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골수이형성증후군에 대한 데시타빈 치료 반응에 대한 DNMT 및 HDAC 유전자 SNP의 임상적 관련성

2020년 8월 11일 업데이트: Samsung Medical Center

골수이형성증후군에서 DNA Methyltransferase와 Histone Deacetylase 유전자 단일염기 다형성의 임상적 관련성

최근 조사에 따르면 DNMT 유전자 다형성이 DNMT 발현의 개체 간 변이에 기여할 수 있음이 입증되었습니다. 따라서 우리는 DNMT 및 HDAC 유전자 SNP가 골수이형성 증후군에 대한 데시타빈 요법의 결과를 예측할 수 있다는 가설을 세웠습니다. 데시타빈 요법을 시작하기 전에 MDS 환자에서 말초혈액에서 DNA를 전향적으로 수집할 것입니다. 다음 매개변수와 관련하여 DNMT 또는 HDAC 유전자 SNP에 따른 데시타빈 요법의 효능을 평가할 것입니다: 1) 조혈 반응(HR) 또는 개선(HI), 또는 HR 또는 HI를 달성하기 위한 데시타빈 용량 요구 사항, 2) 완전(CR) ) 또는 부분 반응(PR), 또는 CR 또는 PR을 달성하기 위한 데시타빈 용량의 요건, 및 3) MDS의 재발 또는 진행까지의 시간.

이 연구의 목적은 1) Decitabine 요법을 받는 MDS 환자의 DNA 샘플에서 유전자형을 결정하고, 2) DNMT를 사용한 decitabine 요법 후 임상 결과(HR, HI, CR, PR 또는 백혈병 진행 시간)의 연관성을 결정하는 것입니다. 또는 HDAC 유전자형, 및 3) MDS에 대한 데시타빈 요법 후 반응 또는 백혈병 진화에 대한 세포유전학적 위험의 영향을 분석하기 위해.

연구 개요

상태

완전한

정황

골수 형성 이상 증후군

상세 설명

이 연구에는 Decitabine으로 치료하기로 선택한 MDS 환자(파트 I)와 과거 대조군으로 추가 140명의 MDS 환자(파트 II) 중 피험자 사전 동의서에 서명한 환자가 포함됩니다. 파트 I 연구에서 다음 포함 및 제외 기준을 충족하는 약 68명의 환자가 포함될 것입니다.

데시타빈 요법을 시작하기 전에 MDS 환자에서 말초혈액에서 DNA를 전향적으로 수집할 것입니다. 다음 매개변수와 관련하여 DNMT 또는 HDAC 유전자 SNP에 따른 데시타빈 요법의 효능을 평가할 것입니다: 1) 조혈 반응(HR) 또는 개선(HI), 또는 HR 또는 HI를 달성하기 위한 데시타빈 용량 요구 사항, 2) 완전(CR) ) 또는 부분 반응(PR), 또는 CR 또는 PR을 달성하기 위한 데시타빈 용량의 요건, 및 3) MDS의 재발 또는 진행까지의 시간.

Genotyping은 제조업체의 지침(www.sequenom.com; Sequenom Inc, 샌디에고, 캘리포니아, 미국). 헬싱키 선언에 따라 전혈 샘플을 채취합니다. DNA는 Puregene DNA 정제 키트(Gentra Systems Inc, Minneapolis, MN, USA)를 사용하여 추출됩니다. SNP의 검출은 Sequenom 칩 기반 매트릭스 보조 레이저 탈착/이온화 비행 시간(MALDI-TOF) 질량 분석 플랫폼을 사용하여 이전에 증폭된 게놈 DNA로부터 생성된 프라이머 연장 산물의 분석에 의해 수행될 것입니다. 다중 SNP 분석은 SpectroDesigner 소프트웨어(Sequenom)를 사용하여 설계됩니다. 각 웰에 2.5ng DNA를 포함하는 96개의 웰 플레이트는 Sequenom의 사양에 따라 PCR로 증폭됩니다. PCR 산물에 통합되지 않은 뉴클레오티드는 새우 알칼리성 포스파타제를 사용하여 비활성화됩니다. 대립유전자 식별 반응은 확장 프라이머(들), DNA 폴리머라제, 데옥시뉴클레오티드 트리포스페이트와 디-데옥시뉴클레오티드 트리포스페이트의 칵테일 혼합물을 각 웰에 추가하여 수행됩니다. MassExtend 깨끗한 수지(Sequenom)를 혼합물에 추가하여 MALDI-TOF 분석을 방해할 수 있는 외부 염을 제거합니다. 그런 다음 프라이머 확장 제품을 세척하고 SpectroChip에 점적합니다. 유전자형은 각 샘플의 분취량을 384 SpectroChip(Sequenom)에 스포팅하여 결정되며, 이후 MALDI-TOF 질량 분석기로 판독됩니다.

