Эта страница была переведена автоматически, точность перевода не гарантируется. Пожалуйста, обратитесь к английской версии для исходного текста.

Клиническая значимость SNP генов DNMT и HDAC в ответ на терапию децитабином при миелодиспластическом синдроме

11 августа 2020 г. обновлено: Samsung Medical Center

Клиническая значимость однонуклеотидного полиморфизма генов ДНК-метилтрансферазы и гистондеацетилазы при миелодиспластическом синдроме

Недавние исследования показали, что полиморфизмы гена DNMT могут вносить вклад в межиндивидуальные варианты экспрессии DNMT. Соответственно, мы предположили, что SNP генов DNMT и HDAC могут предсказать результаты терапии децитабином при миелодиспластическом синдроме. Проспективный сбор ДНК из периферической крови будет проводиться у пациентов с МДС до начала терапии децитабином. Мы будем оценивать эффективность терапии децитабином в соответствии с SNP гена DNMT или HDAC с точки зрения следующих параметров: 1) гематолитический ответ (HR) или улучшение (HI), или потребность в дозе децитабина для достижения HR или HI, 2) полный (CR ) или частичный ответ (PR), или потребность в дозе децитабина для достижения CR или PR, и 3) время до рецидива или прогрессирования МДС.

Целью данного исследования является 1) определение генотипов из образцов ДНК пациентов с МДС, получающих терапию децитабином, 2) определение ассоциации клинических исходов (HR, HI, CR, PR или время до прогрессирования до лейкемии) после терапии децитабином с DNMT. или генотипы HDAC, и 3) для анализа влияния цитогенетического риска на ответ или эволюцию лейкемии после терапии децитабином по поводу МДС.

Обзор исследования

Статус

Завершенный

Условия

Миелодиспластический синдром

Подробное описание

В это исследование будут включены пациенты, подписавшие форму информированного согласия среди пациентов с МДС, которые были выбраны для лечения децитабином (часть I), а также дополнительные 140 пациентов с МДС в качестве исторического контроля (часть II). Приблизительно 68 пациентов будут включены в исследование первой части, которые удовлетворяют следующим критериям включения и исключения.

Проспективный сбор ДНК из периферической крови будет проводиться у пациентов с МДС до начала терапии децитабином. Мы будем оценивать эффективность терапии децитабином в соответствии с SNP гена DNMT или HDAC с точки зрения следующих параметров: 1) гематолитический ответ (HR) или улучшение (HI), или потребность в дозе децитабина для достижения HR или HI, 2) полный (CR ) или частичный ответ (PR), или потребность в дозе децитабина для достижения CR или PR, и 3) время до рецидива или прогрессирования МДС.

Генотипирование будет проводиться с использованием платформы Sequenom® iPLEX™ в соответствии с инструкциями производителя (www.sequenom.com; Sequenom Inc, Сан-Диего, Калифорния, США). Образцы цельной крови будут получены в соответствии с Хельсинкской декларацией. ДНК будет извлечена с использованием набора для очистки ДНК Puregen (Gentra Systems Inc, Миннеаполис, Миннесота, США). Обнаружение SNP будет выполняться путем анализа продуктов удлинения праймеров, полученных из ранее амплифицированной геномной ДНК, с использованием платформы масс-спектрометрии с лазерной десорбцией / ионизацией на основе матрицы Sequenom на основе времени пролета (MALDI-TOF). Мультиплексные анализы SNP будут разработаны с использованием программного обеспечения SpectroDesigner (Sequenom). Планшеты с 96 лунками, содержащие 2,5 нг ДНК в каждой лунке, будут амплифицировать с помощью ПЦР в соответствии со спецификациями Sequenom. Невключенные нуклеотиды в продукте ПЦР будут деактивированы с помощью щелочной фосфатазы креветок. Реакции различения аллелей будут проводиться путем добавления в каждую лунку праймера (праймеров) удлинения, ДНК-полимеразы и коктейля из дезоксинуклеотидтрифосфатов и ди-дезоксинуклеотидтрифосфатов. В смесь будет добавлена чистая смола MassExtend (Sequenom) для удаления посторонних солей, которые могут помешать анализу MALDI-TOF. Затем продукты для наращивания праймера будут очищены и нанесены на SpectroChip. Генотипы будут определяться путем нанесения аликвоты каждого образца на 384 SpectroChip (Sequenom), который затем считывается масс-спектрометром MALDI-TOF.

