细胞因子、转录组和 miRNA 在 2019 年冠状病毒病 (COVID-19) 埃及患者中的差异表达
2020年10月10日 更新者：Mohammed Ali Ahmed Eid、Tanta University
埃及社区 COVID-19 感染背景下细胞因子、转录组和 miRNA 的差异表达研究
这项工作的目的是研究感染 COVID-19 的埃及患者的宿主-病原体相互作用。
研究人员将对受感染患者和健康患者进行全基因组 miRNA 和转录组筛查，以进行比较。
所有类型的细胞因子在免疫中都发挥着关键作用，包括对不同病毒感染的反应。
因此，研究人员将研究响应该感染的细胞因子谱。
通过比较 miRNA 和转录组筛选以及细胞因子谱，可能会发现一种重要的分子，它可能在抑制 COVID-19 爆发中发挥作用。
此外，这些信息将帮助我们了解免疫过程并了解参与针对 COVID-19 的免疫反应的基因，重点是细胞因子的表达。
研究概览
详细说明
冠状病毒是导致哺乳动物和鸟类疾病的一组病毒。
在人类中，冠状病毒引起的呼吸道感染可能是轻微的，例如普通感冒，也可能是致命的，例如严重急性呼吸系统综合症 (SARS)、（中东呼吸系统综合症）MERS 和 COVID- 19.
它们包含一个正义的单链 RNA 基因组。
基因组大小范围从大约 27 到 34 千碱基。
它有一个 5' 甲基化帽“5' 前导，UTR”、复制/转录酶、刺突 (S) 蛋白、包膜 (E) 蛋白、膜 (M) 蛋白、核衣壳 (N) 蛋白、3' 非翻译区 (3 'UTR) 和聚 (A) 尾巴，分别。
S 蛋白通过诱导中和抗体和 T 细胞反应，在感染 SARS 冠状病毒 (SARS-CoV) 期间引发保护性免疫方面发挥重要作用。
它也是冠状病毒基因组中突变最多的部分。
这项工作的目的是研究感染 COVID-19 的埃及患者的宿主-病原体相互作用。
研究人员将对受感染患者和健康患者进行全基因组 miRNA 和转录组筛查，以进行比较。
所有类型的细胞因子在免疫中都发挥着关键作用，包括对不同病毒感染的反应。
因此，研究人员将研究响应该感染的细胞因子谱。
通过比较 miRNA 和转录组筛选以及细胞因子谱，可以鉴定出一种重要的分子，它可能在抑制 COVID-19 爆发中发挥作用。
此外，这些信息将帮助我们了解免疫过程并了解参与针对 COVID-19 的免疫反应的基因，重点是细胞因子的表达。
研究类型
观察性的
注册 (预期的)
40
联系人和位置
本节提供了进行研究的人员的详细联系信息，以及有关进行该研究的地点的信息。
学习地点
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El Gharbia
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Tanta、El Gharbia、埃及、31527
- 招聘中
- Tanta University Hospital
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接触：
- Mohammed Hanteera, Professor
- 电话号码：+201141146700
- 邮箱：mohamed.hantera@med.tanta.edu.eg
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Gharbia
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Tanta、Gharbia、埃及、31527
- 完全的
- Center of Excellence in Cancer Research, Tanta University Hospital.
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参与标准
研究人员寻找符合特定描述的人，称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。
资格标准
适合学习的年龄
18年 至 80年 (成人、年长者)
接受健康志愿者
是的
有资格学习的性别
全部
取样方法
非概率样本
研究人群
将进行生物信息学和统计分析，以与健康对照相比，区分重度和轻度 COVID-19 患者的实际基因表达、miRNA 表达和细胞因子风暴概况。
描述
纳入标准：
- 该项目将考虑确诊的 COVID-19 患者和 18 岁以上的患者。
排除标准：
- 患有以上一种以上慢性疾病的患者；糖尿病、高血压、心脏病、肝病二、三级除外。
学习计划
本节提供研究计划的详细信息，包括研究的设计方式和研究的衡量标准。
研究是如何设计的？
设计细节
队列和干预
团体/队列 |
干预/治疗 |
|---|---|
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COVID-19 严重症状
症状严重的患者需要吸氧和通气。
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全血细胞计数 (CBC)、白细胞差异、D-二聚体、C-反应蛋白、聚合酶链反应 (PCR) 测试、铁蛋白水平、细胞因子概况、转录组分析、miRNA 分析。
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COVID-19 轻微症状
有中度症状的患者，如正常的流感症状。
他们不需要氧气或通风
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全血细胞计数 (CBC)、白细胞差异、D-二聚体、C-反应蛋白、聚合酶链反应 (PCR) 测试、铁蛋白水平、细胞因子概况、转录组分析、miRNA 分析。
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控制健康
没有任何感染或症状的健康组。
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全血细胞计数 (CBC)、白细胞差异、D-二聚体、C-反应蛋白、聚合酶链反应 (PCR) 测试、铁蛋白水平、细胞因子概况、转录组分析、miRNA 分析。
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研究衡量的是什么？
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
|---|---|---|
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差异基因表达谱。
大体时间：3个月
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研究人员将使用 Affymetrix® 微阵列技术分析 15 名严重至 15 名中度 COVID-19 患者与 10 名健康患者之间的总基因表达谱。
整个转录组的微阵列原始数据将被提取和处理以使用不同的软件包进行分析（约 25000 个基因），以剖析与临床数据相关的差异表达；例如（CBC、D-二聚体值、铁蛋白值……等）。
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3个月
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差异 miRNA 表达谱。
大体时间：3个月
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研究人员将使用 Affymetrix® 微阵列技术分析 15 名重度和 15 名中度 COVID-19 患者与 10 名健康患者之间的总 miRNA 表达谱。
整个 miRNA 表达的微阵列原始数据将被提取和处理，以使用不同的软件包进行分析，以剖析与临床数据相关的差异表达；例如（CBC、D-二聚体值、铁蛋白值……等）。
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3个月
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多重细胞因子测定
大体时间：3个月
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该测定将在患者的血浆上进行。
研究人员将使用 xMAP（多分析物分析）技术和 Luminex 200 分析 15 名严重和 15 名中度 COVID-19 患者与 10 名健康患者之间的不同细胞因子概况。
获得的数据将使用统计软件进行分析，以研究所选参与者之间的不同概况。
获得的数据也将与临床数据相关联；例如（CBC、D-二聚体值、铁蛋白值……等）。
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3个月
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合作者和调查者
在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。
调查人员
- 首席研究员：Mohammed Eid, Doctor、Botany and Microbiology Department, Faculty of Science, Tanta University Tanta
研究记录日期
这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查，以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。
研究主要日期
学习开始 (实际的)
2020年10月4日
初级完成 (预期的)
2021年10月3日
研究完成 (预期的)
2022年10月3日
研究注册日期
首次提交
2020年10月7日
首先提交符合 QC 标准的
2020年10月8日
首次发布 (实际的)
2020年10月12日
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
2020年10月14日
上次提交的符合 QC 标准的更新
2020年10月10日
最后验证
2020年10月1日
更多信息
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