Denne siden ble automatisk oversatt og nøyaktigheten av oversettelsen er ikke garantert. Vennligst referer til engelsk versjon for en kildetekst.

Differensiell uttrykk for cytokiner, transkriptom og miRNA i koronavirussykdom 2019 (COVID-19) egyptiske pasienter

10. oktober 2020 oppdatert av: Mohammed Ali Ahmed Eid, Tanta University

Studier om det differensielle uttrykket av cytokiner, transkriptomer og miRNA i sammenheng med COVID-19-infeksjon i det egyptiske samfunnet

Målet med denne innsatsen er å studere vert-patogen-interaksjon hos egyptiske pasienter infisert med COVID-19. Etterforskerne vil utføre genomomfattende miRNA- og transkriptomskjermer hos de infiserte pasientene sammen med friske for sammenligning. Alle typer cytokiner spiller sentrale roller i immunitet, inkludert responsene på forskjellige virusinfeksjoner. Derfor vil etterforskerne studere cytokinprofilen som svar på den infeksjonen. Ved å sammenligne miRNA- og transkriptomskjermer sammen med cytokinprofiler, kan et viktig molekyl identifiseres som kan spille en rolle i hemmingen av COVID-19-utbruddet. I tillegg vil denne informasjonen hjelpe oss med å bli bevisst på immunprosessen og vite om genene som er involvert i immunresponsen mot COVID-19 med vekt på ekspresjonen av cytokiner.

Studieoversikt

Status

Ukjent

Forhold

Intervensjon / Behandling

Detaljert beskrivelse

Koronavirus er en gruppe virus som forårsaker sykdommer hos pattedyr og fugler. Hos mennesker forårsaker koronavirus luftveisinfeksjoner som kan være milde, for eksempel noen tilfeller av forkjølelse, og andre som kan være dødelige, for eksempel alvorlig akutt respiratorisk syndrom (SARS), (midtøsten luftveissyndrom) MERS og COVID- 19. De inneholder et enkeltstrenget RNA-genom med positiv sans. Genomstørrelsen varierer fra omtrent 27 til 34 kilobaser. Den har en 5' metylert cap "5'leader, UTR", replikaer/transkriptaseenzym, spike (S) protein, konvolutt (E) protein, membran (M) protein, nukleokapsid (N) protein, 3'utranslatert region (3) 'UTR), og en poly (A) hale, henholdsvis. S-proteinet har en viktig rolle i å fremkalle den beskyttende immuniteten under infeksjon med SARS-koronavirus (SARS-CoV) ved å indusere nøytraliserende antistoffer og T-celleresponser. Det er også den mest muterte delen av koronavirusgenomet. Målet med denne innsatsen er å studere vert-patogen-interaksjon hos egyptiske pasienter infisert med COVID-19. Etterforskerne vil utføre genomomfattende miRNA- og transkriptomskjermer hos de infiserte pasientene sammen med friske for sammenligning. Alle typer cytokiner spiller sentrale roller i immunitet, inkludert responsene på forskjellige virusinfeksjoner. Derfor vil etterforskerne studere cytokinprofilen som svar på den infeksjonen. Ved å sammenligne miRNA- og transkriptomskjermer sammen med cytokinprofiler, kan et viktig molekyl identifiseres, som kan spille en rolle i hemmingen av COVID-19-utbruddet. I tillegg vil denne informasjonen hjelpe oss med å bli bevisst på immunprosessen og vite om genene som er involvert i immunresponsen mot COVID-19 med vekt på ekspresjonen av cytokiner.

Studietype

Observasjonsmessig

Registrering (Forventet)

40

Kontakter og plasseringer

Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.

Studiesteder

  • Egypt
    • El Gharbia
      • Tanta, El Gharbia, Egypt, 31527
    • Gharbia
      • Tanta, Gharbia, Egypt, 31527
        • Fullført
        • Center of Excellence in Cancer Research, Tanta University Hospital.

Deltakelseskriterier

Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.

Kvalifikasjonskriterier

Alder som er kvalifisert for studier

18 år til 80 år (Voksen, Eldre voksen)

Tar imot friske frivillige

Ja

Kjønn som er kvalifisert for studier

Alle

Prøvetakingsmetode

Ikke-sannsynlighetsprøve

Studiepopulasjon

Bioinformatikk og statistiske analyser vil bli gjort for å differensiere det faktiske genuttrykket, miRNA-uttrykket og cytokinstormprofilen mellom alvorlige og milde COVID-19-pasienter sammenlignet med helsekontroll.

Beskrivelse

Inklusjonskriterier:

  • Bekreftede COVID-19-pasienter og pasienter over 18 år vil bli vurdert i dette prosjektet.