Все статистические тесты будут двусторонними с уровнем значимости 0,05, если не указано иное. Статистические данные будут получены с использованием SAS версии 9.1 (Институт SAS, Кэри, Северная Каролина, США). Ниже приведены конечные точки исследования.

Данные оценки первичной конечной точки
• Частота ответов: Будет получена частота ответов, и ее доверительный интервал оценивается с помощью критерия хи-квадрат. Если необходимо контролировать основные конечные точки, которые могут повлиять на окончательную оценку, будет проведен стратифицированный анализ (Кокран-Мантел-Хенцель и т. д.). Если необходимо контролировать все характерные конечные точки субъектов, для анализа будет использоваться модель логистической регрессии.
Вторичные данные оценки конечной точки
- Общая выживаемость: выживаемость будет оцениваться с момента регистрации до смерти по методу Каплана-Мейера.
- Выживаемость без прогрессирования: : Время прогрессирования от МДС до ОМЛ и смерти от любой причины. Выживаемость без прогрессирования будет проанализирована с помощью метода Каплана-Мейера.

Тип исследования

Наблюдательный

Регистрация (Ожидаемый)

Контакты и местонахождение

В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.

Места учебы

Корея, Республика
- - Seoul, Корея, Республика, 135-710
    - Samsung Medical Center

Критерии участия

Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.

Критерии приемлемости

Возраст, подходящий для обучения

18 лет и старше (ВЗРОСЛЫЙ, OLDER_ADULT)

Принимает здоровых добровольцев

Нет

Полы, имеющие право на обучение

Все

Метод выборки

Невероятностная выборка

Исследуемая популяция

Это исследование будет включать пациентов, подписавших форму информированного согласия, среди пациентов с МДС, которые были выбраны для лечения децитабином, а также дополнительных пациентов с МДС в качестве исторического контроля.

Описание

Критерии включения:
1. Группа лечения децитабином
  - Мужчина и женщина от 18 лет и старше.
  - Пациенты с диагнозом (первичный или вторичный) МДС
  - Пациенты с оценкой IPSS ≥ Int-1
  - Пациенты, получавшие децитабин не менее 1 цикла.
  - Подписанное и датированное информированное согласие до начала генетического исследования с использованием геномной ДНК, полученной из образца крови.
2. Историческая контрольная группа
  - Мужчина и женщина от 18 лет и старше.
  - Пациенты с диагнозом (первичный или вторичный) МДС
Критерий исключения:
- Пациенты с диагнозом острый миелогенный лейкоз (ОМЛ, количество стволовых клеток костного мозга более 20%) или другие прогрессирующие злокачественные заболевания.
- Диагноз хронического миеломоноцитарного лейкоза (ХММЛ) или МДС/МПЗ исключен.

Учебный план

В этом разделе представлена подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.

Как устроено исследование?

Детали дизайна

Количество групп / когорт

Когорты и вмешательства

Группа / когорта
Децитабиновая терапия Пациенты получают децитабин не менее 1 цикла.
недецитабиновая терапия Пациенты с диагнозом МДС не получают лечения децитабином.

Что измеряет исследование?

Первичные показатели результатов

Мера результата	Временное ограничение
Общая скорость отклика Временное ограничение: 18 месяцев	18 месяцев

Вторичные показатели результатов

Мера результата	Временное ограничение
Время до прогрессирования или гематологического улучшения Временное ограничение: 18 месяцев	18 месяцев

Соавторы и исследователи

Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.

Спонсор

Samsung Medical Center

Даты записи исследования

Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.

Изучение основных дат

Начало исследования

1 сентября 2009 г.

Первичное завершение (ДЕЙСТВИТЕЛЬНЫЙ)

1 октября 2010 г.

Завершение исследования (ДЕЙСТВИТЕЛЬНЫЙ)

1 ноября 2010 г.

Даты регистрации исследования

Первый отправленный

2 июня 2010 г.

Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества

11 августа 2020 г.

Первый опубликованный (ДЕЙСТВИТЕЛЬНЫЙ)

17 августа 2020 г.

Обновления учебных записей

Последнее опубликованное обновление (ДЕЙСТВИТЕЛЬНЫЙ)