Kohorsz |
|---|
|
Decitabin terápia
A betegeket legalább 1 cikluson át decitabinnal kezelik
|
|
nem decitabin terápia
A betegeket MDS-ben diagnosztizálják, és nem kezelik őket decitabin-terápiával
|
Mit mér a tanulmány?
Elsődleges eredményintézkedések
Eredménymérő |
Időkeret |
|---|---|
|
Általános válaszadási arány
Időkeret: 18 hónap
|
18 hónap
|
Másodlagos eredményintézkedések
Eredménymérő |
Időkeret |
|---|---|
|
A progresszió vagy a hematológiai javulás ideje
Időkeret: 18 hónap
|
18 hónap
|
Együttműködők és nyomozók
Szponzor
Tanulmányi rekorddátumok
Tanulmány főbb dátumok
Tanulmány kezdete
Elsődleges befejezés (TÉNYLEGES)
A tanulmány befejezése (TÉNYLEGES)
Tanulmányi regisztráció dátumai
Először benyújtva
Először nyújtották be, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
Első közzététel (TÉNYLEGES)
Tanulmányi rekordok frissítései
Utolsó frissítés közzétéve (TÉNYLEGES)
Az utolsó frissítés elküldve, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
Utolsó ellenőrzés
Több információ
A tanulmányhoz kapcsolódó kifejezések
Kulcsszavak
További vonatkozó MeSH feltételek
Egyéb vizsgálati azonosító számok
- 2009-04-012
Ezt az információt közvetlenül a clinicaltrials.gov webhelyről szereztük be, változtatás nélkül. Ha bármilyen kérése van vizsgálati adatainak módosítására, eltávolítására vagy frissítésére, kérjük, írjon a következő címre: register@clinicaltrials.gov. Amint a változás bevezetésre kerül a clinicaltrials.gov oldalon, ez a webhelyünkön is automatikusan frissül. .