Ekskluderingskriterier:

  • Pasienter med mer enn én av disse kroniske sykdommene; diabetes mellitus, hypertensjon, hjertesykdommer og leversykdommer grad 2 og 3 vil bli ekskludert.

Studieplan

Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.

Hvordan er studiet utformet?

Designdetaljer

Kohorter og intervensjoner

Gruppe / Kohort
Intervensjon / Behandling
COVID-19 Alvorlige symptomer
Pasienter med alvorlige symptomer trenger oksygen og ventilasjon.
Genetisk: Diagnostikk- og vurderingstester for COVID-19
Komplett blodtelling (CBC), differensielle leukocytter, D-dimer, C-reaktivt protein, polymerasekjedereaksjon (PCR) test, ferritinnivå, cytokinprofil, transkriptomanalyse, miRNA-analyse.
COVID-19 Milde symptomer
Pasienter med moderate symptomer, som vanlige influensasymptomer. De trenger ikke oksygen eller ventilasjon
Genetisk: Diagnostikk- og vurderingstester for COVID-19
Komplett blodtelling (CBC), differensielle leukocytter, D-dimer, C-reaktivt protein, polymerasekjedereaksjon (PCR) test, ferritinnivå, cytokinprofil, transkriptomanalyse, miRNA-analyse.
Kontroll Sunn
Frisk gruppe uten infeksjon eller symptomer.
Genetisk: Diagnostikk- og vurderingstester for COVID-19
Komplett blodtelling (CBC), differensielle leukocytter, D-dimer, C-reaktivt protein, polymerasekjedereaksjon (PCR) test, ferritinnivå, cytokinprofil, transkriptomanalyse, miRNA-analyse.

Hva måler studien?

Primære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Differensiell genekspresjonsprofil.
Tidsramme: 3 måneder
Etterforskerne vil analysere den totale genekspresjonsprofilen mellom 15 og 15 moderate COVID-19 pasienter sammenlignet med 10 helsepasienter ved å bruke Affymetrix® Microarray Technology. Mikroarray-rådata for hele transkriptomer vil bli ekstrahert og behandlet for analyse (ca. 25000 gener) ved bruk av forskjellige programvarepakker for å dissekere de differensielle uttrykkene som vil bli korrelert til de kliniske dataene; for eksempel (CBC, D-dimerverdi, ferritinverdi…..osv.).
3 måneder
Differensiell miRNA-ekspresjonsprofil.
Tidsramme: 3 måneder
Etterforskerne vil analysere den totale miRNA-ekspresjonsprofilen mellom 15 og 15 moderate COVID-19-pasienter sammenlignet med 10 helsepasienter ved å bruke Affymetrix® Microarray-teknologi. Mikroarray-rådata for hele miRNA-uttrykk vil bli ekstrahert og behandlet for analyse ved hjelp av forskjellige programvarepakker for å dissekere de differensielle uttrykkene som vil bli korrelert til de kliniske dataene; for eksempel (CBC, D-dimerverdi, ferritinverdi…..osv.).
3 måneder
Multipleks cytokinanalyse
Tidsramme: 3 måneder
Denne analysen vil bli utført på plasma fra pasienter. Etterforskerne vil analysere den forskjellige cytokinprofilen mellom 15 alvorlige og 15 moderate COVID-19 pasienter sammenlignet med 10 helsepasienter ved å bruke xMAP (Multi-Analyte Profiling) teknologi og Luminex 200. De innhentede dataene vil bli analysert ved hjelp av statistisk programvare for å studere de forskjellige profilene mellom de utvalgte deltakerne. De innhentede dataene vil også være korrelert til de kliniske dataene; for eksempel (CBC, D-dimerverdi, ferritinverdi…..osv.).
3 måneder

Samarbeidspartnere og etterforskere

Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.

Sponsor

Tanta University

Etterforskere

  • Hovedetterforsker: Mohammed Eid, Doctor, Botany and Microbiology Department, Faculty of Science, Tanta University Tanta

Studierekorddatoer

Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.

Studer hoveddatoer

Studiestart (Faktiske)

4. oktober 2020

Primær fullføring (Forventet)

3. oktober 2021

Studiet fullført (Forventet)

3. oktober 2022

Datoer for studieregistrering

Først innsendt

7. oktober 2020

Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene

8. oktober 2020

Først lagt ut (Faktiske)

12. oktober 2020

Oppdateringer av studieposter

Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)

14. oktober 2020

Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene

10. oktober 2020

Sist bekreftet

1. oktober 2020

Mer informasjon

Begreper knyttet til denne studien

Nøkkelord

Ytterligere relevante MeSH-vilkår

Andre studie-ID-numre

  • CTM_COVID-19

Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter

Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt

Nei

Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt

Nei

Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .

Abonnere