달리 명시되지 않는 한 모든 통계 테스트는 유의 수준이 0.05로 설정된 양면 테스트입니다. 통계 데이터는 SAS 버전 9.1(SAS Institute, Cary NC, USA)을 사용하여 얻을 것이다. 다음은 연구의 끝점입니다.

기본 엔드포인트 평가 데이터
• 응답률: 카이제곱 검정을 통해 응답률을 구하고 그 신뢰구간을 추정한다. 최종 평가에 영향을 미칠 수 있는 주요 평가변수를 통제해야 하는 경우 층화 분석(Cochran-Mantel-Haenzel 등)을 실시합니다. 모든 피험자의 특징적인 끝점을 제어해야 하는 경우 로지스틱 회귀 모델을 분석에 사용합니다.
보조 엔드포인트 평가 데이터
- 전체 생존: Kaplan-Meier 방법을 통해 등록일부터 사망까지 생존을 평가합니다.
- 무진행 생존: MDS에서 AML로의 진행 및 모든 원인으로 인한 사망 시간. 무진행생존기간은 Kaplan-Meier 방법으로 분석한다.

연구 유형

관찰

등록 (예상)

연락처 및 위치

이 섹션에서는 연구를 수행하는 사람들의 연락처 정보와 이 연구가 수행되는 장소에 대한 정보를 제공합니다.

연구 장소

대한민국
- - Seoul, 대한민국, 135-710
    - Samsung Medical Center

참여기준

연구원은 적격성 기준이라는 특정 설명에 맞는 사람을 찾습니다. 이러한 기준의 몇 가지 예는 개인의 일반적인 건강 상태 또는 이전 치료입니다.

자격 기준

공부할 수 있는 나이

18년 이상 (성인, OLDER_ADULT)

건강한 자원 봉사자를 받아들입니다

아니

연구 대상 성별

모두

샘플링 방법

비확률 샘플

연구 인구

이 연구에는 데시타빈으로 치료하기로 선택된 MDS 환자 중 피험자 사전 동의서에 서명한 환자와 역사적 대조군으로 추가 MDS 환자가 포함됩니다.

설명

포함 기준:
1. 데시타빈 치료군
  - 18세 이상 남녀.
  - (1차 또는 2차) MDS 진단을 받은 환자
  - IPSS 점수가 Int-1 이상인 환자
  - 데시타빈으로 최소 1주기 치료를 받은 환자.
  - 혈액 샘플에서 추출한 게놈 DNA를 사용하여 유전자 연구를 시작하기 전에 사전 동의서에 서명하고 날짜를 기재했습니다.
2. 과거 대조군
  - 18세 이상 남녀.
  - (1차 또는 2차) MDS 진단을 받은 환자
제외 기준:
- 급성골수성백혈병(AML, 골수줄기세포수가 20%를 초과) 또는 기타 진행성 악성질환으로 진단받은 환자.
- 만성 골수단구성 백혈병(CMML) 또는 MDS/MPD 진단은 제외됩니다.

공부 계획

이 섹션에서는 연구 설계 방법과 연구가 측정하는 내용을 포함하여 연구 계획에 대한 세부 정보를 제공합니다.

연구는 어떻게 설계됩니까?

디자인 세부사항

그룹/코호트 수

코호트 및 개입

그룹/코호트
데시타빈 요법 환자는 데시타빈으로 최소 1주기 치료를 받습니다.
비데시타빈 요법 환자는 MDS로 진단되고 데시타빈 요법으로 치료되지 않습니다.

연구는 무엇을 측정합니까?

주요 결과 측정

결과 측정	기간
전체 응답률 기간: 18개월	18개월

2차 결과 측정

결과 측정	기간
진행 또는 혈액학적 개선까지의 시간 기간: 18개월	18개월

공동 작업자 및 조사자

여기에서 이 연구와 관련된 사람과 조직을 찾을 수 있습니다.

스폰서

Samsung Medical Center

연구 기록 날짜

이 날짜는 ClinicalTrials.gov에 대한 연구 기록 및 요약 결과 제출의 진행 상황을 추적합니다. 연구 기록 및 보고된 결과는 공개 웹사이트에 게시되기 전에 특정 품질 관리 기준을 충족하는지 확인하기 위해 국립 의학 도서관(NLM)에서 검토합니다.

연구 주요 날짜

연구 시작

2009년 9월 1일

기본 완료 (실제)

2010년 10월 1일

연구 완료 (실제)

2010년 11월 1일

연구 등록 날짜

최초 제출

2010년 6월 2일

QC 기준을 충족하는 최초 제출

2020년 8월 11일

처음 게시됨 (실제)

2020년 8월 17일

연구 기록 업데이트

마지막 업데이트 게시됨 (실제)

2020년 8월 17일

QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출